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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 6,037,790 | 0 | C | T | 7.4% | 363.8 / 12.7 | 122 | intergenic (+49/+87) | dppA‑IV/PP_5284 | dipeptide transport protein/hypothetical protein |
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Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
CGCACCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTA‑CCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCACCAATGATGATG > NC_002947/6037641‑6037937 | cgcACCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAgcgc < 2:1876936/150‑1 (MQ=255) gcACCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGcc > 1:4088620/1‑150 (MQ=255) gcACCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGcc < 1:2149811/150‑1 (MQ=255) 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tACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTA‑CCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCAc > 1:4539212/1‑150 (MQ=255) tACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTA‑CCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCAc > 1:3816516/1‑150 (MQ=255) tACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTA‑CCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCAc > 1:1216920/1‑150 (MQ=255) tACAGGGGCAGCCCCAGCCTGGCA‑CTACACCCAA‑CCCCTGAAGGACCGGGAATACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCACAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCAc < 2:2841150/150‑1 (MQ=255) cAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTA‑CCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTcc > 2:2715494/1‑141 (MQ=255) ggggTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTA‑CCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCACCAat < 2:3281416/150‑1 (MQ=255) gggTAGCGCCAGCCTGGCT‑GTTGACGCTA‑CCCCTTTAGGAGGGGTTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCACCAatg < 1:5086064/150‑1 (MQ=255) ggaGCGCCAGCCTGGCC‑GTTGACGCTA‑CCCCTTTTGGTGGGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCACCAatgat < 1:1547124/148‑1 (MQ=255) gTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTA‑CCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAcagg > 1:5269032/1‑66 (MQ=14) gTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTA‑CCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAcagg < 2:5269032/69‑4 (MQ=14) gTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTA‑CCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAcagg < 2:5269031/69‑4 (MQ=14) gTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTA‑CCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAcagg > 1:5269031/1‑66 (MQ=14) gTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTA‑CCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCACCAatgat > 2:5181924/1‑150 (MQ=255) tAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTA‑CCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCACCAatgatg > 1:3508815/1‑150 (MQ=255) tAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTA‑CCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCACCAatgatg > 1:3508904/1‑150 (MQ=255) gcgcCAGCCTGGCT‑GTTGACGCTA‑CCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCACCAatgatgat < 1:2760648/150‑1 (MQ=255) gcgcCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTA‑CCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCCCAATCCACCCAGGCTCGACCGGCGACACCGGCGCCCCGGCGCCCatgatgag > 2:2998599/1‑149 (MQ=38) gcgcCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTA‑CCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCACCAatgatgat < 2:2678385/150‑1 (MQ=255) gcgcCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTA‑CCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCACCAatgatgat > 2:749635/1‑150 (MQ=255) ccgcCACCCTCGCA‑GTTCACCCAA‑CCCCAGAAGCAGCGGCAAAACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAACGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCACCAatgatgat < 2:1454577/149‑1 (MQ=255) cgcCAGCCTGGCT‑GTTGCCGCTA‑CCCGTTTTGGTGGGGTTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCACCAatgatgatg < 1:599664/150‑1 (MQ=255) | CGCACCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCA‑GTTGACGCTA‑CCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACCATCGACAACGGCTCCCCATCACCAATGATGATG > NC_002947/6037641‑6037937 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |