| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
CGGATGACTTCTTCGACCGGCCGCGCAGTGACCGGACCAAGTTGTTCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCATCACCTCGATGGTTA > NC_002947/1491873‑1492170 | cGGATGACTTCTTCGACCGGCCGCGCAGTGACCGGACCAAGTTGTTCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTc > 1:2807395‑M2/1‑149 (MQ=255) ggATGACTTCTTCGACCGGCCGCGCAGTGACCGGACCAAGTTGTTCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTcc > 2:3556213‑M2/1‑148 (MQ=255) gATGACTTCTTCGACCGGCCGCGCAGTGACCGGACCAAGTTGTTCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTcct > 1:2351261‑M2/1‑147 (MQ=255) 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tGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCgg > 2:4632698/1‑113 (MQ=255) tGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCATCACCTc > 2:1239203/1‑150 (MQ=255) tGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCATCACCTc > 2:3850471/1‑150 (MQ=255) ggCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCG‑AAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTATCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGAACAGCTGCAACTGCTGCCCGTTGAGAATCACCTc > 2:2274266/2‑150 (MQ=39) gCGTAATTCCTGAGGGATCGGGAGTGCCCGCG‑AAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTAATTACTCTTCATTGCTGGAAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGACCAACATCGGCGATCAGCATCAACTGATGCCCGATGCGCATCACCTCg > 2:2716473/1‑150 (MQ=255) 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tCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCATCACCTCGATGGTTa > 2:5463476/1‑150 (MQ=255) | CGGATGACTTCTTCGACCGGCCGCGCAGTGACCGGACCAAGTTGTTCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCATCACCTCGATGGTTA > NC_002947/1491873‑1492170 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |