New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2315525 | 195 (0.810) | 10 (0.040) | 8/254 | NT | 5.2% | coding (284/1311 nt) | PP_2033 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 2315562 | 182 (0.810) | coding (321/1311 nt) | PP_2033 | hypothetical protein |
GGGTGGCAGCTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCTACGCCTCGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/2315367‑2315525 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acgcctcggcAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGGTGGCCGAGGCGTAGACATGGTCGGCTTCACCCGCCAGCGTGCCCACGCCTTCCACATAGCGCTTCAAGAACGCCTGCGGCCCGTCGGCACCGGCAGCATCAGCCGGATACAAC < NC_002947/2315562‑2315415 GGGTGGCAGCTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCTA < 2:4978082/150‑1 GGGTGGCAGCTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCTA < 2:1135550/150‑1 GGTGGCAGCTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCTAC > 2:4811018/1‑150 GGTGGCAGCTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCTAC < 2:1477331/150‑1 GGTGGCAGCTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCTAC < 2:1477226/150‑1 GGTGGCAGCTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTGGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCTAC > 2:2460712/1‑150 GGTGGCAGCTAGGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCTAC < 1:4090746/150‑1 AGCTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCTACGCCTCG < 1:415033/150‑1 AGCTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCTACGCCTCG > 2:3327233/1‑150 AGCTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCTACGCCTCG > 2:1199113/1‑150 GCTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCTACGCCTCGG > 2:105397/1‑150 gttTGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCTACGCCTCGGC < 2:583796/147‑1 CTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCTACGCCTCGGC > 2:4588531/1‑150 CAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCTACGCCTCGGCAACCCG < 2:3412555/150‑1 CATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCTACGCCTCGGCCA‑CCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGG < 2:4611979/150‑1 TGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGAGGGTGAAGCCGACAATGTCTACGCCTCGGCAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGGT < 2:2126220/150‑1 GCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCTACGCCTCGGCAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGGTG < 2:196283/150‑1 GTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCTACGCCTCGGCAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGGTGGC < 1:503834/150‑1 GTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCTACGCCTCGGCAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGGTGGCCGA < 1:576807/150‑1 GTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCAACGCCTCGGCAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGGTGGCCGA < 2:4763614/150‑1 TATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCTACGCCTCGGCAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGGTGGCCGAG < 2:5019/150‑1 CCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCTACGCCTCGGCAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGGTGGCCGAGGCGTAGACATGGTCGG < 2:2680698/150‑1 CCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCTACGCCTCGGCAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGGTGGCCGAGGCGTAGACATGGTCGG < 2:2681024/150‑1 ACGCCTCGGCAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGGTGGCCGAGGCGTAGACATGGTCGGCTTCACCCGCCAGCGTGCCCACGCCTTCCACATAGCGCTTCAAGAACGCCTGCGGCCCGTCGGCACCGGCAGCATCAGCCG < 1:2402231/150‑1 ACGCCTCGGCAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGGTGGCCGAGGCGTAGACATGGTCGGCTTCACCCGCCAGCGTGCCCACGCCTTCCACATAGCGCTTCAAGAACGCCTGCGGCCCGTCGGCACCGGCAGCATCAGCCG < 2:2855576/150‑1 CGCCTCGGCAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGTGCCCATGCCCGGTGGCCGAGGCGTAGACATGGTCGGCTTCACCCGCCAGCGTGCCCACGCCTTCCACCTAGCGCTTCAAGAACGCCTGCGGCCCGTCGGCACCGGCAGCATCAGCCGG < 2:3373864/150‑1 CGCCTCGGCAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGGTGGCCGAGGCGTAGACATGGTCGGCTTCACCCGCCAGCGTGCCCACGCCTTCCACATAGCGCTTCAAGAACGCCTGCGGCCCGTCGGCACCGGCAGCATCAGCCGG < 2:86591/150‑1 GCCTCGGCAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGGTGGCCGAGGCGTAGACATGGTCGGCTTCACCCGCCAGCGTGCCCACGCCTTCCACATAGCGCTTCAAGAACGCCTGCGGCCCGTCGGCACCGGCAGCATCAGCCGGA < 2:2555230/150‑1 GCCTCGGCAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGGTGGCCGAGGCGTAGACATGGTCGGCTTCACCCGCCAGCGTGCCCACGCCTTCCACATAGCGCTTCAAGAACGCCTGCGGCCCGTCGGCACCGGCAGCATCAGCCGGA > 1:6908/1‑150 GCCTCGGCAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGGTGGCCGAGGCGTAGACATGGTCGGCTTCACCCGCCAGCGTGCCCACGCCTTCCACATAGCGCTTCAAGAACGCCTG < 1:869865/119‑1 GCCTCGGCAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGGTGGCCGAGGCGTAGACATGGTCGGCTTCACCCGCCAGCGTGCCCACGCCTTCCACATAGCGCTTCAAGAACGCCTG > 2:869865/1‑119 CCTCGGAAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGGTGGCCGAGGCGTAGACATGGTCGGCTTCACCCGCCAGCGTGCCCACGCCTTCCACATAGCGCTTCAAGAACGCCTGCGGCCCGTCGGCACCGGCAGCATCAGCCGGAT > 2:4391571/1‑150 CTCGGCAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGGTGGCCGAGGCGTAGACATGGTCGGCTTCACCCGCCAGCGTGCCCACGCCTTCCACGTAGCGCTTCAAGAACGCCTGCGGCCCGTCGGCACCGGCAGCATCAGCCGGATA < 2:549096/150‑1 TCGGCAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGGTGGCCGAGGCGTAGACATGGTCGGCTTCACCCGCCAGCGTGCCCACGCCTTCCACATAGCGCTTCAAGAACGCCTGCGGCCCGTCGGCACCGGCAGCATCAGCCGGATAC > 2:3070426/1‑150 TCGGCAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGGTGGCCGAGGCGTAGACATGGTCGGCTTCACCCGCCAGCGTGCCCACGCCTTCCACATAGCGCTTCAAGAACGCCTGCGGCCCGTCGGCACCGGCAGCATCAGCCGGATAC < 2:2537865/150‑1 TCGGCAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGGTGGCCGAGGCGTAGACATGGTCGGCTTCACCCGCCAGCGTGCCCACGCCTTCCACATAGCGCTTCAAGAACGCCTGCGGCCCGTCGGCACCGGCAGCATCAGCCGGATAC > 1:4387405/1‑150 TCGGCAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGGTGGCCGAGGCGTAGACATGGTCGGCTTCACCCGCCAGCGTGCCCACGCCTTCCACATAGCGCTTCAAGAACGCCTGCGGCCCGTCGGCACCGGCAGCATCAGCCGGATAC > 2:455900/1‑150 TCGGCAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGGTGGCCGAGGCGTAGACATGGTCGGCTTCACCCGCCAGCGTGCCCACGCCTTCCACATAGCGCTTCAAGAACGCCTGCGGCCCGTCGGCACCGGCAGCATCAGCCGGATAC < 1:437791/150‑1 TCGGCAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGGTGGCCGAGGCGTAGACATGGTCGGCTTCACCCGCCAGCGTGCCCACGCCTTCCACATAGCGCTTCAAGAACGCCTGCGGCCCGTCGGCACCGGCAGCATCAGCCGGATAC > 2:2088581/1‑150 CGGCAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGGTGGCCGAGGCGTAGACATGGTCGGCTTCACCCGCCAGCGTGCCCACGCCTTCCACATAGCGCTTCAAGAACGCCTGCGGCCCGTCGGCACCGGCAGCATCAGCCGGATACA > 2:904522/1‑150 CGGCAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGGTGGCCGAGGCGTAGACATGGTCGGCTTCACCCGCCAGCGTGCCCACGCCTTCCACATAGCGCTTCAAGAACGCCTGCGGCCCGTCGGCACCGGCAGCATCAGCCGGATACA > 2:3733584/1‑150 GGCAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCTGTGGCCGAGGCGTAGACATGGTCGGCTTCACCCGCCAGCGTGCCCACGCCTTCCACATAGCGCTTCAAGAACGCCTGCGGCCCGTCGGCACCGGCAGCATCAGCCGGATACAA < 2:217986/150‑1 GGCAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGGTGGCCGAGGCGTAGACATGGTCGGCTTCACCCGCCAGCGTGCCCACGCCTTCCACATAGCGCTTCAAGAACGCCTGCGGCCCGTCGGCACCGGCAGCATCAGCCGGATACAA < 2:4304033/150‑1 GGCAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGGTGGCCGAGGCGTAGACATGGTCGGCTTCACCCGCCAGCGTGCCCACGCCTTCCACATAGCGCTTCAAGAACGCCTGCGGCCCGTCGGCACCGGCAGCATCAGCCGGATACAA > 1:552026/1‑150 GGCAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGGTGGCCGAGGCGTAGACATGGTCGGCTTCACCCGCCAGCGTGCCCACGCCTTCCACATAGCGCTTCAAGAACGCCTGCGGCCCGTCGGCACCGGCAGCATCAGCCGGATACAA < 1:504896/150‑1 GCAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGGTGGCCGAGGCGTAGACATGGTCGGCTTCACCCGCCAGCGTGCCCACGCCTTCCACATAGCGCTTCAAGAACGCCTGCGGCCCGTCGGCACCGGCAGCATCAGCCGGATACAAC > 2:3567512/1‑150 GCAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGGTGGCCGAGGCGTAGACATGGTCGGCTTCACCCGCCAGCGTGCCCACGCCTTCCACATAGCGCTTCAAGAACGCCTGCGGCCCGTCGGCACCGGCAGCATCAGCCGGATACAAC < 2:3350031/150‑1 GCAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGGTGGCCGAGGCGTAGACATGGTCGGCTTCACCCGCCAGCGTGCCCACGCCTTCCACATAGCGCTTCAAGAACGCCTGCGGCCCGTCGGCACCGGCAGCATCAGCCGGATACAAC < 2:6908/150‑1 GCAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGGTGGCCGAGGCGTAGACATGGTCGGCTTCACCCGCCAGCGTGCCCACGCCTTCCACATAGCGCTTCAAGAACGCCTGCGGCCCGTCGGCACCGGCAGCATCAGCCGGATACAAC < 1:3081964/150‑1 GGGTGGCAGCTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCTACGCCTCGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/2315367‑2315525 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acgcctcggcAACCCGGGCCTCTGCCCCTGTGCGCCCATGCCCGGTGGCCGAGGCGTAGACATGGTCGGCTTCACCCGCCAGCGTGCCCACGCCTTCCACATAGCGCTTCAAGAACGCCTGCGGCCCGTCGGCACCGGCAGCATCAGCCGGATACAAC < NC_002947/2315562‑2315415 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |