New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 1143486 = | 171 (0.710) | 21 (0.100) | 8/246 | NT | 12.0% | intergenic (‑62/+103) | arcC/arcB | carbamate kinase/ornithine carbamoyltransferase |
? | NC_002947 | 1143575 = | 154 (0.710) | intergenic (‑151/+14) | arcC/arcB | carbamate kinase/ornithine carbamoyltransferase |
Only 100 of 234 total aligned reads displayed.
TGGAATGTCCTTTAGCGAAAGAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGGGTA > NC_002947/1143426‑1143723 | tgGAATGTCCTTTAGCGAAAGAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAgg > 2:952137/1‑150 (MQ=255) aTGTCCTTTAGCGAAAGAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGAGGCTGACGCCTTCGCGGGAACGCCCGCTCCCACAGGGACt > 2:3263336/1‑150 (MQ=255) tGTCCTTTCGCGAAAGAATGAAGGGACTGTGGCTGCAGGGAAGGTGCGGTGTTCGCTGTGGGCGGGGGCATGCCCGCGACGTGGCCAGACCTGACATCATCGAGGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTg < 2:2481061/150‑1 (MQ=255) ggTCCTTTAGCGAACGAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGATGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGCGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCCTCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTg < 2:3751194/149‑1 (MQ=255) gTCCTTTAGCGAAAGAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGc > 1:5531506/1‑150 (MQ=255) tCCTTTAGCGAAAGAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCg > 1:2273399/1‑150 (MQ=255) cTTTAGCGAAAGAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCggg > 1:3713806/1‑150 (MQ=255) ctaaaGAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGACGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGCCGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACtt < 1:821250/148‑1 (MQ=255) cGAAAGAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACtt > 1:3199168/1‑150 (MQ=255) gAAAGAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTta > 2:4377579/1‑150 (MQ=255) gAAAGAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTta > 2:3015610/1‑150 (MQ=255) aaaGAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTtat > 2:4604616/1‑150 (MQ=255) aaGAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTtata > 1:1310245/1‑150 (MQ=255) gaatgaatGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGa > 2:3786136/1‑150 (MQ=255) aatgaatgGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGAt > 2:1346092/1‑150 (MQ=255) tgattgGACTGTCGCTGCAGGGACGGTGCGGGGTTCGGTGGGGGCGGGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCa < 1:2971714/150‑1 (MQ=255) tgaatgGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGTTGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCa < 2:2639334/150‑1 (MQ=255) gaatgGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAg > 2:717739/1‑150 (MQ=255) gaatgGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAg > 2:597624/1‑150 (MQ=255) tgGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGccc > 1:424487/1‑149 (MQ=255) gACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAgg < 2:4521698/150‑1 (MQ=255) tGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTc > 2:4436110/1‑150 (MQ=255) tGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTc < 2:5484705/150‑1 (MQ=255) 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ttCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTc > 2:1503632/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTc > 2:1869531/1‑150 (MQ=255) tCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCg > 2:1491868/1‑150 (MQ=255) gagcgggcgtgcccgctcccacagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCCGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACATCg > 2:2270397‑M2/25‑150 (MQ=255) gagcgggcgtgcccgctcccacagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCg > 2:4196627‑M2/25‑150 (MQ=255) cACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGt > 1:3403895/1‑150 (MQ=255) gtgcccgctcccacagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGtt > 1:2001386‑M2/17‑150 (MQ=255) aCGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGtt > 1:757532/1‑150 (MQ=255) aCGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGtt < 2:270127/150‑1 (MQ=255) aCGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGtt < 1:872921/150‑1 (MQ=255) aCGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGtt < 2:1310245/150‑1 (MQ=255) cGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTg < 2:5531506/150‑1 (MQ=255) gcccgctcccacagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTgg > 2:4457891‑M2/15‑150 (MQ=255) gcccgctcccacagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTgg > 1:1873925‑M2/15‑150 (MQ=255) cccgctcccacagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGc > 2:1481311‑M2/14‑150 (MQ=255) cccacagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTc < 2:2273399‑M2/143‑1 (MQ=255) ccacagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGTCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTcc > 1:5148643‑M2/7‑150 (MQ=255) ccacagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGt < 2:484085‑M2/112‑1 (MQ=255) ccacagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTcc > 2:5218610‑M2/7‑150 (MQ=255) ccacagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTcc > 2:63111‑M2/7‑150 (MQ=255) ccacagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCAACGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTcc > 2:2943178‑M2/7‑150 (MQ=255) acagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCgg < 1:4196627‑M2/146‑1 (MQ=255) acagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCgg > 1:2356106‑M2/5‑150 (MQ=255) acagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCgg < 2:125822‑M2/146‑1 (MQ=255) acagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCgg > 1:4833896‑M2/5‑150 (MQ=255) agGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGGGt < 1:717739‑M2/148‑1 (MQ=255) | TGGAATGTCCTTTAGCGAAAGAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGGGTA > NC_002947/1143426‑1143723 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |