| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 90,430 | G→T | 5.5% | intergenic (+105/+17) | PP_0079 → / ← PP_0080 | transcriptional regulator/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 90,430 | 0 | G | T | 5.5% | 725.0 / 20.4 | 217 | intergenic (+105/+17) | PP_0079/PP_0080 | transcriptional regulator/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (111/94); new base T (6/6); total (117/100) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.76e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.37e-01 | |||||||||||
Only 100 of 231 total aligned reads displayed.
ATCGAGCGGTTTGTGGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGA > NC_002947/90281‑90579 | aTCGAGCGGTTTGTGGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTgcg > 1:4162746/1‑150 (MQ=255) gAGCGGTTTGTGGAGTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCgcag < 2:756574/150‑1 (MQ=255) ggggTTTGGGCCTTGGTGGCAGCAGGAGCGCCGCCTTGGAGCGTTGGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCgcagca < 1:3892453/148‑1 (MQ=37) gCGGTTTTTGTATTGTTTGCAGCAGGAGCGCAGCCTTTTAGATTTTGGGCCCGATTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCgcagca < 1:1409911/150‑1 (MQ=38) gCGGTTTGTGGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCGGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCgcagca < 2:4272048/150‑1 (MQ=255) gCGGTTTGTGGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCgcagca < 2:4382602/150‑1 (MQ=255) gTTTGTGGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCAAGTGGGAGCGGCCTTGCGTAGCGATGGGCTGCGCAGCAGcc > 1:2975184/1‑150 (MQ=255) ttGTGGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGcccc < 1:199545/150‑1 (MQ=255) ggATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCa > 1:1779557/1‑150 (MQ=255) ttggttggAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATc < 1:3625861/150‑1 (MQ=255) tggttggAGCAGGAGCGCAGCCTTTTAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCt < 1:2918105/150‑1 (MQ=255) ggttggAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTa < 2:3064322/150‑1 (MQ=255) ggttggAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTa < 2:2899138/150‑1 (MQ=255) ggttggAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTa < 2:1278024/150‑1 (MQ=255) ggttggAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTa < 2:4591802/150‑1 (MQ=255) ggttggAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTa < 2:3926557/150‑1 (MQ=255) gttggAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGGCACAAGGCCGCGCCCACAGGGGCACTGCACACGCCGGCCCAAGTGGGGGCGGCCATGCGTCGCGATGGGCTGCGCCGCAGCCCCCGCCATCTAg > 1:1012508/1‑150 (MQ=37) gttggAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAATGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACAAGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCGGCGCAGCCCCCCCCGCAATCTAg > 1:3841480/1‑150 (MQ=38) 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gcgcAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCCCGCCCACACTGGCACAGCACACCCCCGCCCCGGTGGGAGCGGCCGTGCGTCGCGATGGGCGGCGCCGCACCCCCCGCAATCTAGACCACGAAGTTc > 1:3784356/1‑150 (MQ=25) cgcAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCa < 2:2330862/150‑1 (MQ=255) gcAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAg < 1:3002413/150‑1 (MQ=255) gcAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAg < 1:4436626/150‑1 (MQ=255) gcAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAg < 2:3117454/150‑1 (MQ=255) cAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAgg < 2:4178641/150‑1 (MQ=255) tttGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTgctc < 1:4572701/150‑1 (MQ=255) tGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGTAGTTCAGGTgctcgc > 2:2042955/1‑150 (MQ=255) aTTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCg > 2:4217626/1‑150 (MQ=255) aTTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTTCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGCAGTTCAGGTGCTCGCTCCg > 1:1616640/1‑150 (MQ=255) ttttGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCgg < 1:5488003/150‑1 (MQ=255) ttgggggCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGt < 1:2337482/147‑1 (MQ=255) tGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGc < 2:4153292/150‑1 (MQ=255) gggCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCaa < 2:492371/150‑1 (MQ=255) ggCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCGCCCACCGGGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCCATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCCAg > 2:83640/1‑150 (MQ=39) 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tCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGa > 2:3021768/1‑150 (MQ=255) tCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGa > 1:4926034/1‑150 (MQ=255) tCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGa < 2:365638/150‑1 (MQ=255) tCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGa > 2:1201231/1‑150 (MQ=255) ccACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATc > 1:3088830/1‑150 (MQ=255) 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ccATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTcag > 2:1609268/1‑150 (MQ=255) cATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCgg > 2:1955330/1‑82 (MQ=255) cATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTcagc > 1:4121201/1‑150 (MQ=255) tgtgGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTcagcca > 1:653140/1‑150 (MQ=255) gAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCa > 2:2751227/1‑150 (MQ=255) gAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAACCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCa < 2:3801700/150‑1 (MQ=255) aGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCagccagcc > 2:2155283/1‑147 (MQ=255) aGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCagccagcc < 1:2155283/147‑1 (MQ=255) aGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAg < 1:2541245/150‑1 (MQ=255) ccTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTcc > 2:5585719/1‑150 (MQ=255) cTTGCGTCGCGATGTGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCa < 1:1098195/150‑1 (MQ=255) cTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCa < 2:689125/150‑1 (MQ=255) ttGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAg > 1:2808092/1‑150 (MQ=255) cGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGt < 2:2668446/150‑1 (MQ=255) gTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGtcca < 2:1022321/73‑1 (MQ=255) cgcgATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGcc < 2:3412997/150‑1 (MQ=255) cgATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCtt < 1:4751286/150‑1 (MQ=255) ccggggCTGCTGCGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTcagccag > 2:5472633/4‑129 (MQ=255) cggggCTGCTGCGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCg > 2:1761859/3‑150 (MQ=255) aTGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCg < 2:389359/150‑1 (MQ=255) aTGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCg < 1:716443/150‑1 (MQ=255) tGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCgg < 1:729191/150‑1 (MQ=255) ggggCTGCTGCGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGc < 1:548153/93‑1 (MQ=255) ggCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGtc > 2:4430307/1‑149 (MQ=255) gCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTAc > 1:188034/1‑150 (MQ=255) cTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACt > 2:4654460/1‑150 (MQ=255) | ATCGAGCGGTTTGTGGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCGGCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGTGCCTTCGGTACTGCGA > NC_002947/90281‑90579 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |