| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,739,027 | T→G | 6.7% | intergenic (‑48/+109) | proY ← / ← hutH | proline (histidine) APC transporter/histidine ammonia‑lyase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,739,027 | 0 | T | G | 6.7% | 507.2 / 14.1 | 157 | intergenic (‑48/+109) | proY/hutH | proline (histidine) APC transporter/histidine ammonia‑lyase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (66/79); new base G (3/9); total (69/88) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.30e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 166 total aligned reads displayed.
GCAGAGCCGTAGAAAAGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCA > NC_002947/5738879‑5739176 | gCAGAGCCGTAGAAAAGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGctgctg < 1:2312897/150‑1 (MQ=255) cAGAGCCGTAGAAACGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGCGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCtgctgc < 2:3350824/150‑1 (MQ=255) agagCCGTAGAAAAGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTgcg > 2:940198/1‑150 (MQ=255) agCCGTAGAAAAGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCa < 1:2437064/150‑1 (MQ=255) ccGTAGAAAAGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGc < 1:5062937/150‑1 (MQ=255) ccGTAGAAAAGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGc < 1:3178499/150‑1 (MQ=255) ccGTAGAAAAGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGc < 1:3000484/150‑1 (MQ=255) ccGTAGAAAAGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGc > 2:1834290/1‑150 (MQ=255) cGTAGAAAAGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGcc < 2:2531662/150‑1 (MQ=255) tAGAAAAGGCCGGGGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTGAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCGCAGCAGcccc < 2:2734943/150‑1 (MQ=255) aaatGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCGCAGCAGccccctg < 1:2645639/150‑4 (MQ=255) aaaaGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTc > 2:3116714/1‑150 (MQ=255) aaaGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCGCAGCAGccccctga < 2:4704462/150‑5 (MQ=255) aaaGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTAAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTcg > 1:1616327/1‑150 (MQ=255) acggCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTcgc < 2:3039543/148‑1 (MQ=255) aaGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTcgc > 1:639204/1‑150 (MQ=255) aGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTcgcg < 1:1927603/150‑1 (MQ=255) ggCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCgg < 2:2253277/150‑1 (MQ=255) cGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCa > 1:4676619/1‑150 (MQ=255) gATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGAGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTGTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGc > 1:4547112/1‑150 (MQ=255) aTGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCGTGCCCGcg < 2:2606969/150‑2 (MQ=255) cGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCca < 1:3156897/150‑1 (MQ=255) cGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCca < 2:3513064/150‑1 (MQ=255) cGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTACca > 2:1932893/1‑150 (MQ=255) cGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTGAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCGTGCCCGcgaagg < 2:2996739/150‑6 (MQ=255) gAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCcaca < 1:844112/150‑1 (MQ=255) aGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCACCTTCGCGGGCACGCCCGCACCAACAg > 2:1643089/1‑150 (MQ=255) aGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGGTGTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCcaccg > 2:5246177/1‑148 (MQ=255) ccGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAggg < 2:2623457/150‑1 (MQ=255) gAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGa < 1:3949287/150‑1 (MQ=255) ggCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAgaagtagg < 1:3116714/150‑8 (MQ=255) cATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGgtgt < 1:3076969/150‑1 (MQ=255) tGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGttt > 2:3112353/1‑150 (MQ=255) gacaCGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTAGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGtttt < 2:4191526/147‑1 (MQ=255) gAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGtttt < 2:1674448/150‑1 (MQ=255) gAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGtttt < 1:4399728/150‑1 (MQ=255) gAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCCCGCCCCCCGGGGAAGGTGtgtt > 1:5331804/1‑150 (MQ=255) aaaCGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCtga < 1:3205794/114‑3 (MQ=255) aaCGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGGAAGGGGGTTTGc > 1:2042219/1‑150 (MQ=255) aaCGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGc < 1:1711646/150‑1 (MQ=255) aaCGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGc < 1:2747062/150‑1 (MQ=255) aaCGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGc < 2:4397475/150‑1 (MQ=255) aaCGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACCCCCGCGCCCCCCCGGGCGGGGGTTTTGc > 1:3557473/1‑150 (MQ=255) aaCGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAAGTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGCTGGTGTTTTGc > 1:828871/1‑150 (MQ=255) gATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCt < 2:4705626/150‑1 (MQ=255) aTGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGGCCGCCCGCGCCCCCACGGGAAGGTGtttttgaccga > 1:1437686/1‑143 (MQ=255) aTGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGGTTTTCAccga > 1:1437636/1‑148 (MQ=255) gggCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCtgt < 2:1490543/150‑1 (MQ=255) ggCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCtgtg < 2:132551/150‑1 (MQ=255) ggCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCtgtg < 2:4438617/150‑1 (MQ=255) aCTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGa < 2:4977126/150‑1 (MQ=255) aCTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGa < 1:5507583/150‑1 (MQ=255) cTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAg < 1:1927696/150‑1 (MQ=255) tAGCCCGCGCTCGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCg < 2:5141229/150‑1 (MQ=255) aGCCCGCGCTTGAGACGTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGATTTTTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCCGCGGCTTCGCGGGCACGACCGCTCCCACAGTGTATGGTGTTTTGCACATACTTCTGTGGGAGCgg < 1:1293062/150‑1 (MQ=255) ccGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGgcg < 1:1064407/150‑1 (MQ=255) cgcgCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGgcgc < 1:1044444/150‑1 (MQ=255) ttGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCcg > 2:4133124/1‑150 (MQ=255) ttGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCcg > 1:1761407/1‑150 (MQ=255) ttGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACATCTGTGGGAGCGGGCGCGCCcg > 2:3897409/1‑150 (MQ=255) caCCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTTATTTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGaa < 1:3675799/149‑1 (MQ=255) ccTTGTGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGATTTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACCGGGGTTGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAgg < 2:2675787/150‑1 (MQ=255) ttGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCCCGCCCGCGCCCCCCGGGGGTGGTGTTTTTGACCAAAGTATGTGGGGGCGGGCGCGCCCCCGCAGGgc > 1:5171939/1‑150 (MQ=255) ttGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGGGGGAGCGGGCGCCCCCGCGAAGGgc > 1:5039335/1‑150 (MQ=255) ttGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCCCACCCACAGCGGATGGTGTTTTTCACCTACATCTGTGGGATCGGGCGCCCCCGCGAAGGgc > 1:2209950/1‑150 (MQ=255) gCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGgccgcc > 2:5036267/1‑150 (MQ=255) cTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACCCCCCCACCCACCCGGGATGGTGTTTTGCACCAACATCGGTGGGAGCGGGCGCGCCCCCCCAGGGcccccc > 1:3626085/1‑150 (MQ=255) ttgttgCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCCCCCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTTCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGCAGGGCCGcccc > 2:665065/1‑149 (MQ=255) ttgttgCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCCCTCCCACAGGGGATTGTGTTTTTCACCTAATTGTTTGGGAGCGGGCGCGCCCCCGAAGGGccccccc > 1:1201726/1‑149 (MQ=255) gttgCATGTCACGTCCTTGATTTGTTTTTGGGGTCGTGATATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGCGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGc < 1:5570272/150‑1 (MQ=255) aCGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATTGTGTTTTTCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCCCGAAGGGCCGCCCACCGGCCCCAggg > 1:2333710/1‑150 (MQ=255) aCGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCGCCCCCAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAggg > 2:2977083/1‑150 (MQ=255) gTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCCCCCCCCCGCCCACACGGGATTGTGTTTTTCCCCAACGTCGGTGGGGGCGGGCGCGCCCCCCCAGGGCCGCCCCCCCGCCCCCCGGGc > 1:574724/1‑150 (MQ=255) gTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGc < 2:3714306/150‑1 (MQ=255) gccgtGAATTTTTTGGGTGGCGGTGAGTTCCCGGGGGCTGCGGCGCAGCCCCTCCGCGGGCCCGCCCGCGCCCCCGGGGGTTGGTGTTTGGCCCCTACTTCGGTGGGCGGGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCg < 1:1155395/146‑1 (MQ=255) ttGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGGTa > 2:5611922/1‑150 (MQ=255) ttGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTAACACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGATCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCATCGGCCCCAGGGGCGGTa > 2:2193813/1‑150 (MQ=255) tGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAgg < 2:2087370/74‑1 (MQ=255) gatttGTTTTGGGGGGCGTGAGATTCCGGGGGCGGCGGCGCCGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCCCCGGGGATGGTGTTTGGCACCTCCTTGGGTGGGCGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACa < 2:631662/147‑1 (MQ=255) gAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCACGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACa < 2:2822175/150‑1 (MQ=255) gAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACCCCCCCGCCCACAGGGGCAGGTGTTTTTGAACAACGTATGTGGGCGCCGGCGCGCCCCCGAAGGGCCCCCCACCCGCCCCACGGGccgtaaa > 1:2969225/1‑144 (MQ=255) aaTTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCCCCCCCGCCCCCCCACGGGATGGTGTTTTTGAACGAAATAGGTTGGATCGGGCGCGCCCCCCCAGGGCCCCCCCCCCGCCCCCCGGGCggttccg > 1:3289802/1‑144 (MQ=255) gTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCtgt > 2:5472105/1‑94 (MQ=255) gTTTTTGGGGTCGTGTTATTCCGGGGGCTGCTGCGCCGCCCCTCCGCGGGCACGCCCGCCCCCACCGGGTATGGTTTTTTGCACCTACTTGTGTGGGCGGGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGTGTTACAGGCtt < 1:2175346/150‑1 (MQ=255) gTTTTGGTGGTCGTGAGTTTCTGGGGGCTGCTGCGCCGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTGCTGGGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCtt < 1:1755441/150‑1 (MQ=255) tttttGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACCCCCCCACCCCCCGGGGATGGGTTTTTTCACCAAAATATGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCCAAGGGCCCCCCACCCGCCCCCGGGGCGTTACAGGCGTg > 1:2159260/1‑150 (MQ=255) ttttGTGTGGGTGAGTTTCAGGGGGCTGCTGGGCTGCCCCTTGGCGGGCACGCCGGCACCGTGTGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGCAGCGGGCGCGCCGGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACTGGCTTgg < 2:1203435/150‑1 (MQ=255) tttGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGGTTTGCACCGACGTCTGGGGGAGCGGGCGCGCCCCCCAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGGTACCGGCTTGGc > 2:4268508/1‑150 (MQ=38) tCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCCCACCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCAAAATCGGTGGGAGCGGGCGCCCCCGCCAAGGGCCCCCCACCCGCCCCCGGGGCGGTACAGGCTTTGCACTacac > 1:393890/1‑150 (MQ=255) tGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACccg > 2:3682845/1‑150 (MQ=255) tGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACccg > 2:1340271/1‑150 (MQ=255) gagaGTCCGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTGCGCGGGCACGCCCGCTCCCCCCGGGGTTGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACccgc < 2:3557473/150‑1 (MQ=255) aTTCTGGGGGCGGCGGCGCCGCCCCTGCGCGGGCACGCCCGCGCCCCCCGGGGATGGTGTTGTCCACCTACTTCTGGGGGCGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCgg < 1:2710113/150‑1 (MQ=255) aTTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCgg < 2:4547112/150‑1 (MQ=255) ttCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACCCCCGCTCCCAAAGGGGGTGGTGTTTTGCACCGGCGTGTGTGGGCGGGGGCGCGCCCGCCCACGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTTAAGGCTTGGGAGTACAAccgcccgc > 2:1874639/1‑150 (MQ=255) gggggCAGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGgcagca > 2:3258085/1‑150 (MQ=255) gggCTGCGCAGCAGCCCCTTCGCGGGCACCCCCCCGCCCACCGGGGATGGTGTTTTGCACCTACGTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCCGCGGCCCCACGGGCGGTTCCGGCGTGGCCGTTCACCCCCCCgccgcacg > 2:499569/1‑148 (MQ=255) gggctgcGCCGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACTGGGTTTGGTGTTTTGCACCTAGTTCTGTGGGTGGGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCg < 1:2923630/148‑1 (MQ=255) ctgctgCGCAGCCCCTGCGCGGGCACGCCCGCTCCCCCAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACGTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCg < 2:104454/150‑1 (MQ=255) tgcGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCa < 2:2102987/150‑1 (MQ=255) | GCAGAGCCGTAGAAAAGGCCGGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCA > NC_002947/5738879‑5739176 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |