| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1030219 = | 187 (0.770) | 8 (0.040) | 7/220 | NT | 6.2% | intergenic (‑121/+108) | opdP/dppA‑II | glycine‑glutamate dipeptide porin/dipeptide ABC transporter substrate‑binding protein |
| ? | NC_002947 | 1030312 = | 93 (0.480) | intergenic (‑214/+15) | opdP/dppA‑II | glycine‑glutamate dipeptide porin/dipeptide ABC transporter substrate‑binding protein | |||||
Only 100 of 258 total aligned reads displayed.
GCCAGTGCGGTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCAACACTCACACCGGAAAAATCATTGCGCCCAAACG > NC_002947/1030070‑1030367 | gCCAGTGCGGTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTg < 2:531871/150‑1 (MQ=255)agcggctcaagcagcaggtaccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccg > 2:1898794‑M1/150‑150 (MQ=255)agcggctcaagcagcaggtaccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccggttgggcgcaatgatttttccggggtgagtgttgattaagcgttagccagtaccg < 1:3257911‑M1/1‑1 (MQ=255) cggctcaagcagcaggtaccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGc > 1:3375102‑M1/148‑150 (MQ=255) cAGTGCGGTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTgg < 1:5624072/149‑1 (MQ=255) tcaagcagcaggtaccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCctct < 1:349603‑M1/7‑1 (MQ=255) tcaagcagcaggtaccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCctct < 2:5274879‑M1/7‑1 (MQ=255) ggTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTc > 1:2706235/1‑150 (MQ=255) aatcagcaggtaccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCCTctta < 1:4858389‑M1/9‑2 (MQ=255) aagcagcaggtaccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCCTCTTc < 1:1168071‑M1/9‑1 (MQ=255) tCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTcgc > 1:2282219/1‑150 (MQ=255) acggTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCgg < 2:2323952/148‑1 (MQ=255) aaGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCgg < 1:423569/150‑1 (MQ=255) 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accgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCCTCTTCGCGGGCAAGcc > 2:5089827‑M1/131‑150 (MQ=255) tACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCgg < 1:3027330/142‑1 (MQ=255) tACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCACGccc > 1:3446095/1‑150 (MQ=255) tACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGccc < 1:1432409/150‑1 (MQ=255) ccgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCCTCTTCGCGGGCAAGccc > 1:4729615‑M1/130‑150 (MQ=255) cgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCg > 2:2640342‑M1/129‑150 (MQ=255) cgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCg > 2:3350529‑M1/129‑150 (MQ=255) cgattacgccggtggcgcattccatcgtgagccagccgcttagcgtcaaggtttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCg > 2:708673‑M1/129‑150 (MQ=255) aCTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCg < 1:5290552/150‑1 (MQ=255) aCTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCg > 1:3175838/1‑150 (MQ=255) 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2:1232634‑M1/77‑150 (MQ=255) ttcccagttcaaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCgg > 2:4573511‑M1/77‑150 (MQ=255) ccGGGTGATAGCTGCGGTGTTGCCAGGGGAGCCGCGGCATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGCGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGACATCCTGTGGGAGCgg < 2:5008320/150‑1 (MQ=255) cGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCggg < 2:5554790/150‑1 (MQ=255) ttGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGccc < 1:3873191/150‑1 (MQ=255) aaggtcagcccgtttgggcgcaatgatttttccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGc < 2:322933‑M1/3‑1 (MQ=255) ctgcGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCCAGCCCCCGCCCACAGGTAGGGGGCAGTGTCCGAACCGGTCGAGATACGGTGGGAGCGGGCGTGCCcgcg > 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ccGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGCCCGCTCCCGCCGGGAGGGCGCCGGGTCCGAACCGGGCGAGATCCGGTGGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGGGACGGGCGaa > 1:2797252/1‑150 (MQ=255) ccGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTGGTGTTGGCGGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCGGTCGAGATCCTGTGGGTGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTaa < 2:4161498/150‑1 (MQ=38) gggATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCt > 2:2989674/1‑150 (MQ=255) ccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCCTCTTCGCGGGCAAGc < 1:1757466‑M1/19‑1 (MQ=255) ccggtgtgagtgttgattaagcgttagccagtaccGGCCTCTTCGCGGGCAAGc > 2:1757466‑M1/36‑54 (MQ=255) cGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCAac < 2:3256194/150‑1 (MQ=255) gggCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCAaca < 2:3736125/150‑1 (MQ=255) aGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTGCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGAGCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCAACACTca < 2:4465991/150‑1 (MQ=255) gggCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCAACACTCACACCGGa > 2:2052198/1‑150 (MQ=255) gtgggCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCTGTGTCCGAACGTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCAACACTCACACCGGAAAAATCAtt < 1:5062104/147‑1 (MQ=255) gtTGGCGGTTCTGGCCTCTGCGCGGGCACGCCCGCCCCCTCCGGTCGGGCGCTGTGTCCGAACCTGTCTTGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCAACACTCACACCGGAAAAATCAtt < 1:2302001/150‑1 (MQ=38) tGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCCGGTTGGGCGCTGTGTCCGAACCTGTCGATATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCAACACTCACACCGGAAAAATCATTgc < 2:5288384/150‑1 (MQ=255) ggCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCCCTCCCGCAGGTAGGGCGCCCTGTCCGCACCGGTCGAGATCCGGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCATAATAAACACTCACACCGGAAAAAACAATgcg > 2:1198526/1‑150 (MQ=37) tGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCGCCCGCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCAGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCGGCCGGTACTGGCTAACGCGTAATCAACACACACACCGGAAAAATAAATGCGCCCaaaag > 2:2431094/1‑148 (MQ=38) gGGCCTCTGCGGGGGCACGCCGGCCCCCTCCGGTCGGGCGCTGTGTCCTACCCTGTCGAGATCCTGGGGGAGGGGGCTGGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCAACACTCACACCGGAAAAATCATTGCGCCCAAACg > 1:1698874‑M1/2‑150 (MQ=255) | GCCAGTGCGGTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCAACACTCACACCGGAAAAATCATTGCGCCCAAACG > NC_002947/1030070‑1030367 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |