New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 1491962 = | 232 (0.560) | 65 (0.200) | 29/224 | 16.6 | 27.9% | intergenic (+22/+108) | yhdZ/degS | amino acid ABC transporter ATP‑binding protein/serine endoprotease DegS |
? | NC_002947 | 1492052 = | 154 (0.470) | intergenic (+112/+18) | yhdZ/degS | amino acid ABC transporter ATP‑binding protein/serine endoprotease DegS | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 261 total aligned reads displayed.
ACCGGACCAAGTTGTTCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCATCACCTCGATGGTTATCTTCTCGTTGGGCTTGATCCGCGCTACCT > NC_002947/1491903‑1492200 | aCCGGACCAAGTTGTTCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCGTTGGAGCCAGCGTAATTCCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGcc > 2:3857281/1‑150 (MQ=255) aCCAAGTTGTTCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCAGCGTAATTCCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCCCAAc > 2:2731464/1‑150 (MQ=255) cAAGTTGTTCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCGCCCACAGGTTTCGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGCACGGCCGCAAcgc > 2:6892522/1‑150 (MQ=255) aGTTGTTCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCCACGCgg > 2:7415910/1‑150 (MQ=255) gttgttCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACCCCCCCGCCCACACGGTTTGCGCTGGCGTTGGGGCCGGCGTAAATCCTGGGGGGGCGGGCGTGGCCGCGAAGGGCCGCCACCCGGc > 1:6789743/1‑150 (MQ=255) ttCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGGACGCCCGCTCCCACAGGTTTTGGGCTGGGTTTTGTGGGGTGGTTATTGGTTTGGGTGGGGGGGGTGCCGCGAAGGGCCGCCACGCGGGCCTg > 1:4563898/1‑150 (MQ=255) aGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCGGGGTTTa > 2:7635991/1‑150 (MQ=255) tCCTGCATTGATGCTTTTTGGGCTGCGCGGCCGCCCTTGGGGGGCCCGCCCGCTCCCCCCGGTTTCGCGCGGGCTTTGGAGCCTGCGTATTTCCGGTGGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTctct < 1:3841673/150‑1 (MQ=255) tGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCCCACCCACACGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAAATCCGGGGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCGGGGGTTATTTCTCGTcc > 2:290106/1‑150 (MQ=255) tGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGGGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCtggctggc < 2:6517170/150‑1 (MQ=255) gctgaatGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACCCCCGCGCCCACAGGTTTATCGCTGGCGTTGGTGCCCGCCTAAATACTTTTGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCCCCACGCCGCCCGGGGGTTATTTCTCTTCCAGGCTGGCa > 2:4366852/7‑150 (MQ=255) gaagggCTGCCGCGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACCGGTTTGGCGCAGGCGTTGGAGCCGGCGTACTTCCTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTGAGTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCg > 2:6633681/4‑150 (MQ=25) ggCTGCGGGCCAGCCCTTCGGGGGCACGCCCGCTCCCACTGTTTTAGCGGTGGCTTGGGTGCCTGCTTATTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGgcgc < 1:2818214/150‑1 (MQ=38) cgcgGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTg < 2:9355650/150‑1 (MQ=255) ggCCGCCCTTCGCGGCCCCGCCCGCCCCCCCTGTTTTGGGGGGGGTTTTGGCGCCTGCTTATTCCGTGTGGGGGGGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTggcg < 1:1154719/150‑1 (MQ=255) cAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATGTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTggcggc > 2:3897136/1‑150 (MQ=255) gCCCTTGGGGGGCCCGCCCGCTCCCACATTTTTGGCGGGGGCTTTGGCGCCGGCTTAATGCCTGGGGGAGGGGGGGTGCCCGCTAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCg < 1:6892522/150‑1 (MQ=255) gggcgGGCCCGCCCGCCCCCCCCGGTTTCGCGGGGGGTTGGGCGCCGGGGTATGTCCGGGGGGCGGGGGGGGGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGcc < 1:2641920/148‑1 (MQ=255) 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ggAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCATCACCTCGATGGtt > 2:5894852/1‑142 (MQ=255) ggAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCATCACCTCGATGGtt < 1:5894852/142‑1 (MQ=255) ggAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCATCACCTCGATGGTTATCTtctc < 1:2107554/150‑1 (MQ=255) gCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCATCACCTCGATGGTTATCTTCTCGtt < 1:733183/150‑1 (MQ=255) gCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAActgct > 1:551514/1‑109 (MQ=255) gCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAActgct > 1:5377129/1‑109 (MQ=255) 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(MQ=255) gcgAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCATCACCTCGATGGTTATCTTCTCGTTGGGCTTGATCcg > 1:3761881/1‑150 (MQ=255) cgAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCATCACCTCGATGGTTATCTTCTCGTTGGGCTTGATCcgc > 1:5919135/1‑150 (MQ=255) gAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCATCACCTCGATGGTTATCTTCTCGTTGGGCTTGa < 2:8044338/144‑1 (MQ=255) gAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCATCACCTCGATGGTTATCTTCTCGTTGGGCTTGATCcgcg > 2:9484303/1‑150 (MQ=255) gAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCATCACCTCGATGGTTATCTTCTCGTTGGGCTTGATCcgcg > 2:5619484/1‑150 (MQ=255) ccaGGGCCGCGTTGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCATCACCTCGATGGTTATCTTCTCGTTGGGCTTGATCcgcg > 1:5212586/3‑150 (MQ=255) caGGGCCGCGTTGCGGCCCTTGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCCTCACCTCGATGGTTATCTTCGCGTTGGGCTTGATCCgcgc > 2:2419480/2‑150 (MQ=255) ggCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCATCACCTCGATGGTTATCTTCTCGTTGGGCTTGATCCGCGCTAc > 2:8386087/1‑150 (MQ=255) ggCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCATCACCTCGATGGTTATCTTCTCGTTGGGCTTGATCCGCGCTAc > 1:9156370/1‑150 (MQ=255) ggCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCATCACCTCGATGGTTATCTTCTCGTTGGGCTTGATCCGCGCTAc > 1:2936886/1‑150 (MQ=255) ggCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCATCACCTCGATGGTTATCTTCTCGTTGGGCTTGATCCGCGCTAc > 2:5356051/1‑150 (MQ=255) | ACCGGACCAAGTTGTTCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCATCACCTCGATGGTTATCTTCTCGTTGGGCTTGATCCGCGCTACCT > NC_002947/1491903‑1492200 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |