| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,165,540 | C→T | 100% | L133F (CTC→TTC) | gtsC → | mannose/glucose ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,165,540 | 0 | C | T | 99.0% | 1023.6 / ‑2.1 | 286 | L133F (CTC→TTC) | gtsC | mannose/glucose ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/3); new base T (145/137); total (145/141) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.17e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 286 total aligned reads displayed.
GCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAGGCCGCGCGGTTGGACGGTGCC > NC_002947/1165393‑1165686 | gcgGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTc < 1:388941/150‑1 (MQ=255) tGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCa > 2:2301954/1‑150 (MQ=255) cTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAg > 2:4420846/1‑150 (MQ=255) gATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCt > 2:1841340/1‑150 (MQ=255) aTCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCtt > 1:1748905/1‑150 (MQ=255) tctcCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTtg < 2:3617773/150‑1 (MQ=255) ctcCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTtgg > 2:3877543/1‑150 (MQ=255) tcCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTtggc < 1:4422097/150‑1 (MQ=255) aCCGCGGTTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTtggcctg < 1:4114588/150‑1 (MQ=255) aCCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTtggcctg < 2:778859/150‑1 (MQ=255) aCCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTtggcctg > 2:5145813/1‑150 (MQ=255) aCCGCGATGGGTGCACTGAACGGCTAGGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTtggcctg > 2:266584/1‑150 (MQ=255) cgcgATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTtggcctggc > 1:5188406/1‑150 (MQ=255) cgcgATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTtggcctggc > 1:4208041/1‑150 (MQ=255) cgcgATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTtggcctggc < 1:88814/150‑1 (MQ=255) cgcgATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTtggcctggc < 1:3505936/150‑1 (MQ=255) cgATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCa < 1:1706511/150‑1 (MQ=255) gTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCa > 1:722667/1‑150 (MQ=255) gTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCa > 1:849157/1‑150 (MQ=255) gAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACtggtgg > 1:104156/1‑150 (MQ=255) aaCGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGc < 1:2955652/150‑1 (MQ=255) aaCGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGc > 2:5512436/1‑150 (MQ=255) aaCGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGc < 2:2808276/150‑1 (MQ=255) cTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCctggt > 1:4595609/1‑150 (MQ=255) tATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCctggtg < 1:3628619/150‑1 (MQ=255) aTGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCctggtgc > 1:2012147/1‑150 (MQ=255) tgCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCctggtgctgg < 2:314207/150‑1 (MQ=255) gCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCctggtgctggt < 1:5437231/150‑1 (MQ=255) gcacGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCtggtgctggtgc < 2:5208940/147‑1 (MQ=255) tCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCAt < 1:3849632/150‑1 (MQ=255) tCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCAt < 2:4290373/150‑1 (MQ=255) tCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCGGGTGCAt > 2:678162/1‑150 (MQ=255) tCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTACCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCAt < 2:2604433/150‑1 (MQ=255) gtgGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGt < 1:3964070/150‑1 (MQ=255) tgGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTc > 2:5103775/1‑150 (MQ=255) ggCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCt < 1:1888991/150‑1 (MQ=255) gcgcTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTa > 1:5335150/1‑150 (MQ=255) gcTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACg > 1:1062856/1‑150 (MQ=255) gcTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACg > 1:1262219/1‑150 (MQ=255) gcTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACg > 1:3067747/1‑150 (MQ=255) ttCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACggc < 2:1639199/150‑1 (MQ=255) ttCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACggc > 2:1500603/1‑150 (MQ=255) ccGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACggcct < 2:1913929/150‑1 (MQ=255) cGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACggcctg < 1:5470457/150‑1 (MQ=255) aGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACggcctggc > 1:4936355/1‑150 (MQ=255) gTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACggcctggcct > 2:2543484/1‑150 (MQ=255) tCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTc < 1:4732386/150‑1 (MQ=255) cGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTca > 2:859332/1‑150 (MQ=255) gCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTcac > 1:4723582/1‑150 (MQ=255) cAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTcacc < 2:4595609/150‑1 (MQ=255) aaCTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTcacca > 1:4859828/1‑150 (MQ=255) aCTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGGGGTCTACGGCCTGGCCTTcaccac < 2:3385049/150‑1 (MQ=255) tGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGc > 2:5411335/1‑150 (MQ=255) 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cTGCCGGTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATcccc < 1:3388362/150‑1 (MQ=255) tGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTTACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCg > 2:4932912/1‑150 (MQ=255) tGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCg > 2:192726/1‑150 (MQ=255) tGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCg > 2:4035813/1‑150 (MQ=255) gTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGAcgc < 1:4100917/150‑1 (MQ=255) 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gACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGt < 1:2176674/150‑1 (MQ=255) gACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGt < 1:5007090/150‑1 (MQ=255) cGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCaa > 1:5267270/1‑150 (MQ=255) gctgcCGGCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAGGCcgc > 2:3279870/1‑150 (MQ=255) cGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAGGCCGCGCGGt < 2:4698230/150‑1 (MQ=255) ggCCTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAGGCCGCGCGGtt > 2:4977313/1‑150 (MQ=255) ccTCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAGGCCGCGCGGTTgg > 2:4361864/1‑150 (MQ=255) tCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCGACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAGGCCGCGCGGTTGGAc < 1:5238614/150‑1 (MQ=255) tCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAGGCCGCGCGGTTGGAc > 2:13880/1‑150 (MQ=255) tCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAGGCCGCGCGGTTGGAc > 2:1598983/1‑150 (MQ=255) tCGTTCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAGGCCGCGCGGTTGGAc > 1:3162704/1‑150 (MQ=255) ttCACCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAGGCCGCGCGGTTGGACGGt > 1:1469252/1‑150 (MQ=255) aCCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAGGCCGCGCGGTTGGACGGTGcc < 2:5188406/150‑1 (MQ=255) aCCTTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAGGCCGCGCGGTTGGACGGTGcc < 2:1735899/150‑1 (MQ=255) | GCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCGGCAAGCTTGGCCTGGCCAGTACCACTGGTGGCCTGGTGCTGGTGCATGTGGTCTACGGCCTGGCCTTCACCACGCTGTTCTTCCGCAACTTCTACGTGAGCATCCCCGACGCGCTGGTCAAGGCCGCGCGGTTGGACGGTGCC > NC_002947/1165393‑1165686 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |