| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,539,899 | A→G | 5.1% | intergenic (+99/‑84) | secA → / → argJ | protein translocase subunit SecA/glutamate N‑acetyltransferase/amino acid acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,539,899 | 0 | A | G | 5.1% | 635.4 / 13.8 | 194 | intergenic (+99/‑84) | secA/argJ | protein translocase subunit SecA/glutamate N‑acetyltransferase/amino acid acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (118/66); new base G (7/3); total (125/69) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.15e-01 | |||||||||||
Only 100 of 195 total aligned reads displayed.
TGGTGTGGTTCGGGCAAGAAGTTCAAGCATTGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTATCGC > NC_002947/1539750‑1540047 | gtgtGGTTCGGGCAAGAAGTTCAAGCATTGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATc > 2:1801169/1‑150 (MQ=255) tgtgGTTCGGGCAAGAAGTTCAAGCAGTGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATcc < 2:5098996/150‑1 (MQ=255) gTTCGGGCAAGAAGTTCAAGCATTGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTtgt > 2:4739580/1‑150 (MQ=255) ggCAAGTAGTTCAAGCATTGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTggggg > 2:4191964/1‑150 (MQ=255) ggCAAGAAGTTCAAGCATTGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTggggg < 2:3571799/150‑1 (MQ=255) gCAAGAAGTTCAAGCATTGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGggc > 1:3066861/1‑150 (MQ=255) cAAGAAGTTCAAGCATTGTCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGggcg < 2:3096150/150‑1 (MQ=255) cAAGAAGTTCAAGCATTGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGggcg > 1:878885/1‑150 (MQ=255) agaagTTCAAGCATTGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGggcggc > 2:1162178/1‑150 (MQ=255) gaagTTCAAGCATTGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGggcgg < 1:1649616/148‑1 (MQ=255) gaagTTCAAGCATTGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGggcgg > 2:1649616/1‑148 (MQ=255) gaagTTCAAGCATTGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGcc > 1:2882161/1‑150 (MQ=255) agTTCAAGCATTGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCtt < 2:3662339/150‑1 (MQ=255) gTTCAAGCATTGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTtg > 1:400631/1‑150 (MQ=255) cAAGCATTGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTgtgt > 1:2556629/1‑150 (MQ=255) aaGCATTGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTc < 1:2985746/150‑1 (MQ=255) gCATTGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTcgc > 1:4428480/1‑150 (MQ=255) aTTGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑a < 2:2452514/150‑1 (MQ=255) tGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCCCCCACAAGGATCGCGCCCGTTCATGGACGAGCGCGGTACCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTTGCG‑aaa < 2:4235007/150‑3 (MQ=17) gCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCCTGAACGGGCGCGATCCGTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATgg > 1:4817488/1‑150 (MQ=255) aCGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCGTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGt > 1:3388617/1‑150 (MQ=255) cAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGaa < 1:1075371/150‑1 (MQ=255) gATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGc < 1:2666314/150‑1 (MQ=255) gAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGcc < 1:1039130/150‑1 (MQ=255) tGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑t > 1:1926248/1‑150 (MQ=255) tGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑t > 1:4900441/1‑150 (MQ=255) aTCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑ttt > 1:4770439/1‑150 (MQ=255) gAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCg > 1:967411/1‑150 (MQ=255) aaCCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGa < 1:5228605/150‑1 (MQ=255) aaCCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGa < 2:1361438/150‑1 (MQ=255) cTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑CTGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGAcat > 2:784706/1‑150 (MQ=255) ttACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGGGATGCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGAcatc > 2:3507217/1‑150 (MQ=255) ttACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGAcatc > 2:1515471/1‑150 (MQ=255) ttACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGAcatc > 2:2298023/1‑150 (MQ=255) tACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGAcatca < 1:4221408/150‑1 (MQ=255) cGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACatcatc > 1:3824342/1‑150 (MQ=255) gTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCg > 1:4353859/1‑150 (MQ=255) gTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGT‑CATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGtttt < 1:2146555/150‑1 (MQ=255) cAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGtttttt > 1:1161221/1‑150 (MQ=255) aaGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTc > 1:3733325/1‑150 (MQ=255) gCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTa > 1:4188578/1‑150 (MQ=255) gCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTa < 2:4841203/150‑1 (MQ=255) cTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAgg > 2:2335695/1‑150 (MQ=255) cTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGAGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTa > 2:4449554/1‑150 (MQ=255) tttGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGTCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTaa < 2:4365701/150‑1 (MQ=255) tttGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTaa > 1:2808673/1‑150 (MQ=255) tttGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTaa < 1:1258027/150‑1 (MQ=255) ttGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAAt < 2:668105/150‑1 (MQ=255) gCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATgg > 2:1906640/1‑150 (MQ=255) gCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTg > 2:3556432/1‑150 (MQ=255) ccTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGtt > 2:4795518/1‑150 (MQ=255) cGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGAGATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGttggtct > 1:115847/1‑150 (MQ=255) cGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGttggtct > 1:138526/1‑150 (MQ=255) gCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGttggtctt > 1:3677745/1‑150 (MQ=255) cAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGttggtcttg < 2:2132168/150‑1 (MQ=255) cacaAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGttggtcttggtc > 1:3578232/1‑150 (MQ=255) acaAGGCCGCCCCCACAAGGATCGCGCCCGTTCATGGACGAGCGCGGTACCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTTGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTcc > 1:2379666/1‑150 (MQ=18) aaGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCtt > 1:3147564/1‑150 (MQ=255) aaGGCCGCCCCCACAAGGATCGCGCCCGTTCATGGACGAGCGCGGTACCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCtt > 1:1449684/1‑150 (MQ=18) aGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTGTTCTAGGAGCGCTCTCATGGCTGTTGGTCTTGGTCCttt < 2:823844/150‑1 (MQ=255) ggCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTg < 2:756155/150‑1 (MQ=255) ggCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑‑TTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGc > 2:1195243/1‑150 (MQ=255) gCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGc > 2:5132877/1‑150 (MQ=255) gCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGACGCG‑ATGGGGTGCGACGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTGTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCGGGTGGTCGTGGTCCTTTGc > 2:909615/1‑150 (MQ=255) cGCCCCCACAAGGATCGCGCCCGTTCATGGACGAGCGCGGTACCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTTGCGAAAGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTCGGCGCGCTCTCATGGCTGTTGGTCGTGGTCCTTTGcc > 2:718797/1‑150 (MQ=9) gCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCGTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGACGCGGCCCC‑TGTTTCGACCTCCTCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTCATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCa > 2:3888290/1‑150 (MQ=255) tCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCAcc > 2:958472/1‑150 (MQ=255) tCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTGTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCAcc > 2:1132337/1‑150 (MQ=255) ccACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCttt > 1:4128033/1‑141 (MQ=255) ccACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCttt < 2:4128033/141‑1 (MQ=255) cacaGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTg > 1:3853682/1‑150 (MQ=255) aGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCAc > 2:2242931/1‑150 (MQ=255) gTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCAccc > 2:3079361/1‑150 (MQ=255) gTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCAccc > 2:4968775/1‑150 (MQ=255) gTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCAccc > 2:1664900/1‑150 (MQ=255) aCCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCCTTTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCg < 1:445803/150‑1 (MQ=255) ccGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGt > 2:2078484/1‑150 (MQ=255) cgcgCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGttggtcttgg > 1:870520/1‑125 (MQ=255) cgcgCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGGGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TGTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTGGCCCACCCTGCCCCCGGtt > 2:2906663/1‑150 (MQ=255) gcgcTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTc > 2:5207609/1‑150 (MQ=255) cgcTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTcc > 2:5248851/1‑150 (MQ=255) gcTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCg < 2:5344943/150‑1 (MQ=255) cTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCgg < 2:4898332/150‑1 (MQ=255) tCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCggg > 1:5380892/1‑150 (MQ=255) tCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCggg > 1:5380804/1‑150 (MQ=255) cGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGt < 1:3788204/150‑1 (MQ=255) tCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGttt < 2:4822717/150‑1 (MQ=255) tCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGttt > 2:2109801/1‑150 (MQ=255) ccATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGtttt < 2:2556629/150‑1 (MQ=255) ccATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGtttt < 2:3794721/150‑1 (MQ=255) aTGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGa > 2:1266143/1‑150 (MQ=255) aTGAACGGGCGCGATCCGTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGa > 1:3928358/1‑150 (MQ=255) tGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGAGATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTACGGGTTTTGaa > 2:1686772/1‑150 (MQ=255) tGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TGTTTCGACATCATCGTTTTGTCTAGGAGCGCTCTCATGGCTGTTGGTCTTGGGCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGaa > 2:2976192/1‑150 (MQ=255) aCGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGGTCCGGGTTTTGAACTc < 2:4472370/150‑1 (MQ=255) gcgcGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTa > 1:5627410/1‑150 (MQ=255) gcgcGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTa < 1:1801169/150‑1 (MQ=255) cgcgATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTAt > 1:4370026/1‑150 (MQ=255) gcgATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTATc > 1:4298715/1‑150 (MQ=255) gATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTATCGc > 2:2785139/1‑150 (MQ=255) | TGGTGTGGTTCGGGCAAGAAGTTCAAGCATTGCCACGGTCAGATCGAGTGATCTGAACCTTACGTTGTACAAGCCTGGGGTCGCTTTGCGGCCCTTTCGCAACACAAGGCCGCTCCCACAGGTACCGCGCTCGTCCATGAACGGGCGCGATCCTTGTGGGGGCGGCCTTGTGTCGCG‑ATGGGGTGCGAAGCGGCCCC‑TTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTATCGC > NC_002947/1539750‑1540047 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |