| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5206576 = | 100 (0.410) | 16 (0.090) | 8/200 | NT | 26.0% | intergenic (‑65/‑115) | PP_4582/PP_4583 | membrane protein/putative Peptidase |
| ? | NC_002947 | 5206671 = | 18 (0.100) | intergenic (‑160/‑20) | PP_4582/PP_4583 | membrane protein/putative Peptidase | |||||
Only 100 of 157 total aligned reads displayed.
GGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGAC > NC_002947/5206428‑5206685 | ggTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGttt < 2:1576623/150‑1 (MQ=255) cttcctggtaggcgttttcagcttgcaggtaagcgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTg < 1:5582619‑M1/3‑1 (MQ=255) ttcctggtaggcgttttcagcttgcaggtaagcgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGc > 2:5482516‑M1/147‑150 (MQ=255) tcctggtaggcgttttcagcttgcaggtaagcgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggggTTGcc < 2:2717117‑M1/5‑1 (MQ=255) cctggtaggcgttttcagcttgcaggtaagcgagtgcctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCt > 1:940805‑M1/145‑150 (MQ=255) cctggtaggcgttttcagcttgcaggtaagcgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCt > 2:3313771‑M1/145‑150 (MQ=255) aGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCt < 1:228728/150‑1 (MQ=255) aGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCt < 1:2025351/150‑1 (MQ=255) gCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCtg > 2:623099/1‑150 (MQ=255) tggtaggcgttttcagcttgcaggtaagcgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCtgt < 2:1138960‑M1/8‑1 (MQ=255) aGCCCACCAGCAGGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCgg < 1:1115528/150‑1 (MQ=255) gcgttttcagcttgcaggtaagcgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGc > 2:1692858‑M1/137‑150 (MQ=255) gCCCACCAGCAGGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGc < 1:1250281/150‑1 (MQ=255) gCCCACCAGCAGGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGc < 2:261753/150‑1 (MQ=255) ccaccaGCAGGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCct > 2:1099955/1‑150 (MQ=255) caccaGCAGGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCctc > 2:3782648/1‑150 (MQ=255) tcagcttgcaggtaagcgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagtt > 1:2648630‑M1/131‑132 (MQ=255) tcagcttgcaggtaagcgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTc > 2:248503‑M1/131‑150 (MQ=255) tcagcttgcaggtaagcgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTc < 1:5278604‑M1/20‑1 (MQ=255) gcagGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTcgc < 1:1099955/150‑1 (MQ=255) gcagGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTcgc < 2:381795/150‑1 (MQ=255) gcagGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTcgc < 1:2738997/150‑1 (MQ=255) gcagGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTcgc < 1:434708/150‑1 (MQ=255) agcttgcaggtaagcgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTcgc > 2:3844947‑M1/129‑150 (MQ=255) cttgcaggtaagcgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCgg > 1:2450992‑M1/127‑150 (MQ=255) agGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCgg < 2:1366335/150‑1 (MQ=255) agGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCgg < 1:3542732/150‑1 (MQ=255) ttgcaggtaagcgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCggg > 2:4391997‑M1/126‑150 (MQ=255) tgcaggtaagcgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGt > 1:3863529‑M1/125‑150 (MQ=255) tgcaggtaagcgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGt > 1:463569‑M1/125‑150 (MQ=255) caggtaagcgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTaa > 2:4519128‑M1/123‑150 (MQ=255) aCCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTaa > 1:4807095/1‑150 (MQ=255) ggtaagcgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAc > 1:1541112‑M1/121‑150 (MQ=255) ggtaagcgagtacctcgggggtgtcgcgctgttgcagccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAc > 1:114341‑M1/121‑150 (MQ=255) 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cggcTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTcc < 1:3195390/150‑1 (MQ=255) gcTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa < 1:1533619/150‑1 (MQ=255) cTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAc < 2:2864072/150‑1 (MQ=255) aCTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCt < 1:3782648/150‑1 (MQ=255) tGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCg < 2:4584341/150‑1 (MQ=255) tGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCg < 2:4584371/150‑1 (MQ=255) cGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGt < 2:1506900/150‑1 (MQ=255) cGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGt < 1:2061561/150‑1 (MQ=255) cGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGt < 1:442987/150‑1 (MQ=255) cGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGAAAGCCAGGAAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGt < 2:4322946/150‑1 (MQ=255) 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gtgtAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCggg < 1:1627296/150‑1 (MQ=255) gtgtAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCggg < 1:3513147/150‑1 (MQ=255) gtgtAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCggg < 2:619638/150‑1 (MQ=255) gccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCggg > 1:5017426‑M1/85‑150 (MQ=255) gccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCggg > 1:4883616‑M1/85‑150 (MQ=255) gccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCggg > 1:3155202‑M1/85‑150 (MQ=255) ccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGt > 2:4918314‑M1/84‑150 (MQ=255) ccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGt > 1:511522‑M1/84‑150 (MQ=255) ccaggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGt > 2:643989‑M1/84‑150 (MQ=255) gtAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGtt < 2:1537041/150‑1 (MQ=255) ggcatacgggtcggtggcctggtcggcttgggcaatcgggggttggggcttggttggcattgaaggtctcttgattggagTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTa > 2:861066‑M1/81‑150 (MQ=255) gTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTAc < 1:3676320/150‑1 (MQ=255) tCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTAcc < 1:2487477/150‑1 (MQ=255) cGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTGTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTAccc < 2:3438770/150‑1 (MQ=255) gTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCcg > 2:1852383/1‑150 (MQ=255) 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GGTGAGCTTGAAGCCCACCAGCAGGCACCCTAAGGCGGCTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGAC > NC_002947/5206428‑5206685 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |