| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 478,316 | A→T | 9.4% | intergenic (+61/+49) | PP_0393 → / ← cca | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase/multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/phosphatase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 478,316 | 0 | A | T | 9.4% | 489.2 / 4.8 | 183 | intergenic (+61/+49) | PP_0393/cca | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase/multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/phosphatase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (87/70); new base T (2/18); total (94/89) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.23e-05 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 195 total aligned reads displayed.
TGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACAT > NC_002947/478167‑478465 | tGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGa < 1:2986709/150‑1 (MQ=255)tGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGa < 2:5197516/150‑1 (MQ=255)tGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGa < 1:3850969/150‑1 (MQ=255)tGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGa < 2:3439834/150‑1 (MQ=255) ggCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCGTACGACGGGCTGAGCCCAACCACTGAt > 2:82306/1‑150 (MQ=255) ggCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGAt < 2:5563256/150‑1 (MQ=255) ggCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGAt < 1:3520949/150‑1 (MQ=255) ggCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGAt < 1:3702888/150‑1 (MQ=255) ggCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGAt < 2:26531/150‑1 (MQ=255) gcAGCTGTGGCAGGAAGCGCCGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGAtgtg > 2:3235447/1‑150 (MQ=255) aGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGAtgtgtg < 1:3673632/150‑1 (MQ=255) cTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGAGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGGTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑CCTGCAACGACCGGGTGAGCCCAACCGCGGAGGTGTGcc > 1:4862899/1‑150 (MQ=255) aGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTa < 1:4317655/150‑1 (MQ=255) aGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTa < 1:2195485/150‑1 (MQ=255) aGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTa < 1:2881763/150‑1 (MQ=255) gcAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCgg < 2:1617060/150‑1 (MQ=255) gcAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCgg < 2:3383966/150‑1 (MQ=255) gcAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCgg < 2:2310340/150‑1 (MQ=255) gcAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCgg < 2:1887388/150‑1 (MQ=255) gcAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCgg < 2:505484/150‑1 (MQ=255) gcAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCgg < 1:1643800/150‑1 (MQ=255) gcAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCGGTAGGAGCgg > 2:1744087/1‑150 (MQ=255) gcAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCGCGGATGTGTGCCCCCGGGAGGGGCgg > 2:729815/1‑150 (MQ=38) gcAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGGTAACCC‑CCGCCGACCACCGGCGGAGCCCCAACACAGATGTGTGGCCCCCGGAGGTGCgg > 1:2465862/1‑150 (MQ=255) cAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCggg < 1:2606225/150‑1 (MQ=255) aGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGt < 1:2396631/150‑1 (MQ=255) aGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGt < 1:4441393/150‑1 (MQ=255) gatcgatcAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAAACC‑CCTCCAAACACGGGCGGAGGCCAACCACCGCAGGGTGGCCCCCGGAGGAGCggggt > 1:1002915/1‑148 (MQ=255) gatcgatcAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTAGCGGGGTAAACCC‑‑CACCAAACACCGGCGGAGCCCCAACACAGATGTGTTGCCCCAGTAGGATCggggt > 1:1002983/1‑148 (MQ=255) gatcAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGtaaacc < 2:5618535/150‑6 (MQ=255) atcAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGAtgtg > 2:4611538/1‑124 (MQ=255) tcAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGAtgt > 1:612045/1‑122 (MQ=255) tcAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTAAGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCGGTAGGAGCGGGGTTACCcg > 1:2181264/1‑150 (MQ=255) cAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCcgc < 2:2217067/150‑1 (MQ=255) gTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa < 2:883533/150‑1 (MQ=255) aCTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAAACC‑GCACCTAAGACGGGCTGAGCCCAACCACTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTAACCGCGAaga > 2:1501506/1‑150 (MQ=39) aCTGGCCCCCGTGGCCGGTGCGGGGCGCGGGTTGCAGTTGCCGCCCGCTTGCGCCTGTATCGGCCGCTGCGG‑GGGGACCCCC‑GCTCCTCCGACGGGCTGAGCCCAACCTCGGAGGGGGGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAaga < 2:3198066/150‑1 (MQ=255) ggCCCCGGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCTGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCGCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCGGTCGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGc < 2:4962246/150‑1 (MQ=38) gCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAAACC‑GCTACTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTTCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGcc > 2:2887765/1‑150 (MQ=255) ccccGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑CCACCAACCACCGGCTGAGCCCAACCACTGATTTGTTCCCCCCGTAGGAGCCGGGTTAACCCCCAAAAGGcccg > 1:2691621/1‑148 (MQ=255) cggTGGCTTTTGTGTGGCGGGGGTTGCTTTTGACGCCCGTTTGCGCCTGTTGCGGCCTGTCCGG‑GGTTAAACCC‑GCCCCTCCGCGGGGCTGAGCCCACCCTCGGATGTGGGCCCCCTTTTGGTGGGTTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTa < 2:2390586/148‑1 (MQ=255) ccGTGGCTTTTTTGTGGGGGGGGTTGCTGTTGACGCCCGCTTGCGCCTTTATCGGCCGCTTCGG‑GGTTAACCCC‑GATCCTACGACGGGCTGAGCCAAACCTGTTTTTTGTGCCCCCTGTCTGTGGGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTa < 2:2390533/150‑1 (MQ=255) gggggattttGTGGGGCGGGGTTTGCTGTTGACGCCGGCTTGAGCCTTTATGGGCCT‑GTGGG‑GGGTAAACCCGGCACCACCGAGGGGCTGAGCCAAACCTCTGTTGTGTGCCCCCTTTCGGCGCGTTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAg < 2:299744/143‑1 (MQ=255) gTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTGCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCAAACCTCGGATGTGTGCCCCCTGTCGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAgg < 2:5114555/150‑1 (MQ=39) cttttGCCGCCCGCTTGCGCCTGTATCGGCCTCTGCGC‑GGGTAACCCC‑GCCCCAACCACGGGCTGCGCCCAACCTCTGATGTGGGCCCCCGGTCGGAGCGGGTTTACCCGCGACGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGa < 2:1535436/147‑1 (MQ=255) cAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCGTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTCCGCGGGGCTGAGCCCAACCTGTGTTGTGTGCCCCCTGTCGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGa < 2:3594435/150‑1 (MQ=38) gCCCGCTTGCGCCTTTATCGGCCCCTGCGG‑GGTTAAACCC‑GCTCCTACGAGGGGCTGAGCCAAACCTCTGTGGTGTCCCCCGTGTCGGTGGGTTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTc < 2:1106831/150‑1 (MQ=255) gAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTc < 2:2240540/150‑1 (MQ=255) ccTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTTAAACC‑CCGCCGAAGACGGGCTGATCCCAACCGCTGTTGTGTGCCCCCAGTAGGAGCGGGTTTTACCGCGCAGAGGCCGGTAGGTCAAACCGCGCGGGGAAGCCGCGCGCCCGTTCAGcccgtaacc > 2:85489/1‑143 (MQ=255) tgtcccGGCCTCGTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGCCGGGCTGCCCCCAACCTCTTGGGTGTGCCCCCTGTCGGCGGGGGTTCCCCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCtt < 1:2261802/145‑1 (MQ=37) gTAGCGGCCTCTTCGC‑GGTTAAACCC‑GCCCCCCCGCCGGGCTGCGCCCACCCGCGGATGTGGGCCCCCTGTCGGAGGGGTTTAACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCttt < 2:3288098/150‑1 (MQ=255) aTCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGa > 2:4564954/1‑150 (MQ=255) tCGGCCTCGCCGC‑GGTAAACCCC‑GCTCCAACGACGGGCTGACCCAAACCTCTCTTGTGGGCCCCGGGTTGGTGGGGTTTTACCCGCGACGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAg < 2:526802/150‑1 (MQ=255) ggCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGcc < 1:857162/60‑1 (MQ=255) ccTCTTCGG‑GGGTAAACCC‑GCTCCTCCGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGAGGTGTGCCCCCTGGAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCt < 2:3928702/150‑1 (MQ=255) tctTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGa < 1:5079777/48‑1 (MQ=255) tctTCGC‑GGGTAAACCC‑GCACCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCGTc > 2:4852249/1‑150 (MQ=255) gc‑gGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCa > 1:5527392/1‑150 (MQ=255) gc‑gGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCa > 1:229614/1‑150 (MQ=255) ggTAACCCC‑GATCCTCCGCCGGGGTGCCCCCACCCTCTGTTGTGGCCCCCGTTTCGGCGGGGTTTTACCCGCGATGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTg < 1:818860/150‑1 (MQ=255) ggTAAACCC‑GCCCCAACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTCGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTg < 2:4425829/150‑1 (MQ=255) gTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGc > 2:4297151/1‑150 (MQ=255) tAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTCGGAGCGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGcc < 2:2684600/150‑1 (MQ=255) aaaCCC‑GGTCCTACGACGGGCTGCGCCCAACCTCTGAGGGGTGCCCCCTGGAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCTCCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCt < 2:4148542/150‑1 (MQ=255) ccc‑GCTCCTACGCCGGGCTGAGCCCAACCTCTGTTGTGTGCCCCCTGTAGGTGGGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGAc < 1:4663514/150‑1 (MQ=255) ccc‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGAc > 2:545168/1‑150 (MQ=255) ccc‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGAc > 2:5008374/1‑150 (MQ=255) cc‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGAcc > 2:3026340/1‑150 (MQ=255) cc‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGAcc > 1:2779502/1‑150 (MQ=255) cc‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGAcc > 1:5155342/1‑150 (MQ=255) cc‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGAcc > 1:3422092/1‑150 (MQ=255) c‑GCCCCTACGAGGGGCTGCGCCCACCGTCTGTTGTGGGCCCCCTGTCGGTGGGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCg < 2:291088/150‑1 (MQ=255) gCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCgg > 2:5008058/1‑150 (MQ=255) gCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGATGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCgg > 2:3016379/1‑150 (MQ=255) cgccTCCGCCGGGCTGAGCCAACCCTCGGATGTGGGCCCCGTGTCGGCGGGGGTTAACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGt < 2:5166279/148‑1 (MQ=255) cTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGt < 2:5613631/150‑1 (MQ=255) gacgTGCTGAGCACAACCTCTTATGTGAGCCCCCTGTACGAGCGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGTTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTATCAGCCGTTCACATTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCg > 2:1442206/1‑150 (MQ=255) gacgGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCg > 1:2081049/1‑150 (MQ=255) gacgGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCg > 2:4819035/1‑150 (MQ=255) gacgGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCg > 2:1639941/1‑150 (MQ=255) ggggCTGAGCCAACCCTCTGTTGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGTTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGc < 2:2462/149‑1 (MQ=255) gggCTGAGCCCACCGTCTGATGTGTGCCCCGTGTTGGCGCGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCt < 2:2043791/150‑1 (MQ=255) tGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCttt < 2:3825936/109‑1 (MQ=255) gCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGc < 1:3572536/53‑1 (MQ=255) cccAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCaa > 2:2788299/1‑150 (MQ=255) cccAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCaa > 1:1420779/1‑150 (MQ=255) cccAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTAACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCAGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCaa > 2:5536735/1‑150 (MQ=255) cAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACg > 2:638644/1‑150 (MQ=255) cAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACg > 1:1876590/1‑150 (MQ=255) cAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACACGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACg > 1:3756917/1‑150 (MQ=255) aCCCCTGAGGGGGGCCCCCGGTTGGTGCGGGTTTACCCGCGTAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGc < 1:4193657/150‑1 (MQ=255) ctctGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCtt > 2:1840051/1‑150 (MQ=255) tctGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCGCCAACGGCTTc > 2:3465000/1‑150 (MQ=255) tctGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTc > 2:888822/1‑150 (MQ=255) tctGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTc > 2:841787/1‑150 (MQ=255) tctGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTc > 2:2424446/1‑150 (MQ=255) cctGTTGTGGGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTc < 2:1002915/149‑1 (MQ=255) tGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGGGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTcac < 2:4403634/150‑1 (MQ=255) gATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTcaca > 1:4287646/1‑150 (MQ=255) aTGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACAt > 2:655663/1‑150 (MQ=255) | TGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACAT > NC_002947/478167‑478465 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |