| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_002947 | 1,515,811 | (33-bp)2→1 | pseudogene (715‑747/1851 nt) | PP_1325 ← | putative lipoprotein |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_002947 | 1515769 | 1515801 | 33 | 422 [0] | [0] 422 | PP_1325 | putative lipoprotein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1515802 = | 0 (0.000) | 283 (1.050) | 122/204 | 0.1 | 100% | pseudogene (756/1851 nt) | PP_1325 | putative lipoprotein |
| ? | NC_002947 | = 1515768 | 0 (0.000) | pseudogene (790/1851 nt) | PP_1325 | putative lipoprotein | |||||
Only 100 of 422 total aligned reads displayed.
GCGAGCCGATGCGTGAGCTGTCGAACACCTGTACCGCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATCTTGGTCAGCGGCTGGCTGGCCAGCTCCTTGAGCTTGGTCAGCGGCTGGCTGGCCAGCTCCTTGAGCTTGGTCAGGGCCAGCGGCAGTTGCTGGGCGGCAGGGTGGTCCGGGTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCT > NC_002947/1515621‑1515917 | gCGAGCCGATGCGTGAGCTGTCGAACACCTGTACCGCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATct < 1:6600209‑M2/150‑3 (MQ=255) cGAGCCGATGCGTGAGCTGTCGAACACCTGTACCGCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATctt < 1:2021548‑M2/150‑4 (MQ=255) aTGCGTGAGCTGTCGAACACCTGTACCGCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagc < 2:567520‑M2/150‑11 (MQ=255) gCGTGAGCTGTCGAACACCTGTACCGCAGGCACTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcgg > 1:7435295‑M2/1‑138 (MQ=255) aGCTGTCGAACACCTGTACCGCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggc > 1:5721502‑M2/1‑133 (MQ=255) aGCTGTCGAACACCTGTACCGCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagc > 1:3222391‑M2/1‑133 (MQ=255) gCTGTCGAACACCTGTACCGCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggct > 1:69719‑M2/1‑132 (MQ=255) tGTCGAACACCTGTACCGCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCCGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctgg < 2:6574309‑M2/150‑21 (MQ=255) tCGAACACCTGTACCGCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggcc < 2:1911702‑M2/150‑23 (MQ=255) tGTACCGCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttg < 1:8524831‑M2/150‑32 (MQ=255) tGTACCGCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttg < 1:586792‑M2/150‑32 (MQ=255) tGTACCGCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttg > 1:5659915‑M2/1‑119 (MQ=255) tGTACCGCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttg < 2:3499094‑M2/150‑32 (MQ=255) 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gCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttg < 1:7622097‑M2/150‑38 (MQ=255) gCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttg > 2:3063772‑M2/1‑113 (MQ=255) gCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttg < 1:2143027‑M2/150‑38 (MQ=255) gCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttg > 1:263783‑M2/1‑113 (MQ=255) aGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggt > 1:1987639‑M2/1‑111 (MQ=255) 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tggcCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagc > 2:6020504‑M2/1‑101 (MQ=255) tggcCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagc < 2:7266769‑M2/150‑50 (MQ=255) tggcCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagc > 2:6921141‑M2/1‑101 (MQ=255) gcCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcgg < 2:6502911‑M2/150‑52 (MQ=255) gcCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcgg < 1:812225‑M2/150‑52 (MQ=255) 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gcgcAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgaccca > 2:1153234‑M2/1‑57 (MQ=255) cAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgct < 1:1428223‑M2/113‑60 (MQ=255) aGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagg > 1:315405‑M2/1‑53 (MQ=255) gggCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggctt > 2:2728049‑M2/1‑52 (MQ=255) ggCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttc < 2:4727668‑M2/150‑100 (MQ=255) cgcgGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcga < 1:3352054‑M2/150‑102 (MQ=255) cgcgGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcga > 1:7389527‑M2/1‑49 (MQ=255) tACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgc < 1:7102760‑M2/150‑109 (MQ=255) tACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgc < 1:167588‑M2/150‑109 (MQ=255) tACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgc < 1:8407194‑M2/150‑109 (MQ=255) acCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttg < 2:382839‑M2/150‑112 (MQ=255) acCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttg < 2:2515219‑M2/150‑112 (MQ=255) cGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtg > 2:2295439‑M2/1‑37 (MQ=255) ggCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctg < 1:8260084‑M2/150‑115 (MQ=255) cAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtgagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctg > 2:8407194‑M2/1‑33 (MQ=255) cGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctc > 2:3339769‑M2/1‑30 (MQ=255) ccTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctccagg > 1:6057415‑M2/1‑26 (MQ=255) cTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctccaggg < 1:5336444‑M2/150‑126 (MQ=255) cTGAGGCAGCAGCAGGGTGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctccagggtgcc > 1:2750821‑M2/1‑21 (MQ=255) gAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctccagggtgccgg < 1:5058609‑M2/150‑132 (MQ=255) gAGGCAGCAGCAGGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctccagggtgccgg < 1:2970030‑M2/150‑132 (MQ=255) agcagGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctccagggtgccggcgcttttc < 1:912505‑M2/150‑140 (MQ=255) gcagGGCGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctccagggtgccggcgcttttca > 1:4564158‑M2/1‑10 (MQ=255) gcagGGCGATcatggacagcggctggcatgccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtacgggtgctgttatacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctcaatggtgcaggcgctataca < 2:2982526‑M2/150‑141 (MQ=255) cGATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctccagggtgccggcgcttttcacggcga < 2:630884‑M2/150‑147 (MQ=255) gATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctccagggtgccggcgcttttcacggcgaa > 2:7622097‑M2/1‑3 (MQ=255) gATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgctccagggtgccggcgcttttcacggcgaa > 2:4951167‑M2/1‑3 (MQ=255) gATcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggt > 2:1997092‑M2/1‑3 (MQ=255) tcttggtcagcggctggctggccagctccttgagcttggtcagggccagcggcagttgctgggcggcagggtggtccgggtgctgtttgacccaggcttcgatggccgcttgctgctgcagggtgccggcgcttttcacggcgaaggcca > 2:2874211‑M2/1‑1 (MQ=255) | GCGAGCCGATGCGTGAGCTGTCGAACACCTGTACCGCAGGCGCTGGCTGGCCGCTTTGCTGGGCCTGGAAGTGGGCGGCCATGAAGCCATCGCGCAGGGCGCGGGCTACACCGGCCAGCGGGCCTTCCTGAGGCAGCAGCAGGGCGATCTTGGTCAGCGGCTGGCTGGCCAGCTCCTTGAGCTTGGTCAGCGGCTGGCTGGCCAGCTCCTTGAGCTTGGTCAGGGCCAGCGGCAGTTGCTGGGCGGCAGGGTGGTCCGGGTGCTGTTTGACCCAGGCTTCGATGGCCGCTTGCTGCT > NC_002947/1515621‑1515917 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |