New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5524822 = | 210 (0.870) | 12 (0.050) | 9/254 | NT | 5.6% | intergenic (‑96/‑130) | PP_4852/PP_4853 | AraC family transcriptional regulator/DMT superfamily permease |
? | NC_002947 | 5524907 = | 210 (0.940) | intergenic (‑181/‑45) | PP_4852/PP_4853 | AraC family transcriptional regulator/DMT superfamily permease |
Only 100 of 259 total aligned reads displayed.
ACCGGGGCCGGCAGTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGAACTACCTGTTCCCCC > NC_002947/5524674‑5524970 | gaagccgatctccgcagggtggatggcaccggcggacatcttggtgaccacggtgttgccggcccagatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgctttgcagcCCt > 1:3916748‑M1/148‑150 (MQ=255) cGGGGCCGGCAGTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCtt > 2:2671014/1‑150 (MQ=255) cGGGGCCGGCAGTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCtt > 2:1502014/1‑150 (MQ=255) ggggCCGGCAGTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTc < 1:3343702/150‑1 (MQ=255) gccgatctccgcagggtggatggcaccggcggacatcttggtgaccacggtgttgccggcccagatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgctttgcagcCCTTcg < 2:402089‑M1/6‑1 (MQ=255) gccgatctccgcagggtggatggcaccggcggacatcttggtgaccacggtgttgccggcccagatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgctttgcagcCCTTcg < 2:1685968‑M1/6‑1 (MQ=255) gccgatctccgcagggtggatggcaccggcggacatcttggtgaccacggtgttgccggcccagatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgctttgcagcCCTTcg < 1:272056‑M1/6‑1 (MQ=255) ggCCGGCAGTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTcgc < 1:4402861/150‑1 (MQ=255) ccgatctccgcagggtggatggcaccggcggacatcttggtgaccacggtgttgccggcccagatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgctttgcagcCCTTcgc > 1:1229067‑M1/144‑150 (MQ=255) ccgatctccgcagggtggatggcaccggcggacatcttggtgaccacggtgttgccggcccagatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgctttgcagcCCTTcgc < 2:2396772‑M1/7‑1 (MQ=255) cgatctccgcagggtggatggcaccggcggacatcttggtgaccacggtgttgccggcccagatgaggatggcggtgagggggaacaggttgttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgcaaagcagccccattcc > 2:3130247‑M1/143‑144 (MQ=255) gatctccgcagggtggatggcaccggcggacatcttggtgaccacggtgttgccggcccagatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgctttgcagcCCTTCGCgg > 2:4720218‑M1/142‑150 (MQ=255) ccGGCAGTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCgg < 2:3999180/150‑1 (MQ=255) gTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTcgc > 2:505024/1‑137 (MQ=255) gTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTcgc < 1:505024/137‑1 (MQ=255) aaCTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCca < 1:457988/150‑1 (MQ=255) aCTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTGTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCcac > 2:4468111/1‑150 (MQ=255) cTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCcaca < 2:5254063/150‑1 (MQ=255) 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ggggATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGa > 1:4521496/1‑150 (MQ=255) accggcggacatcttggtgaccacggtgttgccggcccagatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgccttgcaggCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATc < 2:2844658‑M1/30‑1 (MQ=255) gATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCt < 2:4111778/150‑1 (MQ=255) gAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCa < 2:736303/150‑1 (MQ=255) gAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCa > 2:1801057/1‑150 (MQ=255) tATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCt < 1:3805422/150‑1 (MQ=255) cgcgGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGc < 2:1755080/150‑1 (MQ=255) cgcgGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGc < 1:1172350/150‑1 (MQ=255) cgcgGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGc < 1:356985/150‑1 (MQ=255) cgGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCt < 2:5199084/150‑1 (MQ=255) ccacggtgttgccggcccagatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgcaaagcagccccatt > 1:3732772‑M1/101‑102 (MQ=255) tGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATcc > 1:4637526/1‑150 (MQ=255) gTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATccc < 1:3017132/150‑1 (MQ=255) tCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCCCACGATCTGCGCCCGCCTCCAGGCCGGTGTATcccc > 1:2659113/1‑150 (MQ=255) tCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATcccc > 2:244994/1‑150 (MQ=255) tCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATcccc > 2:5227663/1‑150 (MQ=255) tGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCg < 1:2540784/150‑1 (MQ=255) gCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGt < 1:3678117/150‑1 (MQ=255) gCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCGCCAGGCCTGTGTATCCCCCGt > 1:5442561/1‑150 (MQ=255) aGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCg > 2:829600/1‑150 (MQ=255) gggTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCgg < 1:639354/150‑1 (MQ=255) 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agacaCTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCa > 2:3461866/1‑150 (MQ=255) agacaCTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCa > 2:272056/1‑150 (MQ=255) agacaCTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCa < 1:4551436/150‑1 (MQ=255) acacTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGATGCAAAGCAGCCCCATTCCAGc > 2:5428807/1‑150 (MQ=255) tCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCCCACCCACACGATCTGCGCCCCCCACCACGCCTGTGTATACCCCGGAGGGGCGGGGTCACCCCCGAAGGGCGGCCAAGCCCCCCCCATCCAGccccc > 1:2396772/1‑150 (MQ=255) gATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCACCCACACGATCTGCGCCAGCCTCCACGCCAGTGTATCCCCCCGAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGGTGCAAAGCAACCCCCATACAcccccccc > 1:4875523/1‑148 (MQ=37) ataataCAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGc < 1:4695786/150‑1 (MQ=255) ataataCAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGc < 1:1813482/150‑1 (MQ=255) aataCAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCCCACGAGCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGGGCGGGTTGACCCGCGAAGGGCGGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCCGccg > 1:599499/1‑148 (MQ=255) aataCAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGa < 1:1502014/150‑1 (MQ=255) aGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCCCAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCAATCCAGCCCCCCGCGAGTAcc > 1:3166552/1‑150 (MQ=255) aGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTAcc < 1:1682199/150‑1 (MQ=255) gCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCGCGTAGGTGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAATGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTagcgt > 2:4971673/1‑146 (MQ=255) gCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCct > 2:3757681/1‑150 (MQ=255) cTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCctgc < 1:2082409/150‑1 (MQ=255) tATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCctgct > 2:4374392/1‑150 (MQ=255) aTCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCctgctg < 1:5176595/150‑1 (MQ=255) cGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCa > 2:862379/1‑150 (MQ=255) aGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTCTCCCCCGTAGGAGCGGGGTCACCCGCGAAGGGCTGCACAGCCGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCagg > 2:5119432/1‑148 (MQ=255) aGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCAGTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATg > 2:4329797/1‑150 (MQ=255) ggACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACCGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGGAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGa > 2:4769296/1‑150 (MQ=255) ggACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGa > 2:3579195/1‑150 (MQ=255) cccTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGAAc < 2:4594221/149‑1 (MQ=255) aCCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGAAc < 1:3208842/150‑1 (MQ=255) ccTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCCGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCCATCCAGCCCCCAGCGAGTACCCAGCGGCATGAAca > 2:21361/1‑149 (MQ=38) cTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAACCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGAACTa > 2:4916687/1‑150 (MQ=255) cTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCCCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCGCCAGGCCGGTGTATCCCCCCTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCCAAGCAGCCCCCTTCCCGCCCCCCCCGAGGTCCCGGCTGCAAGAAcaa > 1:4306308/1‑148 (MQ=25) gCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGAACTAcc < 1:2514399/150‑1 (MQ=255) ccTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGAACTACCt < 1:4287607/150‑1 (MQ=255) aGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCATCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTAACCTGCTGCATGAACTACCAGTTccc > 2:971022/1‑150 (MQ=255) gCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGAACTACCTGTTccccc < 1:336648/150‑1 (MQ=255) | ACCGGGGCCGGCAGTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGAACTACCTGTTCCCCC > NC_002947/5524674‑5524970 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |