| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_002947 | 6,018,841 | G→A | 24.5% | intergenic (+41/+69) | xpt → / ← PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 6,018,841 | 0 | G | A | 24.5% | 212.5 / 70.6 | 115 | intergenic (+41/+69) | xpt/PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (41/45); new base A (11/17); total (52/63) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.15e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
GAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGC > NC_002947/6018692‑6018988 | gaAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATACACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTg < 2:5311631/150‑1 (MQ=255)gaAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTg < 2:1467963/150‑1 (MQ=255) ttCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGcaca < 2:2015888/150‑1 (MQ=255) 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cacaGGTACGGCACAGCGT‑TCGAGACCTGT‑GCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGGATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCa > 1:516462/1‑150 (MQ=25) cacaGGTACGGCACAGCGT‑TCGAGACCTGT‑GCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCa > 1:1435496/1‑150 (MQ=25) cacaGGTACGGCACAGCGT‑TCGAGACCTGT‑GCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCa > 1:2624093/1‑150 (MQ=25) cacaGGTACGGCACAGCGT‑TCGAGACCTGT‑GCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCa > 1:3882726/1‑150 (MQ=25) cccggTGCCGCACAGGTC‑TCGAACGGTGT‑GCCGTCCCTGGGGGCGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCaa < 1:333085/147‑1 (MQ=255) acaGGTGCAGCACAGGTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCaa > 1:3478958/1‑150 (MQ=255) acaGGTGCAGCACAGGTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCaa > 1:1580852/1‑150 (MQ=255) acaGGTGCAGCACAGGTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCaa > 1:4933351/1‑150 (MQ=255) acaGGTGCAGCACAGGTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCaa > 2:2776597/1‑150 (MQ=255) acaGGTACGGCACAGCGT‑TCGAGACCTGT‑GCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCaa > 1:3862322/1‑150 (MQ=25) acaGGTACGGCACAGCGT‑TCGAGACCTGT‑GCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCaa > 1:1283364/1‑150 (MQ=25) aGGTGCAGCACAGGTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACt > 1:2514309/1‑150 (MQ=255) aGGTGCAGCACAGGTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACt > 1:2304748/1‑150 (MQ=255) aGGTGCAGCACAGGTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACt < 2:2304748/150‑1 (MQ=255) aGGTGCAGCACAGGTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACt > 2:2699176/1‑150 (MQ=255) gTGCAGCACAGGTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGc > 1:1415649/1‑150 (MQ=255) | GAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGC > NC_002947/6018692‑6018988 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |