New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5879563 | 251 (1.040) | 15 (0.070) | 9/252 | NT | 6.3% | intergenic (‑50/+98) | PP_5148/ilvA‑II | membrane protein/threonine deaminase |
? | NC_002947 | = 5879623 | 214 (0.960) | intergenic (‑110/+38) | PP_5148/ilvA‑II | membrane protein/threonine deaminase |
TCGCCCTGACGGCGAGCGCGCCAGGTCCAGATCGCCAGGCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCGGTAGCTTCTTCGCGGGCTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/5879404‑5879563 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcgcgggcttGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCAGGCCTCAAGGCCTGAGATACCTTGGCAGGAGCGGGTAAGCCCGCGAAGAAGCTACCGCAAAATGCCAGTTTAAGGACGACCGAGAGATGGAACACCTGACCACGCTCAAGACCCTGCACATCATC < NC_002947/5879623‑5879475 TCGCCCTGACGGCGAGCGCGCCAGGTCCAGATCGCCAGGCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGGGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTGAAACTGGCATTTTGCGGTAGCTTCT > 1:284959/1‑150 CGCCCTGACGGCGAGCGCGCCAGGTCCAGATCGCCAGGCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCGGTAGCTTCTT < 1:1368346/150‑1 CGCCCTGACGGCGAGCGCGCCAGGTCCAGATCGCCAGGCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCGGTAGCTTCTT < 2:4478538/150‑1 GCCCTGACGGCGAGCGCGCCAGGTCCAGATCGCCAGGCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGTTGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCGGTAGCTTCTTC < 2:2785797/150‑1 GCCCTGACGGCGAGCGCGCCAGGTCCAGATCGCCAGGCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCGGTAGCTTCTTC < 2:4765707/150‑1 CCCTGACGGCGAGCGCGCCAGGTCCAGATCGCCAGGCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCGGTAGCTTCTTCG > 1:961524/1‑150 CCCTGACGGCGAGCGCGCCAGGTCCAGATCGCCAGGCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCGGTAGCTTCTTCG > 1:350169/1‑150 CCCTGACGGCGAGCGCGCCAGGTCCAGATCGCCAGGCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCGGTAGCTTCTTCG > 1:350830/1‑150 CCCTGACGGCGAGCGCGCCAGGTCCAGATCGCCAGGCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCGGTAGCTTCTTCG > 1:797119/1‑150 TGATGGCGAGCGCGCCAGGTCCAGATCGCCAGGCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCGGTAGCTTCTTCGCGG < 2:1222962/150‑1 TGACGGCGAGCGCGCCAGGTCCAGATCGCCAGGCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCGGTAGCTTCTTCGCGG < 2:645542/150‑1 TGACGGCGAGCGCGCCAGGTCCAGATCGCCAGGCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCGGTAGCTTCTTCGCGG > 1:2139359/1‑150 TGACCGCGAGCCCGCCAGGTCCAGAACGCCAGGCCCAGGCCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATCTGCACGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGACCTTAAACTGGCATTTTCCGGAAGCTTCTTCGCGG > 1:1200804/1‑150 GACGGCGAGCGCGCCAGGTCCAGATCGCCAGGCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCGGTAGCTTCTTCGCGGG < 1:824280/150‑1 GGCGAGCGCGCCAGGTCCAGATCGCCAGGCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCGGTAGCTTCTTCGCGGGCTT > 1:4320642/1‑150 CCAGGCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCGGTAGCTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCA < 2:3372605/150‑1 GGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCGGTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCCACAGGTACTGCGCAGGCCTCAAG < 2:1203966/150‑1 GCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCGGTAGCTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCAGGCCTCAAGGCCTGAGATACCTTGGCAGG < 2:1816308/150‑1 GATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCGGTAGCTTTTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCAGGCCTCAAGGCCTGAGATACCTTGGCAGGAGCGGGTA < 1:4854670/150‑1 ATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCGGTAGCTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCAGGCCTCAAGGCCTGAGATACCTTGGCAGGAGCGGGTAA < 2:2547272/150‑1 ATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCGGTAGCTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCAGGCCTCAAGGCCTGAGATACCTTGGCAGGAGCGGGTAA < 1:5346661/150‑1 ATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCGGTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCCACAGGTACTGCGCAGGCCTCAAGGCCTGAGATACCTTGGCAGGAGCGGGTAA < 2:20205/150‑1 ATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCGGTAGCTTCTTCGCGGGCTTACCCGCTCCCACAGGTACTGCGCAGGCCTCAAGGCCTGAGATACCTTGGCAGGAGCGGGTAA < 2:3732647/150‑1 TGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGGTCCATCTCTCGGTCGGCCTTACCCTGGCATTTTGCGGTAGCTTTTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCAGGCCTCAAGGCCTGAGATACCTTGGCAGGAGCGGGTAAGCCC < 2:3902243/150‑1 TGTGCAGGGTATTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCGGTAGCTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCAGGCCTCAAGGCCTGAGATACCTTGGCAGGAGCGGGTAAGCCC < 1:3048583/150‑1 GGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCGGTAGCTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCAGGCCTCAAGGCCTGAGATACCTTGGCAGGAGCGGGTAAGCCCGCGAAGA < 2:5123127/150‑1 GGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCGGTAGCTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCAGGCCTCAAGGCCTGAGATACCTTGGCAGGAGCGGGTAAGCCCGCGAAGA < 2:5122729/150‑1 GGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCGGTAGCTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCAGGCCTCAAGGCCTGAGATACCTTGGCAGGAGCGGGTAAGCCCGCGAAGA < 2:3627183/150‑1 TCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCGGTAGCTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCAGGCCTCAAGGCCTGAGA < 1:2643798/104‑1 TCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCGGTAGCTTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCAGGCCTCAAGGCCTGAGA > 2:2643798/1‑104 TCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCAGGCCTCAAGGCCTGAGATACCTTGGCAGGAGCGGGTAAGCCCGCGAAGAAGCTACCGCAAAATGCCAGTTTAAGGACGACCGAGAGATGGAACACCTGACCACGCTCAAGACCCTG < 2:5510859/150‑1 CGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCAGGCCTCAAGGCCTGAGATACCTTGGCAGGAGCGGGTAAGCCCGCGAAGAAGCTACCGCAAAATGCCAGTTTAAGGACGACCGAGAGATGGAACACCTGACCACGCTCAAGACCCTGC < 2:2426179/150‑1 GCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCAGGCCTCAAGGCCTGAGATACCTTGGCAGGAGCGGGTAAGCCCGCGAAGAAGCTACCGCAAAATGCCAGTTTAAGGACGACCGAGAGATGGAACACCTGACCACGCTCAAGACCCTGCA < 1:3413735/150‑1 CGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCAGGCCTCAAGGCCTGAGATACCTTGGCAGGAGCGGGTAAGCCCGCGAAGAAGCTACCGCAAAATGCCAGTTTAAGGACGACCGAGAGATGGAACACCTGACCACGCTCAAGACCCTGCAC > 2:4806444/1‑150 CGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCAGGCCTCAAGGCCTGAGATACCTTGGCAGGAGCGGGTAAGCCCGCGAAGAAGCTACCGCAAAATGCCAGTTTAAGGACGACCGAGAGATGGAACACCTGACCACGCTCAAGACCCGGCAC > 2:4083043/1‑150 GGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCAGGCCTCAAGGCCTGAGATACCTTGGCAGGAGCGGGTAAGCCCGCGAAGAAGCTACCGCAAAATGCCAGTTTAAGGACGACCGAGAGATGGAACACCTGACCACGCTCAAGACCCAGCACA > 1:123724/1‑150 GCTTGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCAGGCCTCAAGGCCTGAGATACCTTGGCAGGAGCGGGTAAGCCCGCGAAGAAGCTACCGCAAAATGCCAGTTTAAGGACGACCGAGAGATGGAACACCTGACCACGCTCAAGACCCTGCACATC > 1:2731714/1‑150 CTTGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCAGGCCTCAAGGCCTGAGATACCTTGGCAGGAGCGGGTAAGCCCGCGAAGAAGCTACCGCAAAATGCCAGTTTAAGGACGACCGAGAGATGGAACACCTGACCACGCTCAAGACCCTGCACATCA > 2:4964595/1‑150 TTGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCAGGCCTCAAGGCCTGAGATACCTTGGCAGGAGCGGGTAAGCCCGCGAAGAAGCTACCGCAAAATGCCAGTTTAAGGGCGACCGAGAGATGGAACACCTGACCACGCTCAAGACCCTGCACATCAT > 1:4534704/1‑150 TTGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCAGGCCTCAAGGCCTGAGATACCTTGGCAGGAGCGGGTAAGCCCGCGAAGAAGCTACCGCAAAATGCCAGTTTAAGGACGACCGAGAGATGGAACACCTGACCACGCTCAAGACCCTGCACATCAT > 2:3241907/1‑150 TTGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCAGGCCTCAAGGCCTGAGATACCTTGGCAGGAGCGGGTAAGCCCGCGAAGAAGCTACCGCAAAATGCCAGTTTAAGGACGACCGAGAGATGGAACACCTGACCACGCTCAAGACCCTGCACATCAT > 1:5256443/1‑150 TTGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCAGGCCTCAAGGCCTGAGATACCTTGGCAGGAGCGGGTAAGCCCGCGAAGAAGCTACCGCAAAATGCCAGTTTAAGGACGACCGAGAGATGGAACACCTGACCACGCTCAAGACCCTGCACATCAT > 2:2519366/1‑150 TTGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCAGGCCTCAAGGCCTGAGATACCTTGGCAGGAGCGGGTAAGCCCGCGAAGAAGCTACCGCAAAATGCCAGTTTAAGGACGACCGAGAGATGGAACACCTGACCACGCTCAAGACCCTGCACATCAT > 2:2518840/1‑150 TTGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCAGGCCTCAAGGCCTGAGATACCTTGGCAGGAGCGGGTAAGCCCGCGAAGAAGCTACCGCAAAATGCCAGTTTAAGGACGACCGAGAGATGGAACACCTGACCACGCTCAAGACCCTGCACATCAT > 1:5256638/1‑150 TGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCAGGCCTCACGGCCTGAGATACCTTGGCAGGAGCGGGTAAGCCCGCGAAGAAGCTACCGCAAAATGCCAGTTTAAGGACGACCGAGAGATGGAACACCTGACCACGCTCAAGACCCTGCACATCATC < 2:5260505/150‑1 TGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCAGGCCTCAAGGCCTGAGATACCTTGGCAGGAGCGGGTAAGCCCGCGAAGAAGCTACCGCAAAATGCCAGTTTAAGGACGACCGAGAGATGGAACACCTGACCACGCTCAAGACCCTGCACATCATC < 2:5260496/150‑1 TCGCCCTGACGGCGAGCGCGCCAGGTCCAGATCGCCAGGCCCAGGGCGCCCAGAAACAGCAGCGCGGTGGCGATGATGTGCAGGGTCTTGAGCGTGGTCAGGTGTTCCATCTCTCGGTCGTCCTTAAACTGGCATTTTGCGGTAGCTTCTTCGCGGGCTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/5879404‑5879563 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcgcgggcttGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCAGGCCTCAAGGCCTGAGATACCTTGGCAGGAGCGGGTAAGCCCGCGAAGAAGCTACCGCAAAATGCCAGTTTAAGGACGACCGAGAGATGGAACACCTGACCACGCTCAAGACCCTGCACATCATC < NC_002947/5879623‑5879475 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |