| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,687,926 | A→G | 6.4% | Q485R (CAG→CGG) | recJ → | ssDNA‑specific exonuclease RecJ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,687,926 | 0 | A | G | 6.4% | 952.9 / 33.5 | 298 | Q485R (CAG→CGG) | recJ | ssDNA‑specific exonuclease RecJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (127/152); new base G (8/11); total (135/163) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.16e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.02e-01 | |||||||||||
Only 100 of 304 total aligned reads displayed.
GGCGTTTGCCGAGGCGTTCGACGAAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCGGCATTGACCGCGAAGTGTGGC > NC_002947/1687777‑1688075 | ggCGTTTGCCGAGGCGTTCGACGAAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCa > 1:1263762/1‑150 (MQ=255)ggCGTTTGCCGAGGCGTTCGACGAAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCa > 2:4909967/1‑150 (MQ=255) gCGTTTGCCGAGGCGTTCGTCGAAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAg < 1:4263628/150‑1 (MQ=255) tttGCCGAGGCGTTCGACGAAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCTGGCCCCATGGGCCGGCat < 1:3376571/150‑2 (MQ=255) tttGCCGAGGCGTTCGACGAAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCTGGCCCCATGGGCCGGCat < 2:2128595/150‑2 (MQ=255) tttGCCGAGGCGTTCGACGAAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCCATGGGCCGGCat < 1:2992383/150‑2 (MQ=255) ttGCCGAGGCGTTCGACGAAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACGGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCTGGCCCCATGGGCCGGCatg < 2:5572790/150‑3 (MQ=255) tGCCGAGGCGTTCGACGAAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACtt < 2:3951314/150‑1 (MQ=255) gCCGAGGCGTTCGACGAAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCTGGCCCCATGGGCCGGCatggc < 1:3875883/150‑5 (MQ=255) gCCGAGGCGTTCGACGAAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTc < 1:4362526/150‑1 (MQ=255) ccGAGGCGTTCGACGAAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTcc > 2:1018998/1‑150 (MQ=255) ccGAGGCGTTCGACGAAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTcc < 2:41470/150‑1 (MQ=255) ggCGTTCGACGAAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGa < 1:1442900/150‑1 (MQ=255) ttCGACGAAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCAGGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCg > 2:2398091/1‑150 (MQ=255) gacgaAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTg > 2:3805857/1‑150 (MQ=255) gaAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTc > 1:904411/1‑150 (MQ=255) gaAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTc > 2:1356543/1‑150 (MQ=255) gaAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTc > 2:5615541/1‑150 (MQ=255) gagGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCAt < 1:3141168/150‑1 (MQ=255) ggTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATgg < 2:2356167/150‑1 (MQ=255) gTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGc > 2:4723352/1‑150 (MQ=255) gcggcgTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCgt < 2:4313008/150‑1 (MQ=255) gcggcgTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCgt < 2:4591919/150‑1 (MQ=255) cggcgTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCgtg < 1:1737419/150‑1 (MQ=255) ggcgTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCgtgt > 1:4592662/1‑150 (MQ=255) cAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAg < 2:665579/150‑1 (MQ=255) aGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGt < 2:1526979/150‑1 (MQ=255) gCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGtt < 1:5261444/150‑1 (MQ=255) cTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTtg > 1:4750717/1‑150 (MQ=255) gcgcGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTtggt < 1:4074787/150‑1 (MQ=255) cgcgAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTtggtg < 2:2489903/150‑1 (MQ=255) cgcgAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTtggtg < 2:2816674/150‑1 (MQ=255) cgcgAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTtggtg < 1:2344561/150‑1 (MQ=255) agaagaCCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCt > 2:729138/1‑112 (MQ=255) agaagaCCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCt < 1:729138/112‑1 (MQ=255) aagaCCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTTCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGagcagc < 1:5020963/150‑1 (MQ=255) aagaCCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGagcagc < 1:1362107/150‑1 (MQ=255) gaCCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCgt < 1:1059628/150‑1 (MQ=255) cTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGtgtg < 2:3846695/150‑1 (MQ=255) tGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGATCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTgg < 2:44175/150‑1 (MQ=255) ggCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGc < 2:820536/150‑1 (MQ=255) ggCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGc < 1:4916053/150‑1 (MQ=255) ggCCGCCAGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGAGTGGTTGGc < 2:1824000/150‑1 (MQ=255) tgttgtCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGc < 1:5598342/150‑1 (MQ=255) gtCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCt < 1:5187913/150‑1 (MQ=255) gtCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCt > 2:3539414/1‑150 (MQ=255) ccGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGa < 1:747933/150‑1 (MQ=255) cGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGaa > 2:3019650/1‑150 (MQ=255) ggCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAgtg > 2:3497879/1‑150 (MQ=255) aGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAgtggtg < 2:2770878/150‑1 (MQ=255) aGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTGGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGACAgtggtg < 2:331024/150‑1 (MQ=255) gCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGc < 2:339060/150‑1 (MQ=255) cTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTc > 1:2564780/1‑150 (MQ=255) cTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTc < 2:1758364/150‑1 (MQ=255) ggCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCaa < 1:4869851/150‑1 (MQ=255) cGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAaga < 1:1077923/150‑1 (MQ=255) cGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAaga < 2:1219177/150‑1 (MQ=255) gaggagTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGtt > 1:3317194/1‑114 (MQ=255) gagTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAAtgt < 1:5451203/150‑1 (MQ=255) 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tCGACCTGGCCAATGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGAGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAAAGTGGCTCGGTGc > 2:4063037/1‑150 (MQ=255) gACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCgg > 2:2082903/1‑150 (MQ=255) gACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCgg < 2:3936516/150‑1 (MQ=255) ccTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCt < 2:5337891/150‑1 (MQ=255) cTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTg > 1:3698880/1‑150 (MQ=255) ggCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGa > 2:4533392/1‑150 (MQ=255) gCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGAt < 1:2219827/150‑1 (MQ=255) gCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGAt < 2:1263762/150‑1 (MQ=255) ccAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATg > 1:4488223/1‑150 (MQ=255) cAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATgg > 1:3521435/1‑150 (MQ=255) cAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGGTGGTGGAGCAGCGGGTGGTTGGCGAACGGCACCTGACAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATgg > 2:4021858/1‑150 (MQ=255) aaGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGc < 1:5525159/150‑1 (MQ=255) aaGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGc > 1:1784941/1‑150 (MQ=255) gCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCAtt > 2:2230164/1‑150 (MQ=255) ccTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCGGGATGGCATTGc > 2:5179625/1‑150 (MQ=255) gcgcCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCtt > 2:2585218/1‑150 (MQ=255) gcCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCg < 1:5401851/150‑1 (MQ=255) gcCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACGTCCCTGAGCCGCTGGTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCGGGATGGCATTGCCTTCg < 2:5194460/150‑1 (MQ=255) ccATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCgg < 2:1633533/150‑1 (MQ=255) aTGCCGGCCCCGGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGACAGTGGTGCTCAAGAGCGCATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCAGTGCCTTCGGCa > 2:2855937/1‑150 (MQ=255) aTGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGGTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCGGCa < 1:263858/150‑1 (MQ=255) tGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCGGCAt < 1:2915127/150‑1 (MQ=255) gCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCGGCAtt > 2:1924028/1‑150 (MQ=255) ctggccccAT‑GGGCCGGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCGGCATTg > 2:4859090/6‑150 (MQ=255) ggCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCGGCATTGAc < 1:2416677/150‑1 (MQ=255) aTGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCGGCATTGACCGCGa > 1:150335/1‑150 (MQ=255) aTGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGGGTTCCAGTGGGGGGAGCAGCGTGTGGTAGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGAGCTCAAGAGAGAATGTCGCTCGGTGCGGCTGGATGGCAGTGCCTTCGGCATTGACCGCGa > 2:5024539/1‑150 (MQ=255) tGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCGGCATTGACCGCGaa < 1:3082260/150‑1 (MQ=255) tGGGGCCAGCACTTCCCAGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCGGCATTGACCGCGaa < 1:2554681/150‑1 (MQ=255) ggCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCGGCATTGACCGCGAAgtg > 2:3618205/1‑150 (MQ=255) gCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCGGCATTGACCGCGAAgtgt < 1:595316/150‑1 (MQ=255) ccAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGTCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCGGCATTGACCGCGAAGtgtg < 1:1589906/150‑1 (MQ=255) ccAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCGGCATTGACCGCGAAGtgtg < 1:4723201/150‑1 (MQ=255) cAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCGGCATTGACCGCGAAGTGTgg > 1:1863377/1‑150 (MQ=255) cAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCGGCATTGACCGCGAAGTGTgg > 1:395138/1‑150 (MQ=255) aGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCGGCATTGACCGCGAAGTGTGGc < 1:2837889/150‑1 (MQ=255) | GGCGTTTGCCGAGGCGTTCGACGAAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCGGCATTGACCGCGAAGTGTGGC > NC_002947/1687777‑1688075 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |