| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 1173536 | 132 (0.550) | 8 (0.040) | 6/238 | NT | 6.6% | intergenic (+98/+155) | eda/leuA | KHG/KDPG aldolase/2‑isopropylmalate synthase |
| ? | NC_002947 | = 1173609 | 111 (0.530) | intergenic (+171/+82) | eda/leuA | KHG/KDPG aldolase/2‑isopropylmalate synthase | |||||
Only 100 of 237 total aligned reads displayed.
GCGGATCGAAGCGTGCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAGGCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCGGGCTTTCTCATCCCTCATTTC > NC_002947/1173387‑1173685 | gcgGATCGAAGCGTGCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTA < 1:2590978‑M1/150‑1 (MQ=255) gAAGCGTGCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGc < 1:4648380/150‑1 (MQ=255) aaGCGTGCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGcg > 1:1790185/1‑149 (MQ=255) 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1:1136058‑M1/1‑3 (MQ=255) GTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAGGCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCGGGCTTTCTCATCCCTCAtt < 1:878699‑M1/150‑1 (MQ=255) TAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAGGCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCGGGCTTTCTCATCCCTCAttt < 1:3295106‑M1/150‑1 (MQ=255) TAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAGGCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCGGGCTTTCTCATCCCTCAttt < 2:4347368‑M1/150‑1 (MQ=255) aaacccgctcctactacggcctgtgtccaacacccggtgtgtgcccaccgcagatcggtgcgtaggagcgggtctacccgcgaaagggccagcacaaccactgcaaataccccaggcaaaaaaaaggggcgccgaccaagcgccccacaa < 2:287526‑M1/150‑150 (MQ=255) aaacccgctcctactacggcctgtgtccaacacccggtgtgtgcccaccgcagatcggtgcgtaggagcgggtctacccgcgaaagggccagcacaaccactgcaaataccccaggcaaaaaaaaggggcgccgaccaagcgccccacaa < 2:3103708‑M1/150‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |