| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,002,199 | Δ1 bp | 9.4% | intergenic (‑163/+37) | PP_5252 ← / ← PP_5253 | hypothetical protein/arylesterase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,002,199 | 0 | C | . | 9.4% | 545.4 / 56.7 | 181 | intergenic (‑163/+37) | PP_5252/PP_5253 | hypothetical protein/arylesterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (80/79); new base . (8/9); total (91/90) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.34e-01 | |||||||||||
Only 100 of 181 total aligned reads displayed.
AGGGGCCGGCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAATCAGCTCC > NC_002947/6002051‑6002347 | aGGGGCCGGCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCt < 1:2919290/150‑1 (MQ=255) ggCCGGCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTa < 2:3760234/150‑1 (MQ=255) ggCCGGCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTa < 1:202179/150‑1 (MQ=255) cGGCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGa < 2:2549469/150‑1 (MQ=255) gCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGCTGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGc < 1:2053486/150‑1 (MQ=255) gCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAGc < 1:1249834/150‑1 (MQ=255) gCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGc < 2:3551469/150‑1 (MQ=255) gCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGc < 1:2896359/150‑1 (MQ=255) gCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCCCTCCTAAA‑ACGTCTGTAGGAGc > 1:2851809/1‑150 (MQ=255) aGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAGCgg < 2:3631829/150‑1 (MQ=255) aGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAGCgg < 1:3981211/150‑1 (MQ=255) aGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCgg < 1:2360365/150‑1 (MQ=255) gggggACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGTGCggg < 2:4876396/150‑1 (MQ=255) gggggACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCggg < 2:1802976/150‑1 (MQ=255) gggggACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCggg < 1:1168732/150‑1 (MQ=255) tGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTAccc > 2:58348/1‑150 (MQ=255) gAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCcgcg > 2:1057826/1‑150 (MQ=255) aaGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGa > 1:2209999/1‑150 (MQ=255) gCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAAACCCCACCAACA‑ACCTCTGTATGAGCGGGTTTAACCCCGAATGttt > 1:4384369/1‑150 (MQ=255) cGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAAACCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTcc > 2:1127825/1‑150 (MQ=255) ttGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCcac < 2:5367082/150‑1 (MQ=255) cAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTAc > 2:1757685/1‑150 (MQ=255) acggCCTGGGCTTGCATGGAGGTGCGGGGGGTTGAAGAAGGTTCGCCCTGGACAAGCTTTTTGCGGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTAcc < 1:5418404/148‑1 (MQ=37) gCCTGGGCTTGAAGGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCt < 2:3990726/150‑1 (MQ=255) tGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGaa < 1:1643465/150‑1 (MQ=255) gggCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTAACGCTGAAg > 2:514190/1‑150 (MQ=255) gCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGa > 2:4163223/1‑150 (MQ=255) cTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGGTAAACCC‑CGCCGACA‑ACCACAGTAGGAGCGGGGTTTCCCCCGCATGTTTACCACAAATAAACCggaaggaa > 1:2999368/1‑150 (MQ=255) cTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCgg < 2:1587059/110‑1 (MQ=255) cTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGaa < 2:2105356/150‑1 (MQ=255) ttGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGGAAACCCCCACCAACA‑CCCGCAGTAGGAGCGGGGTTACCCCCGCAATTTTACCACCAATAACCCAgaacgaac > 1:4803811/1‑150 (MQ=255) gAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGATGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTCGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGc < 1:1517018/150‑1 (MQ=255) aTGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCa < 2:5467071/150‑1 (MQ=255) aTGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTAACGCTGAAGGAACGCCa > 2:2891907/1‑150 (MQ=255) tGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAg < 1:1835896/150‑1 (MQ=255) aTGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGGGAAAACCCGCCAAAA‑AAGGCTGGTGGGGCGGGGTTTCCCCCGCATGTTTTGCACAAATAACCCAGAAGGAAAGCCAGCaa > 1:2362890/1‑150 (MQ=255) tgtgGGGTGGTTTGAAGATGTTTAGCCGTGGCCAAGCTTTTGGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTGGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACTTCTGTAGGTGGGGTTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAg < 1:4707344/150‑1 (MQ=37) tgtgCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGTTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAg < 1:3148300/150‑1 (MQ=255) cGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGGAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTGCCACAATTACCGCTGAAGGAAAGCCAGCAAGTcca > 1:919739/1‑149 (MQ=255) ggTGGGTTTATGAATGTTTGCCCTGGTAATTCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCATCTTCGC‑GGGTAATCCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCACACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTc < 1:2201121/150‑1 (MQ=37) ggTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCGGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTc < 2:292142/150‑1 (MQ=255) gTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCa < 1:831323/150‑1 (MQ=255) ttGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAg > 2:864003/1‑150 (MQ=255) ttGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCCCACCTAAA‑ACGTCTGTAGGTGCGGGTTTAACCGCGAATTTTTACCACAATTAACGCAGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTAAg > 1:1362366/1‑150 (MQ=38) agGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCtgctgc < 1:4130066/150‑1 (MQ=255) ttAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCa < 2:3483058/150‑1 (MQ=255) ttAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCAACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGTTTCCCACAAATAACGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTACACATTAAGCAGCAGCGCa > 2:101337/1‑150 (MQ=37) cccTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCAACA‑AACTATTTATGAGCGGGTTTAACCGCGAAAGTTTACCACAAATACCCCAGAAGGAAAGCCAGCAACTCCACATTCAGCTGCTGCGCATGAg > 2:187999/1‑150 (MQ=25) ccTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGt < 2:5099609/150‑1 (MQ=255) ccTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGt < 2:709429/150‑1 (MQ=255) ccTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGt < 2:1144755/150‑1 (MQ=255) cTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAAATAACGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCACAATCAGCTGCAGCGCATGAGTc > 2:3044398/1‑150 (MQ=38) ggTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCAc < 1:3059994/150‑1 (MQ=255) gTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACt > 2:3201081/1‑150 (MQ=255) cAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGGGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGc < 1:238874/150‑1 (MQ=255) tttttGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAg < 2:1129476/57‑1 (MQ=255) tttttGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAg > 1:1129476/1‑57 (MQ=255) tgctgcCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAAACCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTAACCCCGAATGTTTCCCACAAATACCCCGGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAAACGTg > 1:2805457/1‑150 (MQ=38) ctgcCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCAACA‑ACGGCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCCCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCGGCGCATGGGTCACTGCCAAACCGTgcg > 2:751457/1‑150 (MQ=38) gcCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTgcggc < 1:5009652/150‑1 (MQ=255) ccggccTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTCGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCgg < 1:2587839/150‑1 (MQ=255) ggccTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCa < 2:4448769/150‑1 (MQ=255) ggccTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCa < 2:4605658/150‑1 (MQ=255) ccTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATa < 2:4384369/150‑1 (MQ=255) ttCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACAcc < 2:2705458/150‑1 (MQ=255) ttCGC‑GGGTAAACACGCTCCTAAA‑ACGGCTGTACGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTACCCACAATTACCGCAGAAGGAACGCCCTCAATGACTCATTCAGCTGCAGCGCCAGCGTCACAGCAAAACCCTGCGGCGCCCCGGCCAACAcc > 2:2885384/1‑150 (MQ=255) c‑gGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCa < 1:3087689/150‑1 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAg < 1:2888148/150‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTcc > 2:4208287/1‑48 (MQ=255) cccGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGgcg > 2:5438511/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGgcgc > 1:611513/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCATCAGCTCGgcgc > 1:3940314/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGgcgc > 2:4991539/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGgcgc > 1:2273024/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGgcgc > 1:826430/1‑150 (MQ=255) cGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGcc < 1:4548763/150‑1 (MQ=255) gCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCa > 2:2504101/1‑150 (MQ=255) gCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCa > 1:1004994/1‑150 (MQ=255) gCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCa > 1:4500178/1‑150 (MQ=255) cTCCTACAGACGT‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCAc > 2:4123679/1‑150 (MQ=255) ccTACA‑ACGTCTTTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGa < 1:781400/150‑1 (MQ=255) cTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTcc < 2:2277199/74‑1 (MQ=255) cTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTgcgg < 2:5111430/115‑1 (MQ=255) cTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTgcgg > 1:5111430/1‑115 (MQ=255) cTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGaa > 1:1316726/1‑150 (MQ=255) cTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGaa > 2:4611603/1‑150 (MQ=255) cTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGaa > 2:241006/1‑150 (MQ=255) cTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGaa > 2:5392905/1‑150 (MQ=255) tACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAAt < 1:1057826/150‑1 (MQ=255) tACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAAt > 2:4264597/1‑150 (MQ=255) tACA‑ACGTCCGTAGGAGCGGGATTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAAt < 2:2851334/150‑1 (MQ=255) cA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAATCa > 1:3515917/1‑150 (MQ=255) cA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAATCa < 2:2209999/150‑1 (MQ=255) cA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAATCa > 1:5148349/1‑150 (MQ=255) a‑aCGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGTGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAATCAg > 1:5069428/1‑150 (MQ=255) a‑aCGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGTGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAATCAg > 1:55488/1‑150 (MQ=255) a‑aCGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAATCAg > 1:4938059/1‑150 (MQ=255) aCGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAATCAGc < 2:506619/150‑1 (MQ=255) aCGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAATCAGc > 2:1695165/1‑150 (MQ=255) tCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAATCAGCTcc < 1:382021/150‑1 (MQ=255) | AGGGGCCGGCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAATCAGCTCC > NC_002947/6002051‑6002347 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |