Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,279,405 | C→G | 5.8% | R123R (CGC→CGG) | glcD → | glycolate oxidase FAD‑linked subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,279,405 | 0 | C | G | 5.8% | 1029.3 / 35.4 | 304 | R123R (CGC→CGG) | glcD | glycolate oxidase FAD‑linked subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (148/138); new base G (5/13); total (153/151) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.47e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 313 total aligned reads displayed.
CTTTGCCACCAGCGCGGCGTACCGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGG > NC_002947/4279256‑4279554 | cTTTGCCACCAGCGCGGCGTACCGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCcgc > 2:2372481/1‑150 (MQ=255) cTTTGCCACCAGCGCGGCGTACCGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCGGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCcgc < 2:5514907/150‑1 (MQ=255) tttGCCACCAGCGCGGCGTACCGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCcgcg > 1:689557/1‑150 (MQ=255) ccaccaGCGCGGCGTACCGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCa > 2:1014227/1‑150 (MQ=255) caccaGCGCGGCGTACCGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGGTTGCac < 2:2777707/150‑2 (MQ=255) caccaGCGCGGCGTACCGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGGATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCac > 2:2273120/1‑149 (MQ=255) accaGCGCGGCGTACCGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAAc > 2:3469327/1‑150 (MQ=255) accaGCGCGGCGTACCGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAAc < 2:2202597/150‑1 (MQ=255) caGCGCGGCGTACCGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCg > 1:2002647/1‑150 (MQ=255) aGCGCGGCGTACCGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCgg < 2:4870170/150‑1 (MQ=255) aGCGCGGCGTACCGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCgg < 1:4516256/150‑1 (MQ=255) gcgcGGCGTACCGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCggg > 1:2906610/1‑150 (MQ=255) cgcgGCGTACCGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGc < 1:3713549/150‑1 (MQ=255) cgcgGCGTACCGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGc < 1:1019296/150‑1 (MQ=255) cgcgGCGTACCGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCG‑TACGCCCGGTTGCACGCGGGCg < 1:4202715/150‑1 (MQ=255) gcggcgTACCGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGGTTGCACGCGGGCg < 2:3949181/150‑1 (MQ=255) ggcgTACCGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTa < 1:2695967/150‑1 (MQ=255) ggcgTACCGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTa < 1:2727463/150‑1 (MQ=255) gcgTACCGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGGTTGCACGCGGGCGTaa < 2:1983336/150‑2 (MQ=255) gcgTACCGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTAc < 1:2264949/150‑1 (MQ=255) gTACCGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCG‑TACGCCCGGTTGCACGCGGGCGTaacgc < 2:368128/150‑5 (MQ=255) ccGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAAc > 1:2510270/1‑150 (MQ=255) ggtggtTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCt > 1:1771733/1‑150 (MQ=255) ggtggtAGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCt > 2:4194878/1‑150 (MQ=255) gtggtTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTg < 2:4895736/150‑1 (MQ=255) gtTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGcc < 2:1653099/150‑1 (MQ=255) gcgcGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCACCCTGGCCAtc > 1:5541988/1‑150 (MQ=255) gcgTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCAtctc > 2:5557307/1‑150 (MQ=255) gcgTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCAtctc > 1:459150/1‑150 (MQ=255) tGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCTCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCa < 2:3541551/150‑1 (MQ=255) tGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCa < 2:2476088/150‑1 (MQ=255) gTACCGGCCTGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGccgccg < 1:1422600/150‑1 (MQ=255) cGGCCTGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCatt < 2:1728983/150‑3 (MQ=255) tGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATg > 2:4494100/1‑150 (MQ=255) gTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATgg < 1:3394644/150‑1 (MQ=255) cTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTa < 2:3223312/150‑1 (MQ=255) cTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTa < 2:585454/150‑1 (MQ=255) cTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTa > 1:5478050/1‑150 (MQ=255) cTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTa < 2:2058775/150‑1 (MQ=255) gtgCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGtact < 2:5352944/150‑1 (MQ=255) gCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGtactac < 2:3356224/150‑1 (MQ=255) cccTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACg > 2:33861/1‑150 (MQ=255) ccTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGc > 1:2308492/1‑150 (MQ=255) cTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCACCCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCa > 2:3269671/1‑150 (MQ=255) cTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCa < 2:5019625/150‑1 (MQ=255) cTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCa > 1:1882074/1‑150 (MQ=255) tGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCAc > 2:1076900/1‑150 (MQ=255) gCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGGTTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGa > 1:4171715/1‑150 (MQ=255) gCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGa > 1:3306153/1‑150 (MQ=255) tGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGAcc < 2:2693883/150‑1 (MQ=255) cAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTc > 2:1914703/1‑150 (MQ=255) cAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTc > 1:3043677/1‑150 (MQ=255) cAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTc > 1:1311402/1‑150 (MQ=255) aaGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTcc < 2:1101293/150‑1 (MQ=255) aaGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTcc > 1:4371157/1‑150 (MQ=255) aaGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTcc > 1:4052375/1‑150 (MQ=255) aaGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTcc > 1:1723442/1‑150 (MQ=255) gggCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTc > 1:3166236/1‑150 (MQ=255) gggCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTc < 2:4363322/150‑1 (MQ=255) ggCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCg > 2:2683846/1‑150 (MQ=255) cATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCa < 2:3031531/150‑1 (MQ=255) aTCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCaa > 2:2456878/1‑150 (MQ=255) ctgctgGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAAtt < 2:3108341/150‑1 (MQ=255) gctgGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGc < 1:577109/150‑1 (MQ=255) ctgGTGATGGCGCGCTTCATCCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCATCCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGcc > 2:3753357/1‑150 (MQ=255) ctgGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGcc > 1:4986015/1‑150 (MQ=255) ctgGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGcc > 1:3977890/1‑150 (MQ=255) tgGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCt < 2:4732498/150‑1 (MQ=255) aTGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCg > 1:5625162/1‑150 (MQ=255) gcgcTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCgg > 1:234428/1‑150 (MQ=255) cgcTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGTGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGt < 1:1203238/150‑1 (MQ=255) ccGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGt > 1:3930235/1‑150 (MQ=255) gTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCg > 2:5252737/1‑150 (MQ=255) gTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCCCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCg < 2:3399529/150‑1 (MQ=255) aTCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGcc > 1:4262984/1‑150 (MQ=255) ccTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGa < 1:4925060/150‑1 (MQ=255) tCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCCACGTCGCCGaaa > 2:5529174/1‑150 (MQ=255) tCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGaaa > 2:935823/1‑150 (MQ=255) tCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGaaa > 1:5422552/1‑150 (MQ=255) gAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCt > 2:689007/1‑124 (MQ=255) cAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCgg > 2:4958302/1‑150 (MQ=255) aaCCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGt < 2:4299994/150‑1 (MQ=255) cccGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTgg > 1:2117079/1‑150 (MQ=255) ccGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGc > 2:3045553/1‑150 (MQ=255) cGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCg > 2:407329/1‑150 (MQ=255) gCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGt > 1:2952555/1‑150 (MQ=255) cGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGc < 2:768256/150‑1 (MQ=255) cGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGc < 2:1165892/150‑1 (MQ=255) cGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGc < 1:3469327/150‑1 (MQ=255) cGTTACGCCCGCGGGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGc < 2:3002407/150‑1 (MQ=255) gTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGcc > 1:844164/1‑150 (MQ=255) ttACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCt > 1:1503108/1‑150 (MQ=255) gtACGCCCGGTTGCACGCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCt > 2:5042878/2‑150 (MQ=255) aCGCCCGGTTGCACGCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCa > 2:4580477/1‑150 (MQ=255) cGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCaa > 1:2995914/1‑150 (MQ=255) gCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAg < 1:5261148/150‑1 (MQ=255) cccGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGt < 1:1086670/150‑1 (MQ=255) ccGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTa > 1:5518619/1‑150 (MQ=255) ccGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTa > 1:5222036/1‑150 (MQ=255) cgTGCAACCGGGCTTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCAGCACACCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGAAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACgg < 2:1278884/150‑1 (MQ=255) | CTTTGCCACCAGCGCGGCGTACCGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGCCCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAACCCGCAGGGGCGTTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCCTCAAGTACGG > NC_002947/4279256‑4279554 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |