New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 82065 = | 284 (1.180) | 14 (0.060) | 4/254 | NT | 6.8% | intergenic (+42/+86) | PP_0071/qor‑I | hypothetical protein/quinone oxidoreductase |
? | NC_002947 | 5599167 = | 120 (0.540) | intergenic (‑114/+31) | PP_4921/thiC | NCS1 family transporter/phosphomethylpyrimidine synthase |
Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
CTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCT > NC_002947/5599036‑5599316 | ctggctggGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCAAGCACCGCCGTGCGTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTa > 2:1469244/1‑150 (MQ=255) tggctggGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTaa > 2:2842850/1‑150 (MQ=255) gggctggGTGAGGTCATGGTCATGTCCGCCGGAGTGATGTTCAGTGGCAGACCCCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGACCACCGGCAACGCCGGTGCCCTGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTaa < 2:409045/149‑1 (MQ=25) ggctggGTTATGTCATGGTCTTGGCCGCCGGTGTGTTTTTATGTGGAATACACCACCCTGTGGGTGCGGGCTTGCCCGCCAACACCGGCAACGCGGGGGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGAAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAg < 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tcatggtcatgTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCCTGCACCCCCGTGCGTGCTTCGCGGGCCAGCCCCCGCCCCCAGGGTGAGGTG‑cggcggggt > 2:213828/1‑147 (MQ=25) tcagggtcctgTCCGCCGGAGTGTTGTTACGTGGCATACACCACCCTGGGGGCGCGGGCTGGCCCGCGAACCCCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTCCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGttt < 2:1215273/150‑1 (MQ=25) catggtcatgTCCGCTGGTGTGATTTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGGTTGCCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCTTGCCCCGCTGTGCTTGCTTCGCGGGAAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTa < 2:1980283/150‑1 (MQ=37) gtcatgTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGCACCCCGGCCAAGCCGGGGCCATGCACCGCCGGGCATGCGTCGCGGGCAAGCCCCCGCCCCCACGGGAAGGGG‑CTGCGGGTTAGAcg > 1:3183044/1‑149 (MQ=25) cAGTAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACa < 2:2223792/150‑1 (MQ=255) gAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCCGCAAAGCCCGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCGTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGGCAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAgct > 2:5200196/1‑150 (MQ=37) tttttGTTACGGGGAATACACCCCCGGGTGGGCGGGGGCTGGCCGGCTACCCCCGCCAACGCGGGGCCCCTCCACCGCCGTGCTTGCTGGGCGGGCACCCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAgctgg < 1:309783/146‑1 (MQ=255) tgttGTTATGTGGCATACACCACCGTGTGGGTGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGATTGCTGCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAgctggc < 1:3670336/147‑1 (MQ=37) aTGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCCAAGCCCGTGCCATGCCCCGCAGGGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCCCTCCCACCGGGGAAGGTG‑CTGCGGGTTAGACGTTGTGGTACAgcgggctg > 1:1823923/1‑150 (MQ=25) gttccgTGGCATCCCCCACCCTGTGGGCGCGGGCTGGCCCGCGAACCCCGGCAAAGCCGGTGCCCTGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGcc < 2:905045/145‑1 (MQ=37) 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cGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCAc > 2:785437/1‑150 (MQ=255) cGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCAc > 2:3565565/1‑150 (MQ=255) gggCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCCCCGGGGCCGGTG‑CTGCGGTGTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACg > 2:283815/1‑150 (MQ=37) gggCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACg > 2:1284823/1‑150 (MQ=255) gggCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACg > 2:1284814/1‑150 (MQ=255) 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aCCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCt > 1:4024485/1‑150 (MQ=255) aCCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCt > 1:5309907/1‑150 (MQ=255) aCCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCt > 2:1727945/1‑150 (MQ=255) aCCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCt > 1:918781/1‑150 (MQ=255) cGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTg < 2:1808544/150‑1 (MQ=255) cGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTg < 1:4983479/150‑1 (MQ=255) cGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTg < 2:3994629/150‑1 (MQ=255) cAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGc > 2:4626144/1‑150 (MQ=255) cAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGc > 2:2142350/1‑150 (MQ=255) gTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAg > 2:5557739/1‑150 (MQ=255) tgcttgctTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGc < 1:2798575/150‑1 (MQ=255) tgcttgctTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGc < 2:1931201/150‑1 (MQ=255) tgcttgctTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGc < 2:3853885/150‑1 (MQ=255) cttgcttCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGt > 2:3745857/1‑150 (MQ=255) cttgcttCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGt > 1:4895369/1‑150 (MQ=255) ttgcttCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTa > 1:2420952/1‑150 (MQ=255) gcttCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACt > 2:2356904/1‑150 (MQ=255) ttcgcgggcaAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCa > 2:4634049‑M2/11‑150 (MQ=255) ttcgcgggcaAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCa > 2:4633650‑M2/11‑150 (MQ=255) ttcgcgggcaAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCa > 2:4420932‑M2/11‑150 (MQ=255) ttcgcgggcaAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCa > 1:943152‑M2/11‑150 (MQ=255) ggagcgggctTGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCa > 2:4421381‑M2/11‑150 (MQ=255) tcgcgggcaCGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCAc < 1:5331583‑M2/141‑1 (MQ=255) tcgcgggcaAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCAc > 2:658482‑M2/10‑150 (MQ=255) gcgggcaAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGc < 2:917051‑M2/143‑1 (MQ=255) | CTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTG‑CTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCT > NC_002947/5599036‑5599316 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |