| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2779061 | 188 (0.780) | 14 (0.060) | 9/252 | NT | 7.1% | intergenic (+20/+90) | calA/PP_5521 | coniferyl alcohol dehydrogenase/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 2779122 | 196 (0.880) | intergenic (+81/+29) | calA/PP_5521 | coniferyl alcohol dehydrogenase/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 267 total aligned reads displayed.
CGCCGAGCACGACATCCGTTGCGATATCGAGATGCTGGATATCCGCAACATCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCATTGGCTTGTCCCAGCCCTTCCAGAACAACCATCGCCGCACCTCGCCGTG > NC_002947/2778912‑2779210 | cgcCGAGCACGACATCCGTTGCGATATCGAGATGCTGGATATCCGCAACATCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GG < 2:3621317‑M1/150‑1 (MQ=255) ccGAGCACGACATCCGTTGCGATATCGAGATGCTGGATATCCGCAACATCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGc < 2:343313/150‑1 (MQ=255) ccGAGCACGACATCCGTTGCGATATCGAGATGCTGGATATCCGCAACATCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGc < 2:5077752/150‑1 (MQ=255) gAGCACGACATCCGTTGCGATATCGAGATGCTGGATATCCGCAACATCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCct > 1:5329284/1‑150 (MQ=255) gAGCACGACATCCGTTGCGATATCGAGATGCTGGATATCCGCAACATCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCct > 2:2987366/1‑150 (MQ=255) gACATCCGTTGCGATATCGAGATGCTGGATATCCGCAACATCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTcgc > 2:4925780/1‑150 (MQ=255) gACATCCGTTGCGATATCGAGATGCTGGATATCCGCAACATCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTcgc > 1:89320/1‑150 (MQ=255) gACATCCGTTGCGATATCGAGATGCTGGATATCCGCAACATCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTcgc > 1:3219967/1‑150 (MQ=255) aCATCCGTTGCGATATCAAGATGCTGGATATCCGCAACATCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTcgcg < 2:2881836/150‑1 (MQ=255) cATCCGTTGCGATATCGAGATGCTGGATATCCGCAACATCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCgg < 2:2920680/150‑1 (MQ=255) cATCCGTTGCGATATCGAGATGCTGGATATCCGCAACATCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCgg > 2:3136714/1‑150 (MQ=255) cGTTGCGATATCGAGATGCTGGATATCCGCAACATCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCaa < 1:3248105/150‑1 (MQ=255) gTTGCGATATCGAGATGCTGGATATCCGCAACATCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAg > 1:1580330/1‑150 (MQ=255) tatCGAGATGCTGGATATCCGCAACATCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGcga < 1:2619465/150‑3 (MQ=255) tatCGAGATGCTGGATATCCGCAACATCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTc < 1:3321448/150‑1 (MQ=255) tCGAGATGCTGGATATCCGCAACATCCACCAGGCCTAGGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGcgaag < 2:2190855/150‑5 (MQ=255) tCGAGATGCTGGATATCCGCAACATCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCt < 1:4432744/150‑1 (MQ=255) tCGAGATGCTGGATATCCGCAACATCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCt > 2:712985/1‑150 (MQ=255) tCGAGATGCTGGATATCCGCAACATCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCt > 1:2784896/1‑150 (MQ=255) aTGCTGGATATCCGCAACATCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTAcaca < 2:2214487/150‑1 (MQ=255) cTGGATATCCGCAACATCAACCAGGCCTATGAGTGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAggg < 1:933273/150‑1 (MQ=255) cTGGATATCCGCAACATCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAggg > 2:633280/1‑150 (MQ=255) tGGATATCCGCAACATCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAgggg > 1:848364/1‑150 (MQ=255) atatCCGCAACATCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGa < 1:1661207/150‑1 (MQ=255) tatCCGCAACATCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCAGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGAt < 2:4538674/150‑1 (MQ=255) ccGCAACATCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTa < 2:4422957/150‑1 (MQ=255) cGCAACATCACCCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAg < 1:1794415/150‑1 (MQ=255) tCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTgc > 1:4957202/1‑150 (MQ=255) tCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTgc > 2:1737198/1‑150 (MQ=255) tCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTgc > 2:4286995/1‑150 (MQ=255) aaCCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTgcgc > 1:4596193/1‑150 (MQ=255) aaCCAGGCCTATGAGCCGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTACGGGcctcttcgcgcgcaagccctacatcacccctgtgtaggagcgggcttgccc < 1:5555202‑M1/150‑52 (MQ=255) aCCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCgg < 1:449325/109‑1 (MQ=255) aCCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTgcgcg > 2:5242051/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTACGGGcctcttcgcgcgcaagccctacatcacccctgtgtaggagcgggcttgcccgc < 1:1121639‑M1/150‑54 (MQ=255) cTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGCTGCCTGTAC‑GGccccaccgcgcgcaagccctacatcacccctgtgtaggagcgggcttgcccgcgaagagg < 1:587903‑M1/150‑61 (MQ=255) tATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTgggg > 1:1326661/1‑150 (MQ=255) gCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGccccaccgcgcgcaagccctacatcacccctgtgtaggagcgggcttgcccgcgaagaggcccgta < 1:4335482‑M1/150‑67 (MQ=255) gatgatTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGccgtacag < 1:5256224‑M2/150‑9 (MQ=255) tgatTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGccgtacaggc > 1:909702‑M2/1‑140 (MQ=255) gtttgcCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACACTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACCCAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGccgtacaggca > 1:3316606‑M2/3‑139 (MQ=255) gatTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGACCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGccgtacaggca > 1:1221993‑M2/1‑139 (MQ=255) atTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGccccaccgcgcgcaagccctacatcacccctgtgtaggagcgggcttgcccgcgaagaggcccgtacaggcaa < 2:3571917‑M1/150‑74 (MQ=255) ttGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGgcagc > 1:224364/1‑150 (MQ=255) ttGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGgcagc < 2:2508101/150‑1 (MQ=255) gCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATGGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCaa < 2:4731867/150‑1 (MQ=255) tgtgAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAg < 1:4917499/150‑1 (MQ=255) gAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCg > 2:3742757/1‑150 (MQ=255) gAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCg > 2:2043449/1‑150 (MQ=255) gTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGccccaccgcgcgcaagccctacatcacccctgtgtaggagcgggcttgcccgcgaagaggcccgtacag < 2:2079696‑M1/129‑70 (MQ=255) aCCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTa > 1:4212926/1‑150 (MQ=255) ttCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAgg < 2:1913433/150‑1 (MQ=255) ttCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAgg > 1:4633537/1‑150 (MQ=255) tGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCAt > 2:2793027/1‑150 (MQ=255) gATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCAtt < 1:4362351/150‑1 (MQ=255) cGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCATTGGc < 2:1381624/150‑1 (MQ=255) cGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCATTGGc < 2:2338606/150‑1 (MQ=255) cGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCATTGGc < 2:230045/150‑1 (MQ=255) aTGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCATTGGCTTGt > 1:719003/1‑150 (MQ=255) tGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCATTGGCTTGTc < 2:4621153/150‑1 (MQ=255) ggCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCATTGGCTTGTcc > 1:4264742/1‑150 (MQ=255) tACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCATTGGCTTGTCCCAGCCCtt > 1:3714514/1‑150 (MQ=255) cccgggCTGCTGGATCGGTTGCCGGGAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACCGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCATTGGCTTGTCCCAGCCCTTc < 2:4903445/147‑1 (MQ=255) aCAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCATTGGCTTGTCCCAGCCCTTc < 1:345740/150‑1 (MQ=255) cAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCATTGGCTTGTCCCAGCCCTTcc < 2:1806971/150‑1 (MQ=255) cAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCATTGGCTTGTCCCAGCCCTTcc > 1:4275285/1‑150 (MQ=255) cAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCATTGGCTTGTCCCAGCCCTTcc > 2:4024494/1‑150 (MQ=255) cAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCATTGGCTTGTCCCAGCCCTTcc < 1:4831574/150‑1 (MQ=255) aGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCATTGGCTTGTCCCAGCCCTTCCa < 2:4296942/150‑1 (MQ=255) aGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCATTGGCTTGTCCCAGCCCTTCCa < 1:422487/150‑1 (MQ=255) aGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCATTGGCTTGTCCCAGCCCTTCCa < 1:217478/150‑1 (MQ=255) gCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCATTGGCTTGTCCCAGCCCTTCCAGaa < 1:2220001/150‑1 (MQ=255) tgattgatCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCATTGGCTTGTCCCAGCCCTTCCAGaaca > 1:4017798/1‑150 (MQ=255) tgattgatCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCGTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCATTGGCTTGTCCCAGCCCTTCCAGaaca > 2:1440951/1‑150 (MQ=255) gattgatCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCATTGGCTTGTCCCAGCCCTTCCAGaacaa < 1:2917617/150‑1 (MQ=255) gattgatCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCATTGGCTTGTCCCAGCCCTTCCAGaacaa < 1:2365904/150‑1 (MQ=255) attgatCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCATTGGCTTGTCCCAGCCCTTCCAGaacaac > 2:2848832/1‑150 (MQ=255) cGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCATTGGCTTGTCCCAGCCCTTCCAGAACAACCATcgc < 2:2103896/150‑1 (MQ=255) ttGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGccgtacaggcaaccgatcaatcagccctgtagcgtggccatgtcgatcacgaaccggtacttcacatcaccggcaat < 2:749573‑M2/150‑78 (MQ=255) ttGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCATTGGCTTGTCCCAGCCCTTCCAGAACAACCATcgccgc > 2:1630840/1‑150 (MQ=255) ttGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCATTGGCTTGTCCCAGCCCTTCCAGAACAACCAAcgccgc > 1:2015447/1‑150 (MQ=255) ttGCCTGTAC‑GGGCCGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGccgtacaggcaaccgatcaatcagccctgtagcgtggccatgtcgatcacgaaccggtacttcacatcaccggcaat < 2:3572035‑M2/150‑78 (MQ=255) tGCCTGTAC‑GGccccaccgcgcgcaagccctacatcacccctgtgtaggagcgggcttgcccgcgaagaggcccgtacaggcaaccgatcaatcagccctgtagcgtggcgatgtcgatcacgaaccggtacttcacatcaccggcaatc > 2:1267486‑M1/1‑11 (MQ=255) tGCCTGTAC‑GGccccaccgcgcgcaagccctacatcacccctgtgtaggagcgggcttgcccgcgaagaggcccgtacaggcaaccgatcaatcagccctgtagcgtggccatgtcgatcacgaaccggtacttcacatcaccggcaatc > 1:4110726‑M1/1‑11 (MQ=255) tGCCTGTAC‑GGccccaccgcgcgcaagccctacatcacccctgtgtaggagcgggcttgcccgcgaagaggcccgtacaggcaaccgatcaatcagccctgtagcgtggccatgtcgatcacgaaccggtacttcacatcaccggcaatc > 2:1402509‑M1/1‑11 (MQ=255) tGCCTGTAC‑GGccccaccgcgcgcaagccctacatcacccctgtgtaggagcgggcttgcccgcgaagaggcccgtacaggcaaccgatcaatcagccctgtagcgtggccatgtcgatcacgaaccggtacttcacatcaccggcaatc > 2:4884175‑M1/1‑11 (MQ=255) cTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGccgtacaggcaaccgatcaatcagccctgtagcgtggccatgtcgatcacgaaccggtacttcacatcaccggcaatcatc < 2:3815960‑M2/150‑82 (MQ=255) cTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCATTGGCTTGTCCCAGCCCTTCCAGAACAACCATCGCCGCACCt > 2:3923166/1‑150 (MQ=255) tGTAC‑GGccccaccgcgcgcaagccctacatcacccctgtgtaggagcgggcttgcccgcgaagaggcccgtacaggcaaccgatcaatcagccctgtagcgtggccatgtcgatcacgaaccggtacttcacatcaccggcaatcatcc > 1:2138166‑M1/1‑7 (MQ=255) tGTAC‑GGccccaccgcgcgcaagccctacatcacccctgtgtaggagcgggcttgcccgcgaagaggcccgtacaggcaaccgatcaatcagccctgtagcgtggccatgtcgatcacgaaccggtacttcacatcaccggcaatcatcc > 1:2138200‑M1/1‑7 (MQ=255) tGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGccgtacaggcaaccgatcaatcagccctgtagcgtggccatgtcgatcacgaaccggtacttcacatcaccggcaatcatcc < 2:2452088‑M2/150‑83 (MQ=255) tGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCATTGGCTTGTCCCAGCCCTTCCAGAACAACCATCGCCGCACCTc > 2:4237995/1‑150 (MQ=255) tGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCATTGGCTTGTCCCAGCCCTTCCAGAACAACCATCGCCGCACCTc > 1:1451679/1‑150 (MQ=255) gTAC‑GGGCCTCATAGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAAAGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCATAGGCTTGTACCAGCCCTTCAAGAACAACCAACGCCGCACCTCg > 2:323737/1‑150 (MQ=255) tAC‑GGccccaccgcgcgcaagccctacatcacccctgtgtaggagcgggcttgcccgcgaagaggcccgtacaggcaaccgatcaatcagccctgtagcgtggccatgtcgatcacgaaccggtacttcacatcaccggcaatcatccgc < 1:188924‑M1/150‑146 (MQ=255) tAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGc > 1:3690839/1‑87 (MQ=255) gggCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCATTGGCTTGTCCCAGCCCTTCCAGAACAACCATCGCCGCACCTCGCCGt > 1:5146054/1‑150 (MQ=255) gggCCTCGTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCATTGGCTTGTCCCAGCCCTTCCAGAACAACCATCGCCGCACCTCGCCGt < 1:5076064/150‑1 (MQ=255) ggccccaccgcgcgcaagccctacatcacccctgtgtaggagcgggcttgcccgcgaagaggcccgtacaggcaaccgatcaatcagccctgtagcgtggccatgtcgatcacgaaccggtacttcacatcaccggcaatcatccgctca > 2:1327259‑M1/1‑2 (MQ=255) ggCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGAGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCATTGGCTTGTCCCAGCCCTTCCAGAACAACCATCGCCGCACCTCGCCGTg < 2:5329284/150‑1 (MQ=255) | CGCCGAGCACGACATCCGTTGCGATATCGAGATGCTGGATATCCGCAACATCAACCAGGCCTATGAGCGGATGATTGCCGGTGATGTGAAGTACCGGTTCGTGATCGACATGGCCACGCTACAGGGCTGATTGATCGGTTGCCTGTAC‑GGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACACAGGGGTGATGTAGGGCTTGCGCGCGGTGGGGCCGTACAGGCAGCAACGATGCAGCCGTTTTACCAGGCCATTGGCTTGTCCCAGCCCTTCCAGAACAACCATCGCCGCACCTCGCCGTG > NC_002947/2778912‑2779210 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |