| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4164076 = | 109 (0.450) | 21 (0.100) | 13/242 | NT | 15.7% | intergenic (+31/‑178) | PP_3661/PP_3662 | membrane protein/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 4164136 = | 129 (0.600) | intergenic (+91/‑118) | PP_3661/PP_3662 | membrane protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
TGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCTCAACGCCATGTCATCAATGCATCCG > NC_002947/4163989‑4164284 | tgGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCAc < 1:904095/150‑1 (MQ=255)tgGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCAc < 1:694126/150‑1 (MQ=255) ggCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATGACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCAcc < 2:290498/150‑1 (MQ=255) ttGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGaa < 2:1539692/150‑1 (MQ=255) gtGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGaa < 2:4570237/149‑1 (MQ=255) caccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcctgcttcgcgggtaAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGaa > 1:5065570‑M1/81‑150 (MQ=255) ggggCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAgcaggca < 2:4200116/150‑1 (MQ=255) cTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGATGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGAAAACCCGCTCCTACTGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTc < 1:2883674/150‑1 (MQ=255) tGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGACGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCg < 1:4770534/150‑1 (MQ=255) cGATTACCCTGGGGGTGCTGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACCGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGTGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCTGtc < 2:3220846/150‑1 (MQ=255) gATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCGTCGC‑GGGTAAAACCCCGACAAAACGGGGGTGCTGCCCAGAAGACCGCAAGGCCCCGGTAGGAGCCGGGTCACCCCCGAAGCAGGCCGCGCCGtcg > 2:3260503/1‑149 (MQ=255) ttACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCGGCTTCGC‑GGGTAAAACCCCGCCGACAGGTGGGTGCTGCCCAGAAGGACGCAAGGCCCCGGTGGGAGCGGGGTCACCCCCCCAGCAGGCAGCGCgggggga > 2:897908/1‑145 (MQ=255) tACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAACCCCGCTCCTCCCGGTGGGTGCTGCCCTGCCGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCaa < 2:3181685/150‑1 (MQ=255) tACCCTGGGGGCGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCaa < 1:4659006/150‑1 (MQ=255) gggggacggcaacgcggggggctgtgaaaaaccttgagaccgtgtgggctgcttcgggggtaAACCCGCTCCTACCGGTGGGTGCGGCCCTGACGACGGCACGGCCCCTGTTGGAGGGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCa > 1:5194094‑M1/63‑150 (MQ=255) aCCCTGGGGGTGCAGACGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGTTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTTGGAGCGGGTTCACCCGCTAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAg < 1:1604209/150‑1 (MQ=255) aCCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACCGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAg < 2:1645657/150‑1 (MQ=255) cTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGtt < 2:4611957/150‑1 (MQ=255) tGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGttt < 2:548426/150‑1 (MQ=255) gggggTGCAGATGCTGTTGGGCTGAGTGGAGCCCGAGTCGGCTGCTTCGG‑GGGTAAACCCGCTCCTCCCGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCACGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGtttt < 1:3059847/150‑1 (MQ=255) ggTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCGTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACCGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTca < 1:4178686/150‑1 (MQ=255) aGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCGTCGCGGGGTAAACCC‑CACCAACAGGTGGGTGCGGCCCCGGATACCGCCCGGCCCCGGGGGGCGCGGGTTCAACCCCCCACCAGGCCGCGCGGGCGCAAGGTTTTTTAAAGcc > 2:3024695/1‑150 (MQ=255) aaGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGGGGGGTAGC‑CGGGAAAACCCCGCCCACACGGGGGTGGGGCCCAGCAGCCGGCACGGCCCCCGGAGGAGCGGGGTCACCCCCCAAGCCCGCCCCGCGGGCTCCACGGTTTTGACACcccc > 2:2096188/1‑150 (MQ=255) gTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCAc < 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ttCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGAAGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGgtggtg > 1:2459876/1‑150 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCaaa < 2:88854/150‑1 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCaaa < 1:5619483/150‑1 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGgtgt > 2:659384/1‑144 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGgtgt < 1:659384/144‑1 (MQ=255) 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cctgtaggagcgggttCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCTCAACGCCATg < 2:1966311‑M2/134‑1 (MQ=255) ctgtaggagcgggttTACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCTCAACGCCATGt > 2:1157884‑M2/16‑150 (MQ=255) taggagcgggttCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCTCAACGCCATGtcat > 2:925375‑M2/13‑150 (MQ=255) taggagcgggttCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCTCAACGCCATGtcat < 1:83962‑M2/138‑1 (MQ=255) ggagcgggttCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCTCAACGCCATGtcatca > 1:1061198‑M2/11‑150 (MQ=255) ggagcgggttCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCTCAACGCCATGtcatca < 2:3491576‑M2/140‑1 (MQ=255) gagcgggttCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTcc > 2:5137321‑M2/10‑68 (MQ=255) gagcgggttCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTcc < 1:5137321‑M2/59‑1 (MQ=255) agcgggttCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCTCAACGCCATGTCATCAAt < 2:3957807‑M2/142‑1 (MQ=255) gcgggttCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCTCAACGCCATGTCATCAATg > 1:1536958‑M2/8‑150 (MQ=255) cgggttCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCTCAACGCCATGTCATCAAtga > 2:4315887‑M2/7‑149 (MQ=255) cgggttCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCTCAACGCCATGTCATCAATGc > 2:1479639‑M2/7‑150 (MQ=255) ttCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCTCAACGCCATGTCATCAATGCATcc < 1:3578451‑M2/148‑1 (MQ=255) | TGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCTCAACGCCATGTCATCAATGCATCCG > NC_002947/4163989‑4164284 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |