Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 1,539,893 | 0 | G | A | 5.9% | 593.4 / 17.2 | 186 | intergenic (+93/‑90) | secA/argJ | protein translocase subunit SecA/glutamate N‑acetyltransferase/amino acid acetyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (108/67); new base A (7/4); total (115/71) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 189 total aligned reads displayed.
CCGTGCTGGTGTGGTTCGGGCAAGAAGTTCAAGCATTGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCG > NC_002947/1539744‑1540040 | ccGTGCTGGTGTGGTTCGGGCAAGAAGTTCAAGCATTGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACgg < 2:4184816/150‑1 (MQ=255) tgtgGTTCGGGCAAGAAGTTCAAGCATTGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTCTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATcc > 2:1661953/1‑150 (MQ=255) tgtgGGTCGGGCAAGAAGTTCAAGCATTGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCAGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATcc < 2:1128915/150‑1 (MQ=255) 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agTTCAAGCATTGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCGACACAAGGCCGCCCCCACAAGGATCGCGCCCGTTCATGGACGAGCGCGGTACCTGTGGGAGCGGCCtt < 2:4292640/150‑1 (MQ=18) agTTCAAGCATTGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCtt < 2:1972347/150‑1 (MQ=255) agTTCAAGCATTGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCtt < 1:3079680/150‑1 (MQ=255) cAAGCATTGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTgtgt > 1:1609518/1‑150 (MQ=255) aaGCATTGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTc < 1:2985746/150‑1 (MQ=255) 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tcgcgCCCGTTCATGGACGAGCGCGGTCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGt > 1:2650626/2‑150 (MQ=39) ccGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGt > 2:2078484/1‑150 (MQ=255) cgcgCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGttggtcttgg > 1:870520/1‑125 (MQ=255) cgcgCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGGGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TGTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTGGCCCACCCTGCCCCCGGtt > 2:2906663/1‑150 (MQ=255) cgcTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTcc > 2:5248851/1‑150 (MQ=255) gcTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCg < 2:5344943/150‑1 (MQ=255) tCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCggg > 1:5380804/1‑150 (MQ=255) cGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGt < 1:3788204/150‑1 (MQ=255) tCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGttt > 2:2109801/1‑150 (MQ=255) ccATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGtttt < 2:3794721/150‑1 (MQ=255) ccATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGtttt < 2:4428480/150‑1 (MQ=255) aTGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGa > 2:1266143/1‑150 (MQ=255) aTGAACGGGCGCGATCCGTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGa > 1:3928358/1‑150 (MQ=255) tGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGAGATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGaa > 2:1686769/1‑150 (MQ=255) tGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TGTTTCGACATCATCGTTTTGTCTAGGAGCGCTCTCATGGCTGTTGGTCTTGGGCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGaa > 2:2976192/1‑150 (MQ=255) aCGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGGTCCGGGTTTTGAACTc < 2:4472370/150‑1 (MQ=255) | CCGTGCTGGTGTGGTTCGGGCAAGAAGTTCAAGCATTGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCG > NC_002947/1539744‑1540040 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |