| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_002947 | 7,288 | T→A | 5.1% | N289I (AAC→ATC) ‡ | oxaA ← | membrane protein insertase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 7,288 | 0 | T | A | 5.1% | 720.5 / 17.2 | 211 | N289I (AAC→ATC) ‡ | oxaA | membrane protein insertase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (90/110); new base A (3/8); total (93/118) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.53e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 232 total aligned reads displayed.
GGGACAACTCTTTCAGCTTGGACTGGATCTTCGGGCCGGCGTACAGCAGGGCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGCCAGGCAACCCAGCCGCCGGACACATTTTCTTTCAAACTACCTTTGTCGATGTCCTTCATCGAGACCTTTTTGTAAGGCTCAGAAGCTGTCCACAGGGC > NC_002947/7139‑7436 | gggACAACTCTTTCAGCTTGGACTGGATCTTCGGGCCGGCGTACAGCAGGGCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACgt > 2:3908826/1‑150 (MQ=255)gggACAACTCTTTCAGCTTGGACTGGATCTTCGGGCCGGCGTACAGCAGGGCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACgt > 1:3823747/1‑150 (MQ=255) cAACTCTTTCAGCTTGGACTGGATCTTCGGGCCGGCGTACAGCAGGGCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACgttgtt < 1:1755551/150‑1 (MQ=255) 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tctTTCAGCTTGGACTGGATCTTCGGGCCGGCGTACAGCAGGGCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTcc < 1:5543752/150‑1 (MQ=255) ctTTCAGCTTGGACTGGATCTTCGGGCCGGCGTACAGCAGGGCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACAACGTTGTcca < 1:3147333/150‑2 (MQ=255) ctTTCAGCTTGGACTGGATCTTCGGGCCGGCGTACAGCAGGGCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACAACGTTGTcca < 2:4342162/150‑2 (MQ=255) ctTTCAGCTTGGACTGGATCTTCGGGCCGGCGTACAGCAGGGCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACAACGTTGTcca < 2:676639/150‑2 (MQ=255) tttCAGCTTGGACTGGATCTTCGGGCCGGCGTACAGCAGGGCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGa > 2:5221036/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |