| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 6,018,857 | 0 | A | G | 23.4% | 221.1 / 66.3 | 118 | intergenic (+57/+53) | xpt/PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (49/36); new base G (12/15); total (61/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.71e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.49e-02 | |||||||||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
CCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCT > NC_002947/6018710‑6019005 | ccGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTC‑TCGaa < 2:1975816/148‑1 (MQ=255)ccGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTC‑TCGaa > 1:1975816/1‑148 (MQ=255) gTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTC‑TCGAACGCt < 1:5003053/150‑1 (MQ=255) 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aGGTGCAGCACAGGTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACt > 2:2699176/1‑150 (MQ=255) aGGTGCAGCACAGGTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACt > 1:2304748/1‑150 (MQ=255) aGGTGCAGCACAGGTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACt > 1:2514309/1‑150 (MQ=255) tacggcaCAGCTT‑TCGAGACCTGT‑GCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCa > 2:294700/5‑150 (MQ=37) cagcaCAGGTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGttct < 2:2927791/117‑1 (MQ=255) cagcaCAGGTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGttct > 1:2927791/1‑117 (MQ=255) cacaGGTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTaa < 1:1304724/121‑1 (MQ=255) cacaGGTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTaa > 2:1304724/1‑121 (MQ=255) cacaGGTC‑GCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGc < 2:1134579/150‑1 (MQ=255) aGGTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCAGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGACAGCCCCGCCAACAACCAGAGCTGGTAAAGTGCTTCTTTAAGCCCCTGCGGAAGCCCCAACTGCATCCGcccc > 2:3790453/1‑150 (MQ=255) gTC‑TCGACCGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAg < 2:4570616/150‑1 (MQ=255) 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tcGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTg > 1:1261881/1‑150 (MQ=255) cGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTgg > 1:2604275/1‑150 (MQ=255) gAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGc > 2:2973155/1‑150 (MQ=255) gAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGc > 2:1770967/1‑150 (MQ=255) aaCGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCt > 2:1293117/1‑150 (MQ=255) | CCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTC‑TCGAACGCTGT‑GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAT‑CTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCT > NC_002947/6018710‑6019005 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |