| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,745,475 | A→T | 21.4% | intergenic (+35/+36) | hutF → / ← PP_5037 | formiminoglutamate deiminase/lipocalin family lipoprotein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,745,475 | 0 | A | T | 21.4% | 177.4 / 48.3 | 93 | intergenic (+35/+36) | hutF/PP_5037 | formiminoglutamate deiminase/lipocalin family lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (14/59); new base T (9/11); total (23/70) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.71e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.87e-01 | |||||||||||
CAGGTGCGCGATGTGATGGTGAATGGGCAATGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGACAGCAGGTTCTCACGCTCCCAGGCCGGCAGTGT > NC_002947/5745327‑5745624 | cAGGTGCGCGATGTGATGGTGAATGGGCAATGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCaa < 1:4266797/150‑1 (MQ=255)cAGGTGCGCGATGTGATGGTGAATGGGCAATGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCaa < 1:4669671/150‑1 (MQ=255)cAGGTGCGCGATGTGATGGTGAATGGGCAATGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCaa < 1:4669790/150‑1 (MQ=255) tGCGCGATGTGATGGTGAATGGGCAATGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑Gccc < 1:3907668/150‑1 (MQ=255) cgcgATGTGATGGTGAATGGGCAATGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCcgc < 2:5547446/150‑1 (MQ=255) cgcgATGTGATGGTGAATGGGCAATGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCcgc < 2:4826837/150‑1 (MQ=255) cgcgACGTGATGGTGCCTGGGCCAGGGGAGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCGCAGGACGATGACAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGGTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCcgc < 2:3147691/150‑1 (MQ=255) cgATGTGATGGTGAATGGGCAATGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGa < 2:3873864/150‑1 (MQ=255) gATGTGATGGTGCATGGGCAATGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGaa < 1:3331599/150‑1 (MQ=255) gATGTGATGGTGAATGGGCAATGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGaa < 1:946650/150‑1 (MQ=255) gATGTGATGGTGAATGGGCAATGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGaa < 1:946519/150‑1 (MQ=255) gATGTGATGGTGAATGGGCAATGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAACCCTTCGC‑GGGCTT‑GCACGCGaa < 1:3023962/150‑1 (MQ=39) gATGTGATGGTGAATGGGCAATGGGTGGTGCGACAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGaa < 2:41527/150‑1 (MQ=255) aTGTTATGGTGAATGGGGTATGGGTGGTGCGCCATTGTGGTCATGCCCAGGAAGATGAAAGAGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGTGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GGGCTT‑GCTCGCGatg < 2:1897354/150‑3 (MQ=255) aTGTGATGGTGAATGGGCAATGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAg < 1:2355199/150‑1 (MQ=255) aTGTGATGGTGAATGGGCAATGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GGGCTT‑GCACGCGAAg < 2:267106/150‑1 (MQ=255) aTGTGATGGTGAATGGGCAATGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GGGCTT‑GCACGCGAAg < 2:4690180/150‑1 (MQ=255) aTGTGATGGTGAATGGGCAATGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAACCCTTCGC‑GGGCTT‑GCACGCGAAg < 2:1197485/150‑1 (MQ=39) gtgATGGTGAATGGGCAATGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAACCCTTCGC‑GGGCTT‑GCACGCGAAggg < 2:1029026/150‑1 (MQ=39) tgATGGTGAATGGGCAATGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGt < 1:1460843/150‑1 (MQ=255) gATGGTGAATGGGCAATGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGtt < 2:2537380/150‑1 (MQ=255) gATGGTGAATGGGCAATGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGtt < 2:2262162/150‑1 (MQ=255) gATGGTGAATGGGCAATGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGtt < 1:806313/150‑1 (MQ=255) gATGGTGAATGGGCAATGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAACCCTTCGC‑GGGCTT‑GCACGCGAAgggct < 1:482778/150‑3 (MQ=38) gATGGTGAATGGGCAAGGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAACCCTTCGC‑GGGCTT‑GCACGCGAAgggct < 2:1021591/150‑3 (MQ=38) gATGGTGAAGGGGCCATGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGACAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGtt < 2:3337813/150‑1 (MQ=255) aTGGTGAATGGGCAATGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGTTg < 2:4163190/150‑1 (MQ=255) aTGGTGAATGGGCAATGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGTTg < 2:4163191/150‑1 (MQ=255) aTGGTGAATGGGCAATGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GGGCTT‑GCACGCGAAGGGCTg < 2:2639253/150‑1 (MQ=39) ggTGAATGGGCAATGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGTTgca < 1:3588279/150‑1 (MQ=255) gTGAATGGGCCATGGGTGGTGCGGCAGGGGCGGCATGCCCAGGCCGATGACCGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCTGCTTTTGGGCTGAGCGTTGCGGGGTTGCGTTGGAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGTTgcat < 2:4244154/150‑2 (MQ=255) gTGAATGGGCAATGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAACCCTTCGC‑GGGCTT‑GCACGCGAAGGGCTgcaa < 1:380543/150‑1 (MQ=38) gTGAATGGGCAATGGGTGGAGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGTTgcaa < 1:4334855/150‑1 (MQ=255) tGAATGGGCAATGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGTTgcaac < 2:4094007/150‑1 (MQ=255) tGAATGGGCAATGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGTTgcaac < 2:4094055/150‑1 (MQ=255) tGAATGGGCAATGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGTTgcaac < 1:1506068/150‑1 (MQ=255) tGAATGGGCAATGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGTTgcaac < 1:4341615/150‑1 (MQ=255) gggCAATGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGGTGGAGCCCGTAGC‑GGGCAA‑GACCCCGCAGGGTTgaaacg‑caac > 2:5117264/1‑150 (MQ=255) tggtgCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGGGGTTGAGCCCAGCGCGGGGCAG‑CCCCCCCACGGGTTG‑AACGCCCACCCCaaaaaa > 2:4457637/1‑150 (MQ=255) tgCGCCTGGGGCGGCATCCCCCGGAAGAGGAAAGGGGGGGGGCGTTGGCCATGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGCGCGTCCGGGGGTTGCTTTGCAGCCCTTCGC‑GTGAAC‑GCCCGCTATGGTTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCa < 2:2536136/150‑1 (MQ=255) gcggcATGCCCCGGATTATGACCGCGGGGGGGGGTTTGCATCGGTTTTGCGCGAGCTTTTGGGGTGAGGTTACCGGGGTTGCGTTGCTGCCCTTGGG‑GTGCAC‑GCCCGCGACGGTTTGAAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCAttttt < 2:3976542/150‑1 (MQ=255) ccAGGAAGATGAACGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGTTTGCGTTGCAGCCCTCCGC‑GTGCAC‑GCCCGCGATGGGTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGc < 2:5276798/150‑1 (MQ=255) aaGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGGGTTGCAGCCCTTCGG‑GTGCAA‑GCCCGCTAAGGTTTGCAACG‑CATCCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATc < 2:3705035/150‑1 (MQ=255) aaGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGG‑GTGCAA‑GCCCGCGATGGGTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATc < 2:3188860/150‑1 (MQ=255) tgaccgcgggcggGCGTTTGCCACGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGAc < 2:3742233/145‑1 (MQ=255) ggggctTTTGCCATGGTGTTGCGCCAGGTTTTGGGCTGTGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCGGCGACGGGTTGCACCG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGa < 2:1563984/149‑1 (MQ=255) ggctTTTGCCATGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTGGCGTTGCAGCCCTGCGC‑TTGCAA‑GCCCGCTATGGGTTGAAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATc < 2:3823927/150‑1 (MQ=255) ggTTTGCCATGGTGTTGCGCATTCTTTTGGGGTGCGCGTACGGGGTTTGCGTTGCAGCCCTTGGG‑GTGCAA‑GCCCGCTTTGGTTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCaa < 1:3675670/149‑1 (MQ=255) gTTTGCCTCGGTGTGGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACGGGGTTTGCTTTGCAGCCCTTCGC‑GTGAAA‑GCCGGCGATGGGTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAg < 2:68901/150‑1 (MQ=255) cacggTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCGGAGCGTCCCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCAC‑GCCCGCGACGGGTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTg < 2:4843025/147‑1 (MQ=255) gtgtGGCGCCAGATTTTGGGCTGTGGTTACGGGGGTTGGTTTGCAGCCCTTCGG‑GTGCAA‑GCCCGCTATGGTTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGgtgt < 1:4148304/150‑1 (MQ=255) gcgcCCGCTTTGGGGCTGCGCGTCCGGGGGTTGGGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCAC‑GCCCGCGACGGGTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATAc < 2:112173/150‑1 (MQ=255) ccgCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTGGCGTGGCAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGACGGGTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCAGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCct < 2:4431453/148‑1 (MQ=255) cAGCTTTGGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCct < 2:1846702/150‑1 (MQ=255) ttttGGGCTGCGGGTCGGGGGGTGGGGTGGCCGCCCTCCGC‑G‑GCAACGCCCGCGAGGGTTTCCACCG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCctgctg < 1:1677566/150‑1 (MQ=255) gggCTGAGCGTACGGGGGTTGCGTTCCAGCCCTTCGC‑GTGAAA‑GCCCGCTAAGGTTTGAAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCcgc < 2:2100582/150‑1 (MQ=255) gggCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTCCACCCCTACGC‑GTCCAA‑CCCCGCTAAGGTTTCCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCcgc < 2:2100490/150‑1 (MQ=255) tACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGTTgca < 2:4551026/50‑1 (MQ=255) tACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGTTgca > 1:4551026/1‑50 (MQ=255) gggggTTGGGTTGCAGCCCTTCGC‑GGGCAT‑GCCCGCGACGGGTTGAAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGAcagca < 2:1012404/149‑1 (MQ=255) gggggTTGGGTTGCAGCCCTGCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTAAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGAcagca < 2:4390373/149‑1 (MQ=255) cGGGTTTGCGTTGCAGCCCTCCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGAcagca < 2:4950710/150‑1 (MQ=255) cGGGGTTGCGGTGCAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGAcagca < 2:3691764/150‑1 (MQ=255) gggTTGCGTGGCACCCGTTCGG‑GTGCAC‑GCCGGGGTTGGTTTCCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGACAGCAgg < 1:4403749/150‑1 (MQ=255) ggTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGACAGCAGGt < 2:4508567/150‑1 (MQ=255) ttgcgttgcAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGACAGCAGGTtc > 1:871393/1‑150 (MQ=255) ttgcgttgcAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGACAGCAGGTtc > 1:870741/1‑150 (MQ=255) ttgcgttgcAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGACAGCAGGTtc < 2:3640908/150‑1 (MQ=255) tgcgttgcAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGACAGCAGGTtct < 2:893792/150‑1 (MQ=255) tgcgttccTGCCCTTGGC‑TTGCAC‑GCCCGCTAGGGTTGGCACCG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGACAGCAGGTtct < 1:2186680/150‑1 (MQ=255) gcgttgcTGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCGGCGAAGGGTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGACAGCAGGTtctc > 2:715858/1‑150 (MQ=255) gcgttgcAGCGCTTCGC‑TTGCAC‑GCCCGGTATGGGTTGAACCG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGACAGCAGGTtctc < 2:1858768/150‑1 (MQ=255) gcgttgcAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGACAGCAGGTtctc > 2:2719147/1‑150 (MQ=255) ggttgcCGCCCTTCGC‑GTGCAC‑GCCCGCTCCGGGTCCCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGACAGCAGGTTCTCa < 1:3595353/149‑1 (MQ=255) cgttgcAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGACAGCAGGTTCTCa < 2:1847497/150‑1 (MQ=255) gttgcAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTg < 2:2414207/107‑1 (MQ=255) gttgcAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTg > 1:2414207/1‑107 (MQ=255) gttgcAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGACAGCAGGTTCTCAc > 2:108775/1‑150 (MQ=255) gtgcCGCCCTTCGC‑GGGCAC‑GCCCGCGACGGGTTGCACCG‑CAACCCCAAAACACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGACAGCAGGTTCTCACg < 2:2111105/149‑1 (MQ=255) caacccTTCGC‑GGGCTT‑GCACGCGAAGGGCTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGAcagca > 1:560837/4‑137 (MQ=38) caacccTTCGC‑GGGCTT‑GCACGCGAAGGGCTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGAcagca < 2:560837/134‑1 (MQ=38) cAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGACAGCAGGTTCTCACGCTc > 1:70054/1‑150 (MQ=255) aacccTTCGC‑GGGCTT‑GCACGCGAAGGGCTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGACAGCAGGTTCTCACGCTcc > 2:221151/3‑150 (MQ=38) aGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGACAGCAGGTTCTCACGCTcc > 1:5445229/1‑150 (MQ=255) aGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGACAGCAGGTTCTCACGCTcc > 1:2623044/1‑150 (MQ=255) acccTTCGC‑GGGCTT‑GCACGCGAAGGGTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGACAGCAGGTTCTCACGCTccc > 2:1590953/2‑150 (MQ=255) ccTTCGC‑GGGCTT‑GCACGCGAAGGGCTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGACAGCAGGTTCTCACGCTCCCAg > 2:4867387/1‑150 (MQ=39) cTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGACAGCAGGTTCTCACGCTCCCAgg > 1:44375/1‑150 (MQ=255) cTTCGC‑GGGCTT‑GCACGCGAAGGGCTGCAACG‑CAACCCCGGTACGCTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGACAGCAGGTTCTCACGCTCCCAgg > 1:4498479/1‑150 (MQ=37) cTTCGC‑GGGCTT‑GCACGCGAAGGGCTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGACAGCAGGTTCTCACGCTCCCAgg > 1:5086871/1‑150 (MQ=39) cTTCGC‑GGGCTT‑GCACGCGAAGGGCTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGACAGCAGGTTCTCACGCTCCCAgg > 1:4519765/1‑150 (MQ=39) tCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGACAGCAGGTTCTCACGCTCCCAGGcc > 2:429711/1‑150 (MQ=255) tCGC‑GGGCTT‑GCACGCGAAGGGTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGACAGCAGGTTCTCACGCTCCCAGGcc > 2:3969098/1‑150 (MQ=255) tCGC‑GGGCTT‑GCACGCGAAGGGTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGACAGCAGGTTCTCACGCTCCCAGGcc > 2:3968891/1‑150 (MQ=255) gc‑gTGCAA‑GCCCGCGATGGGTTGAAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGACAGCAGGTTCTCACGCTCCCAGGCCgg < 2:353458/150‑1 (MQ=255) gCAA‑GCCCGCGAAGGGTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGACAGCAGGTTCTCACGCTCCCAGGCCGGCAgt < 2:1743684/150‑1 (MQ=255) aa‑GCCCGCGAAGGGTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGACAGCAGGTTCTCACGCTCCCAGGCCGGCAgtgt > 1:1927219/1‑150 (MQ=255) | CAGGTGCGCGATGTGATGGTGAATGGGCAATGGGTGGTGCGCCAGGGGCGGCATGCCCAGGAAGATGAAAGCGGGCGGGCGTTTGCCAAGGTGTTGCGCCAGCTTTTGGGCTGAGCGTACCGGGGTTGCGTTGCAGCCCTTCGC‑GTGCAA‑GCCCGCGAAGGGTTGCAACG‑CAACCCCAAAAAACTCAGTGCATTTTTACTATTTGCTGATCGGACGCCCGCCAGATCAAGCGGCTGGTGTCATACCCCTGCTGCCGCGCCCTGGACAGCAGGTTCTCACGCTCCCAGGCCGGCAGTGT > NC_002947/5745327‑5745624 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |