Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,985,185 | G→C | 7.0% | Q275H (CAG→CAC) ‡ | PP_5242 → | GAF domain‑containing sensor histidine kinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,985,185 | 0 | G | C | 7.0% | 1002.5 / 46.8 | 299 | Q275H (CAG→CAC) ‡ | PP_5242 | GAF domain‑containing sensor histidine kinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (146/132); new base C (5/16); total (151/148) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.26e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 301 total aligned reads displayed.
CATGCTGGTGTGCAGCCGCGGGCGGCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAATCGCGATAGCAAAC > NC_002947/5985036‑5985333 | cATGCTGGTGTGCAGCCGCGGGCGGCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAg > 2:845309/1‑150 (MQ=255) gCTGGTGTGCAGCCGCGGGCGGCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCgg < 1:3350453/150‑1 (MQ=255) tGGTGTGCAGCCGCGGGCGGCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCGTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCa > 1:5244684/1‑150 (MQ=255) ggTGTGCAGCCGCGGGCGGCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAg > 1:3803920/1‑150 (MQ=255) gtgCAGCCGCGGGCGGCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCCCACTGCCGCTGGCAGTga < 2:3960329/150‑2 (MQ=255) gtgCAGCCGCGGGCGGCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCCCACTGCCGCTGGCAGTga < 1:1775900/150‑2 (MQ=255) gtgCAGCCGCGGGCGGCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCCCACTGCCGCTGGCAGTga < 2:3985300/150‑2 (MQ=255) tgCCGCCGCGGGCGGCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGCGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCCCACTGCCGCTGGCAGTgag < 1:2011942/150‑3 (MQ=255) tgCAGCCGCGGGCGGCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCCCACTGCCGCTGGCAGTgag < 1:4150843/150‑3 (MQ=255) tgCAGCCGCGGGCGGCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCCCACTGCCGCTGGCAGTgag < 1:4419734/150‑3 (MQ=255) tgCAGCCGCGGGCGGCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCCCACTGCCGCTGGCAGTgag < 2:5017115/150‑3 (MQ=255) gCAGCCGCGGGCGGCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGgc < 2:2468146/150‑1 (MQ=255) gCAGCCGCGGGCGGCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGAgc < 2:1098042/150‑1 (MQ=255) gCCGCGGGCGGCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGgccgc < 1:5571483/150‑1 (MQ=255) gCCGCGGGCGGCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCCCACTGCCGCTGGCAGTGAgccaa < 2:5243567/150‑3 (MQ=255) gCCGCGGGCGGCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCCCACTGCCGCTGGCAGTGAgccaa < 1:1500300/150‑3 (MQ=255) ccGCGGGCGGCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGgccgcc < 2:774568/150‑1 (MQ=255) cgggcggCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCcac < 2:4532663/150‑1 (MQ=255) ccAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCa < 1:4984150/150‑1 (MQ=255) ccAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCa > 1:2364218/1‑150 (MQ=255) ccAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCa < 1:1020908/150‑1 (MQ=255) aGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATg < 1:1599646/150‑1 (MQ=255) aCAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCa < 2:4493424/150‑1 (MQ=255) aaGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCa > 2:27170/1‑150 (MQ=255) gTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGc > 2:761868/1‑150 (MQ=255) ccGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTgc < 2:47933/150‑1 (MQ=255) gCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTgcgc > 2:2218925/1‑150 (MQ=255) cTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGa < 1:4445750/150‑1 (MQ=255) tCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGAc > 1:4036570/1‑150 (MQ=255) tCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGAc > 1:1198947/1‑150 (MQ=255) cccTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGAcc < 2:3878141/150‑1 (MQ=255) ccTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGAccc > 1:1705552/1‑150 (MQ=255) cAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGt > 2:4180202/1‑150 (MQ=255) aGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTa < 1:2612167/150‑1 (MQ=255) gTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGccc > 1:2061245/1‑150 (MQ=255) tCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCg > 2:2567586/1‑150 (MQ=255) tGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGcc > 1:720882/1‑150 (MQ=255) ggCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCa > 1:4949043/1‑150 (MQ=255) 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1:4866667/150‑1 (MQ=255) gCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGttt < 2:1215213/150‑1 (MQ=255) cAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCCCTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCCTGGCACCCTTCACCACCGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTgg < 2:4344317/150‑1 (MQ=255) cAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTgg > 1:1092132/1‑150 (MQ=255) aaaGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGc > 1:3458414/1‑150 (MQ=255) aaaGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGc > 1:698416/1‑150 (MQ=255) 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tGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCt < 2:4591513/150‑1 (MQ=255) tGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCt < 2:1360104/150‑1 (MQ=255) tGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCt > 2:3511566/1‑150 (MQ=255) tGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCt > 2:1839033/1‑150 (MQ=255) aCTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCACGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGa < 1:1419962/150‑1 (MQ=255) ttGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAAt > 1:4587433/1‑150 (MQ=255) ttGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAAt > 2:3275662/1‑150 (MQ=255) tGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAATc < 2:2364218/150‑1 (MQ=255) ggCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCAcc > 1:2409727/1‑127 (MQ=255) cTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAATcgcg < 2:3787628/150‑1 (MQ=255) tCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGTCAcgc > 1:4686170/1‑84 (MQ=255) tCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCACAAGGCTCTCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAATCGCGa > 2:4675916/1‑150 (MQ=255) tCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAATCGCGa < 1:3973471/150‑1 (MQ=255) cACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAATCGCGAt < 1:2090969/150‑1 (MQ=255) cTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAATCGCGATAg > 1:1378631/1‑150 (MQ=255) tGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAATCGCGATAGc > 1:4535996/1‑150 (MQ=255) gCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAATCGCGATAGCa < 2:3083251/150‑1 (MQ=255) ccAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAATCGCGATAGCaa > 1:3725262/1‑150 (MQ=255) cAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAATCGCGATAGCaaa < 2:4096191/150‑1 (MQ=255) cAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCGTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAATCGCGATAGCaac < 2:2991758/150‑2 (MQ=255) aGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAATCGCGATAGCAAAc > 2:2641144/1‑150 (MQ=255) | CATGCTGGTGTGCAGCCGCGGGCGGCCAGCGAAGCGGACAGCAAGGTGCCGCACTCCCTCAGCCTGGTCCTGGCAAAGGCCTTGGCCAAAGAGCCGGACGCCCGCTACCAGAGCGCGCGCGCCTTTGCAGTGGACTTGGCTCACTGCCAGCGGCAGTGGGCCGCCCACAAAACCATGGCACCCTTCACCCCAGGCTGCGCCGACCCGGTAGCGCCCGGCCACGCGCGCCTGTTTGGCCGCGGCGCCGAGCAAAAGGCTATCACCCTGCTGCTCAAGGCCTTGAATCGCGATAGCAAAC > NC_002947/5985036‑5985333 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |