| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | 1424596 = | 43 (0.230) | intergenic (‑130/+7) | PP_1242/PP_1244 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
TTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGCCTGCATCACGATCGAGCTGTGGGCGGTGGGTTTGAGTT > NC_002947/1424448‑1424745 | ttgtgttgtCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCCCGCCCCCTCCCACAGGGACGGTGGAGTGCGTGTCGGCTGTGGTGACCCAGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTg > 1:841037/1‑150 (MQ=39) ttgtCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCCGCTCCCCCCGGTACTGTGCAGGGCGTGTCGGGTGTGGTGGCCCCGGGGGGGCGGGCCTGCCCGCGCAGAGGCCGGaacag > 1:4056269/1‑146 (MQ=255) tgtCGGTGGGCTTTGTTTTGTTTCCCTGTTTTCTGGGTTGCGTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACCGGTAGTGTGCTGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGTGGGGGGGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGc < 2:2793227/150‑1 (MQ=37) 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ttttttttCCCTGGATTGTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGGGGGCACGCCCGCTCCAACCGGTACTGTGCAGGGCGTGCGGGCTGTGGTGACCCTGTGGTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGa < 2:791064/150‑1 (MQ=255) ggcttgtGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCCCGCCCGCTCCCACTGGTAGTGTGCTGTGCGTGCCGGGTGTGGGGCCCCTGGGGGCGCGGGCGTGCCCGCGACGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGt < 1:2805315/144‑1 (MQ=255) ttCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGGACGCCCGCTCCCCCCGGTACTGTGCAGTGCGTGACCGCTGGGGTGACCCGGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCAGACCGGCGAAAGCAACGGGTGAGGCTCTGTGGGTgaa > 1:5133024/1‑150 (MQ=255) ggTGGCCTGGGGTGGCCTGTTCGCGGGCAGGCCCGCCCCCACCGGTAGTGTGCTGGGGGGGCCGGCGGGGGTGACCCGGGGGGCGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGa < 1:3650960/150‑1 (MQ=255) tGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCaa > 2:3169719/1‑150 (MQ=255) 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gccTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGCCTGCATCACGATCGAGCTGTGGGCGGTGGGTTTGa < 2:2778634‑M2/147‑1 (MQ=255) gccTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGCCTGCATCACGATCGAGCTGTGGGCGGTGGGTTTGa < 1:348273‑M2/147‑1 (MQ=255) gccTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGCCTGCATCACGATCGAGCTGTGGGCGGTGGGTTTGa < 1:4773205‑M2/147‑1 (MQ=255) gccTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGCCTGCATCACGATCGAGCTGTGGGCGGTGGGTTTGa > 2:5570365‑M2/4‑150 (MQ=255) gccTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGCCTGCATCACGATCGAGCTGTGGGCGGTGGGTTTGa < 1:792024‑M2/147‑1 (MQ=255) gccTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGCCTGCATCACGATCGAGCTGTGGGCGGTGGGTTTGa > 1:1239879‑M2/4‑150 (MQ=255) gccTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGCCTGCATCACGATCGAGCTGTGGGCGGTGGGTTTGa < 2:2549943‑M2/147‑1 (MQ=255) gccTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGCCTGCATCACGATCGAGCTGTGGGCGGCGGGTTTGa > 2:2439714‑M2/4‑150 (MQ=255) tGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGCCTGCATCACGATCGAGCTGTGGGCGGTGGGTTTGAGtt < 1:2328159/150‑1 (MQ=255) | TTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCGACTCGACCAGCCCCTGTACCGCTTCCATTTCATGGATCACGGCCTGCATCACGATCGAGCTGTGGGCGGTGGGTTTGAGTT > NC_002947/1424448‑1424745 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |