Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,065,054:1 | +T | 6.3% | coding (248/891 nt) | iciA → | chromosome initiation inhibitor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,065,054 | 1 | . | T | 6.3% | 1422.7 / 85.0 | 334 | coding (248/891 nt) | iciA | chromosome initiation inhibitor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (162/151); new base T (12/9); total (174/160) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.59e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 341 total aligned reads displayed.
TTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGAGGACCAGGAAGTGGGCC > NC_002947/1064905‑1065203 | ttCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTAcc > 2:3627957/1‑150 (MQ=255) cccAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑gg < 1:1230420/150‑1 (MQ=255) ccAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑Ggc > 1:5131534/1‑150 (MQ=255) ccAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑Ggc > 1:5439250/1‑150 (MQ=255) cAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑Ggcg > 1:1357128/1‑150 (MQ=255) aGCGCATCAAGGTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑Ggcgc < 2:5364850/150‑1 (MQ=255) gcATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCAGGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCC‑GGTACCTGGCGCTgc < 2:4842196/150‑2 (MQ=255) aaGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGaa > 1:563031/1‑150 (MQ=255) aaGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCC‑GGTACCTGGCGCTgcaggtc < 2:1902375/150‑7 (MQ=255) aaGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCC‑GGTACCTGGCGCTgcaggtc < 2:2513005/150‑7 (MQ=255) aGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAag > 1:679046/1‑150 (MQ=255) gTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCCACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAaga < 2:1777186/150‑1 (MQ=255) ttGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAagag < 1:247913/150‑1 (MQ=255) ttGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAagag > 1:4182174/1‑150 (MQ=255) ttGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAagag < 1:4278013/150‑1 (MQ=255) ttcTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGGGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGGTGGACGAAGAgg < 2:4465442/148‑1 (MQ=255) tGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAgg < 1:3067507/150‑1 (MQ=255) ttGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCC‑GGTACCTGGCGCTgca < 1:3261385/139‑3 (MQ=255) aGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTCCAGCGCC‑GGTACCTGGCGCTgc > 1:3528924/1‑134 (MQ=255) gcgGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGa < 1:2401487/150‑1 (MQ=255) gTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAgagc < 1:1803532/150‑1 (MQ=255) ggCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCGTGCCGGAGCGCCTg > 1:2598672/1‑150 (MQ=255) ggCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTg < 2:1500455/150‑1 (MQ=255) cAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTgcgc > 2:5056492/1‑150 (MQ=255) ccGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATc < 2:4571615/150‑1 (MQ=255) gTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGcc > 2:2463911/1‑150 (MQ=255) gTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGcc < 2:3515500/150‑1 (MQ=255) gTGCTGGTACGGGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGcc < 1:4699128/150‑1 (MQ=255) ggTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCaa > 1:2164630/1‑150 (MQ=255) aCGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGc > 1:3214457/1‑150 (MQ=255) cGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGcc < 1:1989931/150‑1 (MQ=255) cGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGcc < 2:5561742/150‑1 (MQ=255) gTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAagag < 2:1562832/113‑1 (MQ=255) gTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCg > 2:461810/1‑150 (MQ=255) gCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAgc < 1:1723516/124‑1 (MQ=255) gCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGAt > 1:3707037/1‑150 (MQ=255) ccTCGCCGCCCGGCGCGACCTAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACGTGCAGCGCCAGGTACG‑GGCGCTGGACGACGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATa < 1:4297677/150‑1 (MQ=255) ccTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGa > 2:2364451/1‑148 (MQ=255) ccTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGa < 1:2364451/148‑1 (MQ=255) ccTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATa < 1:1526317/150‑1 (MQ=255) cTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGagag > 1:3012741/1‑150 (MQ=255) cTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAg < 2:2131429/150‑1 (MQ=255) cTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAg > 1:4863162/1‑150 (MQ=255) tCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGc > 2:3961839/1‑150 (MQ=255) tCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGc > 1:5032834/1‑150 (MQ=255) tCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGc > 1:4135512/1‑150 (MQ=255) tCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGc > 1:2268083/1‑150 (MQ=255) gccgccCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCt > 2:1184187/1‑150 (MQ=255) ccgccCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTGCTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTg < 2:202442/150‑1 (MQ=255) ccgccCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTg > 1:208490/1‑150 (MQ=255) cccGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGcc > 2:1044421/1‑150 (MQ=255) cgcgACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCtg > 2:4442109/1‑150 (MQ=255) gcgACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCtgg > 1:4942616/1‑150 (MQ=255) aaGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCg > 2:2859354/1‑150 (MQ=255) ggCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGcgcg < 2:5159679/150‑1 (MQ=255) ggCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGcgcg > 2:5254181/1‑150 (MQ=255) ccgccAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGt < 2:1293735/150‑1 (MQ=255) cgccAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTg < 1:4830408/150‑1 (MQ=255) gccAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTgg < 1:928792/150‑1 (MQ=255) gccAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTgg < 1:2371246/150‑1 (MQ=255) gccAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTgg < 1:2763480/150‑1 (MQ=255) gccAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTgg < 1:3419204/150‑1 (MQ=255) ccAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTggg < 2:3463775/150‑1 (MQ=255) gCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCaa < 2:2628761/150‑1 (MQ=255) tCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCt > 2:3068162/1‑150 (MQ=255) aaCCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTgc > 2:787476/1‑150 (MQ=255) cATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGca > 2:3291134/1‑150 (MQ=255) gcagcaGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCacaaca < 2:1407517/150‑1 (MQ=255) cagcagGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAg < 2:4218906/150‑1 (MQ=255) cagGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAAc < 2:3330116/150‑1 (MQ=255) gcgcCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCt < 2:3214457/150‑1 (MQ=255) gcCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTga < 1:1143423/150‑1 (MQ=255) tGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTgaccg > 1:1127629/1‑150 (MQ=255) tGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTgaccg < 2:576140/150‑1 (MQ=255) tCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTgaccgacc > 2:1983264/1‑150 (MQ=255) gAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCtg > 1:1608216/1‑150 (MQ=255) gAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCtg > 1:1892454/1‑150 (MQ=255) aaCGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCtgg < 1:4791550/150‑1 (MQ=255) aCGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCtggt < 2:4986806/150‑1 (MQ=255) gcgACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCtggtgg > 2:3092030/1‑150 (MQ=255) cgACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTggtggt < 1:3373605/150‑1 (MQ=255) ttcgtccAGCGCC‑GGTACCTGGCGCTGCACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGtt > 2:5091747/7‑150 (MQ=255) ttcgtccAGCGCC‑GGTACCTGGCGCTGCACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGtt > 2:4154901/7‑150 (MQ=255) ttcgtccAGCGCC‑GGTACCTGGCGCTGCACGAAGACGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCGGGAGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGtt > 2:2975436/7‑150 (MQ=255) gACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGtt < 1:5360580/150‑1 (MQ=255) aCCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTg < 1:4606190/150‑1 (MQ=255) ccTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTTGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGa < 1:600086/150‑1 (MQ=255) ccTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGa < 1:5254164/150‑1 (MQ=255) tGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACACCAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGAgg > 2:4807753/1‑150 (MQ=255) tGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGAgg > 1:2960391/1‑150 (MQ=255) tGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGAgg < 2:2200789/150‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGAGGa > 1:4461741/1‑150 (MQ=255) gCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGGggagga > 2:4347803/1‑150 (MQ=255) gcgcCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGAGGACCa < 1:3327214/150‑1 (MQ=255) gcgcCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGAGGACCa > 1:2220725/1‑150 (MQ=255) cgcCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGAGGACCAg < 1:3938011/150‑1 (MQ=255) cgcCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGAGGACCAg < 2:3776062/150‑1 (MQ=255) gcCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGAGGACCAgg > 1:3980029/1‑150 (MQ=255) ggTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGAGGACCAGGAAGt < 2:5439250/150‑1 (MQ=255) c‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGAGGACCAGGAAGTGGGcc > 1:1414003/1‑150 (MQ=255) | TTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGAGGACCAGGAAGTGGGCC > NC_002947/1064905‑1065203 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |