| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 6067128 | 241 (1.000) | 16 (0.070) | 13/268 | NT | 6.2% | coding (581/1149 nt) | alkT | rubredoxin‑NAD(+) reductase |
| ? | NC_002947 | = 6067169 | 248 (1.050) | coding (540/1149 nt) | alkT | rubredoxin‑NAD(+) reductase | |||||
Only 100 of 286 total aligned reads displayed.
CAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAGTACACGCTGCTTGCCAGCGGCGGCAGCACGGAAGCGTGCGTAGTCTTC > NC_002947/6067020‑6067318 | cAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTc < 2:4097757/150‑1 (MQ=255) aGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCg < 1:4761416‑M2/150‑2 (MQ=255) gCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCggc < 2:1888953‑M2/150‑4 (MQ=255) 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cGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACgg < 1:2725256/150‑1 (MQ=255) gACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGgc < 1:4496998/150‑1 (MQ=255) gACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGgc > 2:55437/1‑150 (MQ=255) gACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGgc > 2:204700/1‑150 (MQ=255) aCAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGgcg > 1:1501173/1‑150 (MQ=255) 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gCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCggctggagggcctgggtgtacgcttccacctggggccggtgctgacccgacttcagcaggtgactcaaggcctggaggcgcacttgtcggacggcagcgtgatcgc < 1:3094999‑M2/150‑107 (MQ=255) cccACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAGTACACg < 2:1365381/150‑1 (MQ=255) cACCCAGCACACCCGCCGCAGCGGCCGGCTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGCCGCCACAACGTCCACCATGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAGTACACgct < 2:5036561/150‑1 (MQ=255) ccTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCggctggagggcctgggtgtacgcttccacctggggccggtgctgacccgtcttca > 2:487790‑M2/1‑38 (MQ=255) ccTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAGTACACgctgct > 1:1918377/1‑150 (MQ=255) cTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAGTACACGCTGCtt > 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ccgccgCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAGTACACGCTGCTTGCCAgcgg > 1:3484793/1‑150 (MQ=255) gccgcAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAGTACACGCTGCTTGCCAgcggcg > 2:2785204/1‑150 (MQ=255) cgcAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAGTACACGCTGCTTGCCAGCggcggc < 1:554081/150‑1 (MQ=255) cgcAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAGTACACGCTGCTTGCCAGCggcggc < 1:2429969/150‑1 (MQ=255) aGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAGTACACGCTGCTTGCCAGCGGCGgcagc > 2:5108654/1‑150 (MQ=255) aGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAGTACACGCTGCTTGCCAGCGGCGgcagc < 2:4705629/150‑1 (MQ=255) cGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAGTACACGCTGCTTGCCAGCGGCGGCAGCAc < 2:1776172/150‑1 (MQ=255) ggCCGGGTGCAGCAGGGTCggctggagggcctgggtgtacgcttccacctggggccggtgctgacccgtcttcagcaggtgactcaaggcctggaggcgcacttgtcggacggcagcgtgatcgcctgcgacctggtggtttcggccatc > 1:1863596‑M2/1‑19 (MQ=255) gTGCAGCAGGGTCGGTATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAGTACACGCTGCTTGCCAGCGGCGGCAGCACGGAAgcg < 2:1427281/150‑1 (MQ=255) gTGCAGCAGGGTCGGTATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAGTACACGCTGCTTGCCAGCGGCGGCAGCACGGAAgcg < 2:5379697/150‑1 (MQ=255) gTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAGTACACGCTGCTTGCCAGCGGCGGCAGCACGGAAgcg > 1:905220/1‑150 (MQ=255) cagGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAGTACACGCTGCTTGCCAGCGGCGGCAGCACGGAAGCGTGCGTa < 1:2037107/150‑1 (MQ=255) cagGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAGTACACGCTGCTTGCCAGCGGCGGCAGCACGGAAGCGTGCGTa < 1:418216/150‑1 (MQ=255) gggTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAGTACACGCTGCTTGCCAGCGGCGGCAGCACGGAAGCGTGCGTAGt > 2:2869750/1‑150 (MQ=255) ggTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAGTACACGCTGCTTGCCAGCGGCGGCAGCACGGAAGCGTGCGTAGTc < 2:126763/150‑1 (MQ=255) cGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAGTACACGCTGCTTGCCAGCGGCGGCAGCACGGAAGCGTGCGTAGTCTTc < 2:5446619/150‑1 (MQ=255) | CAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAGTACACGCTGCTTGCCAGCGGCGGCAGCACGGAAGCGTGCGTAGTCTTC > NC_002947/6067020‑6067318 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |