| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 6,018,851 | 0 | T | G | 28.6% | 202.1 / 85.5 | 116 | intergenic (+51/+59) | xpt/PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (40/42); new base G (17/16); total (57/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.39e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
CGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAG > NC_002947/6018707‑6018999 | cggcCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTC‑TCGa < 1:3992343/150‑1 (MQ=255) gTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTC‑TCGAACGCt < 1:5003053/150‑1 (MQ=255) gCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTC‑TCGAACGCtgt < 1:5285869/150‑1 (MQ=255) 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cggtcccgcaCCGGTC‑GCCACCGCTGT‑GCCGCCCGTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACt < 1:1505501/143‑1 (MQ=255) aGGTGCAGCACAGGTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACt < 2:2304748/150‑1 (MQ=255) aGGTGCAGCACAGGTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACt > 1:2304748/1‑150 (MQ=255) aGGTGCAGCACAGGTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACt > 1:2514309/1‑150 (MQ=255) aGGTGCAGCACAGGTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACt > 2:2699176/1‑150 (MQ=255) gTGCAGCACAGGTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGc > 1:1415649/1‑150 (MQ=255) cagcaCAGGTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGttct > 1:2927791/1‑117 (MQ=255) cagcaCAGGTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGttct < 2:2927791/117‑1 (MQ=255) cacaGGTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTaa < 1:1304724/121‑1 (MQ=255) cacaGGTC‑GCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGc < 2:1134579/150‑1 (MQ=255) aGGTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCAGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGACAGCCCCGCCAACAACCAGAGCTGGTAAAGTGCTTCTTTAAGCCCCTGCGGAAGCCCCAACTGCATCCGcccc > 2:3790453/1‑150 (MQ=255) gTC‑TCGACCGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAg < 2:4570616/150‑1 (MQ=255) gTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGTATCCGCCCCAg > 2:4846350/1‑150 (MQ=255) gTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAg > 1:3897372/1‑150 (MQ=255) gTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAg > 1:3897750/1‑150 (MQ=255) gTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAg > 1:1931679/1‑150 (MQ=255) | CGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAG > NC_002947/6018707‑6018999 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |