| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 1,549,510 | 0 | T | A | 5.0% | 537.6 / 4.5 | 172 | intergenic (+78/+36) | mdfA/ampG | multidrug MFS transporter/muropeptide permease AmpG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (112/49); new base A (4/5); total (116/56) | |||||||||||
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Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
GCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTCCGCCACCGGCGTCCCCCGCCCGGCTTCCTGATGCCACTGCAGGGCGATCAGGATCAGCGTAGGCACCCCCAGCAGCGCCGTGAT > NC_002947/1549364‑1549659 | gCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTA‑cc < 1:3528241/150‑1 (MQ=255) cGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTA‑ccc < 1:1709410/150‑1 (MQ=255) ggtgtgGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAaga < 2:2233500/148‑1 (MQ=255) 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cctgtGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTCCGCCACCGGCGTCCCCCGCCCGGCTTCCTGATGCCACTGCAGGGCGATCAGGATCAGCGTAGGCAc > 1:3249040/5‑150 (MQ=255) tttGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTCCGCCACCGGCGTCCCCCGCCCGGCTTCCTGATGCCACTGCAGGGCGATCAGGATCAGCGTAGGCAccc > 1:685521/1‑150 (MQ=255) tttGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTCCGCCACCGGCGTCCCCCGCCCGGCTTCCTGATGCCACTGCAGGGCGATCAGGATCAGCGTAGGCAccc > 1:2944453/1‑150 (MQ=255) tGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTCCGCCACCGGCGTCCCCCGCCCGGCTTCCTGATGCCACTGCAGGGCGATCAGGATCAGCGTAGGCAccccc > 1:5558043/1‑150 (MQ=255) tttggtgCGGTTTCA‑CCCGGGTAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTCCGCCACCGGCGTCCCCCGCCCGGCTTCCTGATGCCACTGCAGGGCGATCAGGATCAGCGTAGGCACCCCca < 1:588373/144‑1 (MQ=255) gTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCtt > 2:2145128/1‑50 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |