Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 1,189,543 | 0 | G | C | 15.3% | 327.9 / 47.7 | 118 | intergenic (‑204/‑208) | mltF/purL | membrane‑bound lytic murein transglycosylase F/phosphoribosylformylglycinamidine synthase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (46/54); new base C (8/10); total (54/64) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.61e-01 |
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
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gaTCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCAGAATGTGTCGAGCCGGACACCT‑GCGGCGCTCGATCTCGTCTCAAGCCGGACACCTCTGAAAACTGACCCCGAAGTCCGGTTCCGCCGCCCGGCAGGCGTGGCTTAGAGc < 2:806828/150‑1 (MQ=255) gaTCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCAGAATGTGTCGAGCCGGACACCT‑GCGGCGCTCGATCTCGTCTCAAGCCGGACACCTCTGAAAACTGACCCCGAAGTCCGGTTCCGCCGCCCGGCAGGCGTGGCTTAGAGc > 1:3081618/1‑150 (MQ=255) aTCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCAGAATGTGTCGAGCCGGACACCT‑GCGGCGCTCGATCTCGTCTCAAGCCGGACACCTCTGAAAACTGACCCCGAAGTCCGGTTCCGCCGCCCGGCAGGCATGGCTTAGAGCa < 1:139394/150‑1 (MQ=255) tCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCAGAATGTGTCGAGCCGGACACCT‑GCGGCGCTCGATCTCGTCTCAAGCCGGACACCTCTGAAAACTGACCCCGAAGTCCGGTTCCGCCGCCCGGCAGGCGTGGCTTAGAGCAg > 2:747699/1‑150 (MQ=255) tCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCAGAATGTGTCGAGCCGGACACCT‑GCGGCGCTCGATCTCGTCTCAAGCCGGACACCTCTGAAAACTGACCCCGAAGTCCGGTTCCGCCGCCCGGCAGGCGTGGCTTAGAGCAg > 2:1835187/1‑150 (MQ=255) cGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCAGAATGTGTCGAGCCGGACACCT‑GCGGCGCTCGATCTCGTCTCAAGCCGGACACCTCTGAAAACTGACCCCGAAGTCCGGTTCCGCCGCCCGGCAGGCGTGGCTTAGAGCAgg < 1:1145696/150‑1 (MQ=255) gAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCAGAATGTGTCGAGCCGGACACCT‑GCGGCGCTCGATCTCGTCTCAAGCCGGACACCTCTGAAAACTGACCCCGAAGTCCGGTTCCGCCGCCCGGCAGGCGTGGCTTAGAGCAGGt > 2:3346864/1‑150 (MQ=255) gAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCAGAATGTGTCGAGCCGGACACCT‑GCGGCGCTCGATCTCGTCTCAAGCCGGACACCTCTGAAAACTGACCCCGAAGTCCGGTTCCGCCGCCCGGCAGGCGTGGCTTAGAGCAGGt > 1:310837/1‑150 (MQ=255) gAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCAGAATGTGTCGAGCCGGACACCT‑GCGGCGCTCGATCTCGTCTCAAGCCGGACACCTCTGAAAACTGACCCCGAAGTCCGGTTCCGCCGCCCGGCAGGCGTGGCTTAGAGCAGGt > 2:5265226/1‑150 (MQ=255) aGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCAGAATGTGTCGAGCCGGACACCT‑GCGGCGCTCGATCTCGTCTCAAGCCGGACACCTCTGAAAACTGACCCCGAAGTCCGGTTCCGCCGCCCGGCAGGCGTGGCTTAGAGCAGGTg > 1:1330699/1‑150 (MQ=255) gcgcCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTCACCCGCGCAGAATGTGTCGAGCCGGACACCT‑CCGGCGCACGATCTCGTCTCAAGCCGGACACCTCTGAAAACTGACCCCGAACTCCGGTTCCGCCGCCCGGCAGGCGTGGCTTAGAGCAGgcgc < 1:373233/150‑1 (MQ=255) gcgcCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCAGAATGTGTCGAGCCGGACACCT‑GCGGCGCTCGATCTCGTCTCAAGCCGGACACCTCTGAAAACTGACCCCGAAGTCCGGTTCCGCCGCCCGGCAGGCGTGGCTTAGAGCAGGTGc > 2:4913847/1‑150 (MQ=255) cgccgcGCGGGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCAGAATGTGTCGAGCCGGACACCT‑GCGGCGCTCGATCTCGTCTCAAGCCGGACACCTCTGAAAACTGACCCCGAAGTCCGGTTCCGCCGCCCGGCAGGCGTGGCTTAGAGCAGGTGcc < 2:4693589/150‑1 (MQ=255) gcgcgGGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCAGAATGTGTCGAGCCGGACACCT‑GCGGCGCTCGATCTCGTCTCAAGCCGGACACCTCTGAAAACTGACCCCGAAGTCCGGTTCCGCCGCCCGGCAGGCGTGGCTTAGAGCAGGTGCCGaaa < 1:4954977/150‑1 (MQ=255) gcgcgGGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCAGAATGTGTCGAGCCGGACACCT‑GCGGCGCTCGATCTCGTCTCAAGCCGGACACCTCTGAAAACTGACCCCGAAGTCCGGTTCCGCCGCCCGGCAGGCGTGGCTTAGAGCAGGTGCCGaaa > 1:2606805/1‑150 (MQ=255) | GTCTGGTAGCGGGTTGTGTGGTTGGGGGAGGGGGGATTGCATCAGGGCTGCCAGGTGGCCGGCTTGAGATATTCAGCGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCCAGGTGTCCGCCTTAAGATATTCAGCGCCTATGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCAGAATGTGTCGAGCCGGACACCT‑GCGGCGCTCGATCTCGTCTCAAGCCGGACACCTCTGAAAACTGACCCCGAAGTCCGGTTCCGCCGCCCGGCAGGCGTGGCTTAGAGCAGGTGCCGAAA > NC_002947/1189395‑1189687 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |