| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_002947 | 7,289 | T→C | 5.2% | N289D (AAC→GAC) ‡ | oxaA ← | membrane protein insertase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 7,289 | 0 | T | C | 5.2% | 692.1 / 16.0 | 211 | N289D (AAC→GAC) ‡ | oxaA | membrane protein insertase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (90/110); new base C (3/8); total (93/118) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.53e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.89e-01 | |||||||||||
Only 100 of 231 total aligned reads displayed.
GGACAACTCTTTCAGCTTGGACTGGATCTTCGGGCCGGCGTACAGCAGGGCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGCCAGGCAACCCAGCCGCCGGACACATTTTCTTTCAAACTACCTTTGTCGATGTCCTTCATCGAGACCTTTTTGTAAGGCTCAGAAGCTGTCCACAGGGCAG > NC_002947/7140‑7438 | aCAACTCTTTCAGCTTGGACTGGATCTTCGGGCCGGCGTACAGCAGGGCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACgttgt > 2:1680140/1‑150 (MQ=255) cAACTCTTTCAGCTTGGACTGGATCTTCGGGCCGGCGTACAGCAGGGCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACgttgtt < 1:2536810/150‑1 (MQ=255) cAACTCTTTCAGCTTGGACTGGATCTTCGGGCCGGCGTACAGCAGGGCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACgttgtt < 2:1795032/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |