| Predicted mutation | |||||||
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PP_5639 → PP_3855 ← |
hypothetical protein hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 4,384,143 | 0 | T | C | 5.7% | 789.3 / 22.6 | 243 | L117P (CTG→CCG) ‡ A63A (GCA→GCG) | PP_5639 PP_3855 | hypothetical protein hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (133/96); new base C (7/7); total (140/103) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.87e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.51e-01 | |||||||||||
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
AGACCCATACGAGATTCTGATCGACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTGGAGCGGAGCGGCTGTTGTTTTCG > NC_002947/4383994‑4384290 | aGACCCATACGAGATTCTGATCGACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGctct > 2:2208609/1‑150 (MQ=255) aCCCATACGAGATTCTGATCGACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGc < 2:3902423/150‑1 (MQ=255) aCCCATACGAGATTCTGATCGACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGc < 1:708042/150‑1 (MQ=255) ccATACGAGATTCTGATCGACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCg > 1:1340116/1‑150 (MQ=255) aTACGAGATTCTGATCGACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCAGAGCCTGCGCCGGa < 1:2232596/150‑1 (MQ=255) aTACGAGATTCTGATCGACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTAAGGCTCCGGCAGAGCCTGCGCCGGa < 2:2314025/150‑1 (MQ=255) gagaTTCTGATCGACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGcctgcaggc > 2:4456935/1‑143 (MQ=255) gagaTTCTGATCGACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCt > 1:4874909/1‑150 (MQ=255) gaTTCTGATCGACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTc < 1:2185886/150‑1 (MQ=255) gaTTCTGATCGACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCAGAGCCTGCGCCGGAGCCtga < 1:78529/150‑3 (MQ=255) gaTTCTGATCGACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCAGAGCCTGCGCCGGAGCCtga < 1:2329938/150‑3 (MQ=255) aTTCTGATCGACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCg < 1:4467229/150‑1 (MQ=255) tCTGATCGACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGGTCGGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCa < 2:5445095/150‑1 (MQ=255) gATCGACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATg > 2:3249275/1‑150 (MQ=255) aTCGACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGa > 2:1346067/1‑150 (MQ=255) gACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCg > 2:1832860/1‑150 (MQ=255) gACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCg > 2:3145642/1‑150 (MQ=255) aTGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGaca < 2:3981362/150‑1 (MQ=255) 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gACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGGTACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCa < 1:4590652/150‑1 (MQ=255) gACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCa < 1:2708679/150‑1 (MQ=255) acacAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCt > 1:335948/1‑146 (MQ=255) acacAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCt < 2:335948/146‑1 (MQ=255) acaATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTa > 1:890384/1‑150 (MQ=255) 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cTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCa > 1:1223365/1‑150 (MQ=255) cTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCa > 1:4071111/1‑150 (MQ=255) ttCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAg < 1:3776249/150‑1 (MQ=255) cAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGACCTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGcc > 2:1460841/1‑150 (MQ=255) cccGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGccccc > 1:4275220/1‑150 (MQ=255) ccGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGACCTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCcct > 2:936896/1‑150 (MQ=255) ccGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCcct > 1:5080537/1‑150 (MQ=255) aTGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCtgtg > 1:539594/1‑150 (MQ=255) gCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTgga < 1:3249275/150‑1 (MQ=255) gCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTgga < 1:3019534/150‑1 (MQ=255) ccTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTggag > 1:1527373/1‑150 (MQ=255) cTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTggagc > 1:2771925/1‑150 (MQ=255) cTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTggagc > 1:2637711/1‑150 (MQ=255) gCTCCGGCAGAGCCTGCGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTggagcggagc > 2:4397276/1‑150 (MQ=255) gCTCCGGCAGAGCCTGCGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTggagcggagc > 1:5545755/1‑150 (MQ=255) gCTCCGGCAGAGCCTGCGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCAGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTggagcggagc > 1:462692/1‑150 (MQ=255) cTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTCGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTGgagcggagcg < 2:1776598/150‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTGGagcggagcgg > 1:4384699/1‑150 (MQ=255) tCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTGGagcggagcgg > 1:1477266/1‑150 (MQ=255) tCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTGGagcggagcgg > 1:4118729/1‑150 (MQ=255) cGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGa < 2:4643885/97‑1 (MQ=255) gCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTGGAGCGGAGCGGCTGTTGtttt < 2:84230/150‑1 (MQ=255) ctctGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTGGAGCGGAGCGGCTGTTGTTTTc < 2:4897364/150‑1 (MQ=255) tctGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTGGAGCGGCGCGGCTGTTGTTTTCg > 1:4942900/1‑150 (MQ=255) tctGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTGGAGCGGAGCGGCTGTTGTTTTCg > 2:2929726/1‑150 (MQ=255) tctGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCAGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTGGAGCGGAGCGGCTGTTGTTTTCg > 2:1712935/1‑150 (MQ=255) | AGACCCATACGAGATTCTGATCGACATGGCTGCGTCTGGCGTTGCTGACACAATTGTTCTGCCCTACACCAGCTATCAGCAATACAAGCTAGGCAATATGGTGATACCAAGCTTCAGCCCGCAGATGCCTCAGGCTCCGGCGCAGGCTCTGCCGGAGCCTTCGCAATGATCGACACCTTAGCGCTGTAATCCTTCAGTACCTGGTCGGTTAATACCTGCGCAGTCGGGAACTGACTCAGGATCGCGCGGGCACGGGTATCAGCCCCCTCCTGTGGAGCGGAGCGGCTGTTGTTTTCG > NC_002947/4383994‑4384290 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |