Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,384,139 | G→C | 5.4% | A116P (GCT→CCT) P65A (CCT→GCT) |
PP_5639 → PP_3855 ← |
hypothetical protein hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,384,139 | 0 | G | C | 5.4% | 821.3 / 26.7 | 242 | A116P (GCT→CCT) P65A (CCT→GCT) | PP_5639 PP_3855 | hypothetical protein hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (135/93); new base C (6/7); total (141/101) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.95e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.34e-01 |
Only 100 of 250 total aligned reads displayed.
ATTCAGACCCATACGAGATTCTGATCGACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTGGAGCGGAGCGGCTGTTGTTTT > NC_002947/4383990‑4384288 | aTTCAGACCCATACGAGATTCTGATCGACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAgg > 2:2678275/1‑150 (MQ=255) aTTCAGACCCATACGAGATTCTGATCGACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAgg < 1:5058159/150‑1 (MQ=255) aCCCATACGAGATTCTGATCGACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGc < 2:3902423/150‑1 (MQ=255) aCCCATACGAGATTCTGATCGACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGc < 1:708042/150‑1 (MQ=255) ccATACGAGATTCTGATCGACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCg > 1:1340116/1‑150 (MQ=255) aTACGAGATTCTGATCGACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTAAGGCTCCGGCAGAGCCTGCGCCGGa < 2:2314025/150‑1 (MQ=255) tACGAGATTCTGATCGACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCAGAGCCTGCGCCGGAg < 2:4266569/150‑1 (MQ=255) gagaTTCTGATCGACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCt > 2:2440353/1‑150 (MQ=255) gagaTTCTGATCGACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCt > 1:2990444/1‑150 (MQ=255) gaTTCTGATCGACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCAGAGCCTGCGCCGGAGCCtga < 1:1783590/150‑3 (MQ=255) gaTTCTGATCGACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCAGAGCCTGCGCCGGAGCCtga < 1:78529/150‑3 (MQ=255) aTTCTGATCGACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCg < 1:4467229/150‑1 (MQ=255) cTGATCGACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCaa < 1:4104857/150‑1 (MQ=255) cTGATCGACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCaa < 2:3336962/150‑1 (MQ=255) gACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCg > 2:1832860/1‑150 (MQ=255) gACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCg < 2:1340116/150‑1 (MQ=255) cATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGac < 1:2690931/150‑1 (MQ=255) tGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGacac > 2:4933563/1‑150 (MQ=255) tGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGacac < 2:5405749/150‑1 (MQ=255) ggCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACAcc > 1:3294201/1‑150 (MQ=255) tGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTa < 1:223769/150‑1 (MQ=255) tGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTa > 2:2118340/1‑150 (MQ=255) gCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAg < 1:3714887/150‑1 (MQ=255) gCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTa < 1:4624869/150‑1 (MQ=255) gCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCt < 1:5352641/150‑1 (MQ=255) cTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCtt < 2:2991599/150‑1 (MQ=255) tGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTc > 2:749816/1‑150 (MQ=255) acacAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAg > 2:3831574/1‑150 (MQ=255) acaATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTa > 1:2465760/1‑150 (MQ=255) acaATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTa > 1:428797/1‑150 (MQ=255) aaTTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTAcc > 2:4380176/1‑150 (MQ=255) aaTTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTAcc > 2:4871648/1‑150 (MQ=255) tCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCg < 1:1005040/150‑1 (MQ=255) cTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCgg > 1:4432099/1‑150 (MQ=255) tGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGt > 2:1159348/1‑150 (MQ=255) gCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAg < 1:135242/121‑1 (MQ=255) gCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCGGGTCGGtt > 2:1911998/1‑150 (MQ=255) ccTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTaa < 1:1211302/150‑1 (MQ=255) cTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAAt < 1:105710/150‑1 (MQ=255) cTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAAt > 2:4093545/1‑150 (MQ=255) cTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGCCGGTTAAt > 1:658502/1‑150 (MQ=255) acacCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATAc > 1:906840/1‑150 (MQ=255) acCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCt > 1:2573847/1‑150 (MQ=255) 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tCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTc > 2:2042142/1‑150 (MQ=255) tCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTc > 2:2879572/1‑150 (MQ=255) aGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCt < 1:3376268/116‑1 (MQ=255) aGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCt > 2:3376268/1‑116 (MQ=255) gCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCggg > 1:3409502/1‑150 (MQ=255) gCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCggg > 2:865661/1‑150 (MQ=255) 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cAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGa < 2:3968982/150‑1 (MQ=255) aaGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGAc > 2:1271906/1‑150 (MQ=255) gCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGATCATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTc > 2:3421549/1‑150 (MQ=255) cTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCa < 2:254833/150‑1 (MQ=255) aGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAgg > 1:3498304/1‑150 (MQ=255) aaTATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATcg > 1:4035096/1‑150 (MQ=255) ggTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCgg < 1:524121/150‑1 (MQ=255) aCCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACgg > 2:16926/1‑150 (MQ=255) aCCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACgg < 2:622470/150‑1 (MQ=255) aCCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACgg < 2:2280198/150‑1 (MQ=255) cAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGt > 2:5597735/1‑150 (MQ=255) cAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGt > 2:5206288/1‑150 (MQ=255) aaGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTa > 2:3183667/1‑150 (MQ=255) cTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCa > 1:1223365/1‑150 (MQ=255) ttCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAg < 1:3776294/150‑1 (MQ=255) cAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGACCTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGcc > 2:1460841/1‑150 (MQ=255) cccGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGAGCGACACCGTAGCGCTGTAATCCGTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGACCTGACGCAGGATCGCGCGGGCCCGGGTCTCAGccccc > 2:5471511/1‑150 (MQ=255) ccGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGACCTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCcct > 2:936896/1‑150 (MQ=255) gATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCtgt < 1:1694596/150‑1 (MQ=255) aTGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCtgtg > 1:539594/1‑150 (MQ=255) ccTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTggag > 1:1527373/1‑150 (MQ=255) cTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTggagc > 1:218327/1‑150 (MQ=255) cTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTggagc < 1:309060/150‑1 (MQ=255) cTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTggagc > 1:3222649/1‑150 (MQ=255) tCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTggagcg > 2:2610823/1‑150 (MQ=255) aGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTggagcgga > 1:2719910/1‑150 (MQ=255) aGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTggagcgga < 1:4902433/150‑1 (MQ=255) aGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTggagcgga < 1:3522951/150‑1 (MQ=255) aGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTggagcgga < 1:2208609/150‑1 (MQ=255) gCTCCGGCAGAGCCTGCGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTggagcggagc > 1:5545755/1‑150 (MQ=255) gCTCCGGCAGAGCCTGCGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTggagcggagc > 2:440436/1‑150 (MQ=255) cTCCGGCAGAGCCTGCGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTGgagcggagcg > 1:875055/1‑150 (MQ=255) tCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTGGagcggagcgg > 2:4770558/1‑150 (MQ=255) tCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTGGagcggagcgg > 1:3934642/1‑150 (MQ=255) tCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTGGagcggagcgg > 1:1477266/1‑150 (MQ=255) cGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGa > 1:4643885/1‑97 (MQ=255) cGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTGGAGCGGAGCGGCt > 1:1996903/1‑150 (MQ=255) gcgcAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTGGAGCGGAGCGGCtgt < 1:4166692/150‑1 (MQ=255) ggCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTGGAGCGGAGCGGCTGTTGttt < 1:4871648/150‑1 (MQ=255) gCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTGGAGCGGAGCGGCTGTTGtttt > 2:4641356/1‑150 (MQ=255) gCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTGGAGCGGAGCGGCTGTTGtttt < 2:84230/150‑1 (MQ=255) | ATTCAGACCCATACGAGATTCTGATCGACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTGGAGCGGAGCGGCTGTTGTTTT > NC_002947/4383990‑4384288 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |