| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,947,361 | T→C | 6.9% | intergenic (+47/‑158) | betX → / → yjcH | choline/betaine/carnitine ABC transporter substrate‑binding protein BetX/inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,947,361 | 0 | T | C | 6.9% | 390.6 / 10.3 | 131 | intergenic (+47/‑158) | betX/yjcH | choline/betaine/carnitine ABC transporter substrate‑binding protein BetX/inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (71/50); new base C (4/5); total (75/56) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.93e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
CGAGGTGATGCTGGCGATCCAGGAAGGGGCCAAGCCTGAAGCGGCCGCCAAGGACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGTAAGGGTGTGGGTTCCATCCCGTATCTGTGCTGCTAGGA > NC_002947/1947212‑1947510 | cGAGGTGATGCTGGCGATCCAGGAAGGGGCCAAGCCTGAAGCGGCCGCCAAGGACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCt > 1:4790789/1‑150 (MQ=255) gAGGTGATGCTGGCGATCCAGGAAGGGGCCAAGCCTGAAGCGGCCGCCAAGGACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa > 2:2854499/1‑150 (MQ=255) aGGTGATGCTGGCGATCCAGGAAGGGGCCAAGCCTGAAGCGGCCGCCAAGGACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAc < 2:983058/150‑1 (MQ=255) gTGATGCTGGCGATCCAGGAAGGGGCCAAGCCTGAAGCGGCCGCCAAGGACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACgg < 1:3933197/150‑1 (MQ=255) cTGGCGATCCAGGAAGGGGCCAAGCCTGAAGCGGCCGCCAAGGACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCgg < 1:1733020/150‑1 (MQ=255) cTGGCGATCCAGGAAGGGGCCAAGCCTGAAGCGGCCGCCAAGGACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCgg < 1:1733044/150‑1 (MQ=255) cTGGCGATCCAGGAAGGGGCCAAGCCTGAAGCGGCCGCCAAGGACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCgg < 2:4143776/150‑1 (MQ=255) ggCGATCCAGGAAGGGGCCAAGCCTGAAGCGGCCGCCAAGGACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGt < 2:4059063/150‑1 (MQ=255) cGAGCCAGGAAGGGGCCAAGCCTGAAGCGGCCGCCAAGGACTGGGTCGCCAAGCACCCTGCTCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTACACGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGttt < 2:4749226/150‑1 (MQ=255) aTCCAGGAAGGGGCCAAGCCTGCAGCGGCCGCCAAGGACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCACTG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTAc < 2:3938642/150‑1 (MQ=255) aTCCAGGAAGGGGCCAAGCCTGAAGCGGCCGCCAAGGACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTAc < 1:5106456/150‑1 (MQ=255) ccAGGAAGGGGCCAAGCCTGAAGCGGCCGCCAAGGACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTAccc < 1:196098/150‑1 (MQ=255) ccAGGAAGGGGCCAAGCCTGAAGCGGCCGCCAAGGACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCACCCGTAGGAGCGGGTTTAccc < 1:1317551/150‑1 (MQ=39) aGGAAGGGGCCAAGCCTGAAGCGGCCGCCAAGGACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCcgc > 1:2162415/1‑150 (MQ=255) aGGAAGGGGCCAAGCCTGAAGCGGCCGCCAAGGACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCcgc < 1:1945969/150‑1 (MQ=255) gCCAAGCCTGAAGCGGCCGCCAAGGACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGt > 2:3601862/1‑150 (MQ=255) ccAAGCCTGAAGCGGCCGCCAAGGACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGT‑AACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGtca > 2:5012975/1‑150 (MQ=255) aaGCCTGAAGCGGCCGCCAAGGACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGtcaa > 2:2247853/1‑149 (MQ=255) gCCTGAAGCGGCCGCCAAGGACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGtcatca > 1:2170502/1‑150 (MQ=255) tGAAGCGGCCGCCAAGGACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACtt > 2:1053409/1‑150 (MQ=255) tGAAGCGGCCGCCAAGGACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACtt > 1:4654247/1‑150 (MQ=255) aaGCGGCCGCCAAGGACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTg > 2:3919907/1‑150 (MQ=255) aaGCGGCCGCCAAGGACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTg > 2:3788292/1‑150 (MQ=255) aaGCGGCCGCCAAGGACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCACCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa > 1:3973824/1‑135 (MQ=38) ccgccAAGGACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGc > 2:5052647/1‑150 (MQ=255) cacggACGGGGTCGCCACGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATc < 2:4996460/147‑1 (MQ=255) aaGGACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCg > 2:4375043/1‑150 (MQ=255) ggACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCACCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGt > 2:3846168/1‑150 (MQ=38) ggACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCACCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGt > 2:3846303/1‑150 (MQ=38) gACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTTACGGAGGGGACTGCAAATTAAAAGCCTACCAGGGCCATTT‑TTTTTTCTTGGCGGGTAAACCCGCTCCTCCGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTa < 1:5543386/150‑1 (MQ=255) gTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAacac > 1:3192058/1‑150 (MQ=255) tCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACAcc < 2:4171298/150‑1 (MQ=255) tCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACAcc > 2:4732233/1‑150 (MQ=255) tCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACACGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACAcc > 2:1899100/1‑150 (MQ=255) ccAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGtt > 1:4383567/1‑150 (MQ=255) ccAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGtt > 1:4383558/1‑150 (MQ=255) aGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCa > 1:1274331/1‑150 (MQ=255) aGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCAAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCa > 1:1274365/1‑150 (MQ=255) ccgtGAGCGTTTGATGTAGTGTAGTGGAATTTAAACGCCTTCCTGGG‑CAATGTTTTTTTATTCGCGGTTAAACCCGCCCCTCGGGGTGGGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTa < 2:1123974/147‑1 (MQ=255) cccTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTa > 2:2147082/1‑150 (MQ=255) cccTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTa > 1:4714547/1‑150 (MQ=255) ccTGATGGTGTGATGGAGTGGACTGGCAAGTAAACGCCTTCCTGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTaa < 2:4654247/150‑1 (MQ=255) ccTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTaa > 1:2066030/1‑150 (MQ=255) tgagggtgtGATGGTGTGGACTGGCACGTAAACGCCTCCCCGGGCCATTG‑TTGTTTGTTCGGGGGTAACCCCGCTCCTCGGGGGGGGGGTTACCCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGa < 2:1429466/145‑1 (MQ=255) tGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGa > 2:2766564/1‑150 (MQ=255) tCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTa > 1:532739/1‑150 (MQ=255) tCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTGTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTa > 1:3063999/1‑150 (MQ=255) tgAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGgtc > 1:3547230/1‑150 (MQ=255) gtgtagtGGCAATTAAACGCCTTCCAGGGCAAATT‑TTGTTTCTTCGGGGGTAAACCGGCTCCTCCGGGTGGGGTTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGt < 1:453998/144‑1 (MQ=255) tGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGtt < 2:394952/150‑1 (MQ=255) ggACTGGAATTTAAAAGCCTTCCTGGGCAATTT‑TTTTTTCTTCGCGTTTAAACCCGCTCCTCCGGGTGGGGTTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTg < 2:4799252/150‑1 (MQ=255) ggACGGGCAAGTAAACGCCTGCCAGGGCCCAGG‑TTGTTTCTTCGCGGGTACACCCGCGCCTCCGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTg < 2:4799219/150‑1 (MQ=255) gACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTgg > 2:3407600/1‑150 (MQ=255) cTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCg > 1:2996104/1‑150 (MQ=255) gCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTcc > 2:2567862/1‑150 (MQ=255) cAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTG‑TTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCAt > 1:926941/1‑150 (MQ=255) aaGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGACCGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACGAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCag > 2:5386204/1‑149 (MQ=255) aGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATc > 2:2591502/1‑150 (MQ=255) gTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCg > 1:440369/1‑150 (MQ=255) gTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCg > 1:3257254/1‑150 (MQ=255) ctAAAAGCCGTCCAGGGCAAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCg < 2:3824642/149‑1 (MQ=255) aaaacGCCTCCCCGGGCCTTTG‑TTGTTCCTGGGCGGTTAACCCCGCTCCTCGGGGGGGGGTTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCgg < 1:3562422/149‑1 (MQ=255) gCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGgcagca > 2:592573/1‑150 (MQ=255) tCCTGGGCAAATG‑TTTTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTCCGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATaaa < 2:4766481/150‑1 (MQ=255) tCCCGGGCCACGG‑TGGTGTCTTCGCGGGTAACCCCGCGCCTCCGGGTGCGGGTTTACGCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCACTCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATaaa < 2:4545318/150‑1 (MQ=255) tCCCGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGTTAAACCCGCTCCTCGGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATaaa < 1:2297876/150‑1 (MQ=255) cAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGt > 1:1405436/1‑150 (MQ=255) cAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGACCATCGGCAGCATAAAGt > 1:2779997/1‑150 (MQ=255) aGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGTa > 2:854002/1‑150 (MQ=255) aGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGGTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGTa > 1:1441256/1‑150 (MQ=255) gggCCATTG‑TGTTTTCTTCGCGGGTAACCCGGCGCCTAGGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGTaa < 2:2876013/150‑1 (MQ=255) ggCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGTGTCCATCGGCAGCATAAAGTAAg > 1:3185680/1‑150 (MQ=255) gcatttg‑ttttTTGTTCGGGGTAAAACCGGCCCCAAGGGGTGGGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGTAAgg < 1:3510414/145‑1 (MQ=255) gCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGTAAgg > 2:833204/1‑150 (MQ=255) gCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGTAAgg > 1:1628609/1‑150 (MQ=255) aTG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTCCGGGTGGGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGTAAGGgtgt < 2:4208124/150‑1 (MQ=255) tg‑ttgtTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGTAAGGGtgtg < 2:4213805/150‑1 (MQ=255) ttgttTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGTAAGGGTGTggg > 1:5478837/1‑150 (MQ=255) ttcttcGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGTAAGGGTGTGGGTTcc > 1:3184767/1‑150 (MQ=255) cttcGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGTAAGGGTGTGGGTTCCAt > 1:3562494/1‑150 (MQ=255) ggtaaaaCCCGCTCATACGGTTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGTAAGGGTGTGGGTTCCATCCCGTa < 2:2170502/146‑1 (MQ=255) ggTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGTAAGGGTGTGGGTTCCATCCCGTAt > 1:3741904/1‑150 (MQ=255) ggTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGTAAGGGTGTGGGTTCCATCCCGTAt > 1:3741933/1‑150 (MQ=255) gTAAACCCGCACCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGTAAGGGTGTGGGTTCCATCCCGTATc > 1:2756988/1‑150 (MQ=39) aaCCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGTAAGGGTGTGGGTTCCATCCCGTATCtgt > 2:4621630/1‑150 (MQ=255) aaCCCGCTCCCTGGGGTGGGGGTTAACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGTAAGGGTGTGGGTTCCATCCCGTATCtgt < 1:4390411/150‑1 (MQ=255) aCCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGTAAGGGTGTGGGTTCCATCCCGTATCtgtg > 1:1920309/1‑150 (MQ=255) aCCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGTAAGGGTGTGGGTTCCATCCCGTATCtgtg < 1:3601862/150‑1 (MQ=255) aCCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGTAAGGGTGTGGGTTCCATCCCGTATCtgtg < 1:5052647/150‑1 (MQ=255) aCCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGTAAGGGTGTGGGTTCCATCCCGTATCtgtg > 2:1682335/1‑150 (MQ=255) aCCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGTAAGGGTGTGGGTTCCATCCCGTATCt < 1:3003202/147‑1 (MQ=255) aCCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGTAAGGGTGTGGGTTCCATCCCGTATCt > 2:3003202/1‑147 (MQ=255) aCCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGAAAGGGTGTGGGTTCCATCCCGTATCtgtg > 2:5394635/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGTAAGGGTGTGGGTTCCATCCCGTATCTGtgc > 1:3821647/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGTAAGGGTGTGGGTTCCATCCCGTATCTGtgc > 1:4038533/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGTAAGGGTGTGGGTTCCATCCCGTATCTGtgct > 2:484192/1‑150 (MQ=255) cTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGTAAGGGTGTGGGTTCCATCCCGTATCTGTgctgct < 2:5487575/150‑1 (MQ=255) tCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGt > 1:3875925/1‑91 (MQ=255) cTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGTAAGGGTGTGGGTTCCATCCCGTATCTGTGCTGCTAgg > 1:2733401/1‑150 (MQ=255) tACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGTAAGGGTGTGGGTTCCATCCCGTATCTGTGCTGCTAGGa > 2:933224/1‑150 (MQ=255) | CGAGGTGATGCTGGCGATCCAGGAAGGGGCCAAGCCTGAAGCGGCCGCCAAGGACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATG‑TTGTTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGTAAGGGTGTGGGTTCCATCCCGTATCTGTGCTGCTAGGA > NC_002947/1947212‑1947510 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |