Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 5,477,153 | 0 | T | A | 5.3% | 742.1 / 22.2 | 227 | K95M (AAG→ATG) ‡ | rlmH | 23S rRNA (pseudouridine(1915)‑N(3))‑methyltransferase RlmH |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (92/118); new base A (5/7); total (100/127) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.32e-01 |
Only 100 of 229 total aligned reads displayed.
AAGTCAGCGGCGACAGCGACCAACGTTGCTCGGCGCGCGCGCAAACCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAATTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCGGGATTTCCACCAGCTCCAGCGACAGCTCGGCG > NC_002947/5477004‑5477302 | aaGTCAGCGGCGACAGCGACCAACGTTGCTCGGCGCGCGCGCAAACCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAATTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCt > 2:3327869/1‑150 (MQ=255) cggcgACAGCGACCAACGTTGCTCGGCGCGCGCGCAAACCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAATTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATg < 1:2307925/150‑1 (MQ=255) cggcgACAGCGACCAACGTTGCTCGGCGCGCGCGCAAACCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAATTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATg < 2:4253922/150‑1 (MQ=255) cggcgACAGCGACCAACGTTGCTCGGCGCGCGCGCAAACCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAATTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCAAGCCATg < 1:1482670/150‑1 (MQ=255) cggcgACAGCGACCAACGTTGCTCGGCGCGCGCACAAACCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAATTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATg < 1:1273921/150‑1 (MQ=255) gcgACAGCGACCAACGTTGCTCGGCGCGCGCGCAAACCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAATTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCAAGCCATGGa < 2:4933531/150‑1 (MQ=255) gcgACAGCGACCAACGTTGCTCGGCGCGCGCGCAAACCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAATTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCAAGCCATGGa < 1:717009/150‑1 (MQ=255) cgACAGCGACCAACGTTGCTCGGCGCGCGCGCAAACCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAATTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGAc > 2:2940488/1‑150 (MQ=255) 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cAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCGGGATTTccac > 1:3822863/1‑150 (MQ=255) cAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCGGGATTTccac < 1:4339911/150‑1 (MQ=255) cAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCGGGATTTccac > 2:1105942/1‑150 (MQ=255) cAGCTGCTCGGTACTCCAGGGCGTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCGGGATTTccac < 2:4062163/150‑1 (MQ=255) gctgctCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCGGGATTTccacca < 2:907789/150‑1 (MQ=255) 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cTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCGGGATTTCCACCAGCTCCAGCGACAGCTcggc < 1:5470998/150‑1 (MQ=255) ttGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCGGGATTTCCACCAGCTCCAGCGACAGCTcggcg < 1:1440989/150‑1 (MQ=255) | AAGTCAGCGGCGACAGCGACCAACGTTGCTCGGCGCGCGCGCAAACCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAATTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCGGGATTTCCACCAGCTCCAGCGACAGCTCGGCG > NC_002947/5477004‑5477302 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |