Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 5,477,154 | 0 | T | A | 5.2% | 775.6 / 20.2 | 227 | K95* (AAG→TAG) ‡ | rlmH | 23S rRNA (pseudouridine(1915)‑N(3))‑methyltransferase RlmH |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (95/120); new base A (5/7); total (100/127) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 231 total aligned reads displayed.
GTCAGCGGCGACAGCGACCAACGTTGCTCGGCGCGCGCGCAAACCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAATTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCGGGATTTCCACCAGCTCCAGCGACAGCTCGGCGG > NC_002947/5477006‑5477303 | gTCAGCGGCGACAGCGACCAACGTTGCTCGGCGCGCGCGCAAACCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAATTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTg < 1:5410700/150‑1 (MQ=255) tCAGCGGCGACAGCGACCAACGTTGCTCGGCGCGCGCGCAAACCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAATTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGc > 2:4196339/1‑150 (MQ=255) cggcgACAGCGACCAACGTTGCTCGGCGCGCGCGCAAACCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAATTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATg < 2:4253922/150‑1 (MQ=255) 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gggaCTCCAGGGCTTGCCATGGACCTCGCGGGTGACACTGCGGTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCGGGATTTCCACCAGCTCCAg < 1:3577147/147‑1 (MQ=255) gTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCGGGATTTCCACCAGCTCCAGc > 1:5194832/1‑150 (MQ=255) aCTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTAGTCAGCGGGATTTCCACCAGCTCCAGCGa > 1:3665292/1‑150 (MQ=255) tCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCGGGATTTCCACCAGCTCCAGCGACa > 2:3104091/1‑150 (MQ=255) tCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCGGGATTTCCACCAGCTCCAGCGACa < 1:1000629/150‑1 (MQ=255) tCCATGGCAAGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCGGGATTTCCACCAGCTCCAGCGACa > 1:5303030/1‑150 (MQ=255) caagggCCTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCGGGATTTCCACCAGCTCCAGCGACAg > 2:2358930/5‑150 (MQ=255) cTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCGGGATTTCCACCAGCTCCAGCGACAGCTcggc < 2:5009572/150‑1 (MQ=255) cTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCGGGATTTCCACCAGCTCCAGCGACAGCTcggc < 1:5470998/150‑1 (MQ=255) ttGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCGGGATTTCCACCAGCTCCAGCGACAGCTcggcg < 1:1440989/150‑1 (MQ=255) tGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCGGGATTTCCACCAGCTCCAGCGACAGCTcggcgg < 1:763788/150‑1 (MQ=255) | GTCAGCGGCGACAGCGACCAACGTTGCTCGGCGCGCGCGCAAACCTCAGGCGCCAGGCCCTCCGGGCCGCCCACCATCAAATTCACCGTGCGCGCATCCAGGCGCCAGCGGTCCAGCTCGGTCGCCAGCTGCTCGGTACTCCATGGCTTGCCATGGACCTCGAGGGTGACAATGCGTTCCCCAGGCTGCACTTTGCTCAGCATGGCTTCGCCCTCCTGACGGATCAGGCGGGCGACGTCGGCATTCTTGCCACGGGTATTCAGCGGGATTTCCACCAGCTCCAGCGACAGCTCGGCGG > NC_002947/5477006‑5477303 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |