| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 1,785,120 | 0 | T | C | 6.2% | 340.8 / 8.7 | 116 | intergenic (+88/+18) | PP_1587/dapC | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter/N‑succinyl‑L,L‑diaminopimelate aminotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (82/21); new base C (4/3); total (90/26) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.74e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
CGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCACGCGACAGGTACGA > NC_002947/1784976‑1785266 | cGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCGTGAAATAAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGcccc > 1:3188627/1‑149 (MQ=255) gcagcggttggagctgtacaacctgcatcgtcagcacctggtgggggctgagggggtgccgcaagtactgggtgagctggagatgagtgaggcgaacctgggtccagtcaagtagaccctatcaaggcccttcgcgggcgTGCCCGCGaa < 2:3921725‑M2/10‑1 (MQ=255) cagcggttggagctgtacaacctgcatcgtcagcacctggtgggggatgaggtggtgcggcaagtactgggtgagctggatatgagtgaggcgaacctgggttcagtcaagtagaccctatcaaggcccttcgcgggcgCGCCCGCGAAg < 1:3320976‑M2/11‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |