| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 5,701,597 | 0 | A | . | 8.6% | 399.0 / 32.9 | 128 | intergenic (+44/‑168) | pyrC'/hslV | dihydroorotase‑like protein/ATP‑dependent HslVU protease peptidase subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/81); new base . (4/7); total (39/89) | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.62e-01 | |||||||||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
CGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCA‑TGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTCATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCCCCCCACCCCCATATGAGTCTGCATCAGGCACTTTCGCCC > NC_002947/5701448‑5701743 | cGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACcaca > 2:157221/1‑150 (MQ=255) gAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACaa > 2:2203561/1‑150 (MQ=255) gAACAATGGTTCGCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACaa < 1:1319140/150‑1 (MQ=255) aCAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACaagt > 1:1053813/1‑148 (MQ=255) cAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTc > 2:4572357/1‑150 (MQ=255) aaTGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCCCAATTcc > 2:5057723/1‑150 (MQ=255) aaTGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAAATcc > 1:3371362/1‑150 (MQ=255) aTGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCa < 2:4091881/150‑1 (MQ=255) tGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCCCAGGCTCACCCCAATTCCaa > 1:2828271/1‑150 (MQ=255) tGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCaa < 1:1443139/150‑1 (MQ=255) tGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCaa < 1:3828618/150‑1 (MQ=255) tGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCaa > 2:2265736/1‑150 (MQ=255) tGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCaa < 1:4918681/150‑1 (MQ=255) 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tACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCCCAGGATCACCACAATTCCAAGGCA‑TGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTCATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTcc < 1:2410211/150‑1 (MQ=255) ccATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCA‑TGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTCATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTcccc < 1:1859235/150‑1 (MQ=255) aGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCA‑TGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTCATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCcccccaccccc < 1:5325295/150‑1 (MQ=255) gCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCCCAATTCCAAGGCA‑TGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGACTGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTCATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCcccccaccccca < 2:1964420/150‑1 (MQ=255) gCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCA‑TGTGGTAACCCTGTGGGAGCggg < 1:1725226/66‑1 (MQ=255) gCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCA‑TGTGGTAACCCTGTGGGAGCggg > 2:1725226/1‑66 (MQ=255) gCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCA‑TGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTCATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCcccccaccccca < 1:4436310/150‑1 (MQ=255) gggCACGCCCGCGCCCCCCGGCTCCCCCCACTGCCCCGGGA‑GGTGGGAACCCGGTGGGAGCGGGCAGGCCCGCGAAGGCCGTCACCTAGGCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTCAGCCCCCCGGGTTGAAATCCTTCCCCCCACCCCCata < 2:5223480/150‑1 (MQ=255) cggCACGCCCGCTCCCCCAGGAACACCACACGTCCACGGCA‑TGTGGCAACCCGGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACAGTGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTCATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCCCCCCACCCCCata < 2:2828271/149‑1 (MQ=255) cACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCT‑TGTGGTAACCCTGTGGGATCGGGCATGCCCGCGTATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTCATCCCCACCGGTTGAATTCCTTGCCCCCACCCCCATATgc < 2:4830569/150‑2 (MQ=255) aCGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCA‑TGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTca < 1:4285363/80‑1 (MQ=255) cGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCA‑TGTGGTAACCCTGTGGGAGCAGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTCATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCCCCCCACCCCCATATGAGt < 1:2265736/150‑1 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCA‑TGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTCATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCCCCCCACCCCCATATGAGTCTg < 1:3334444/150‑1 (MQ=255) cggATCACCACCCGTCCAAGGCA‑TGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTCATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCCCCCCACCCCCATATGCGTCTGCATCAGGCAc < 2:1224110/149‑1 (MQ=255) cacaATTCCAAGGCA‑TGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTCATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCCCCCCACCCCCAGATGAGTCTGCATCAGGCACTTTCGccc < 1:564951/150‑1 (MQ=255) | CGAACAATGGTTCTCCCGTGGCGAGAACTGCCCGTTCATCGGCCACTGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCA‑TGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTCATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCCCCCCACCCCCATATGAGTCTGCATCAGGCACTTTCGCCC > NC_002947/5701448‑5701743 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |