| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_002947 | 1,958,398 | G→C | 5.1% | T45T (ACC→ACG) ‡ | mnmC ← | methyltransferase/FAD‑dependent oxidoreductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 1,958,398 | 0 | G | C | 5.1% | 865.3 / 25.2 | 254 | T45T (ACC→ACG) ‡ | mnmC | methyltransferase/FAD‑dependent oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (107/133); new base C (7/6); total (114/140) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
Only 100 of 259 total aligned reads displayed.
ACGCTGACGAAGTGCAGGCGCGCGTCGCTGTGTGCGTGCTGGTCGAACAGCTGCCAGGCGCAGAAAAAATTCATGCCGGTGCCAAAACCGGTTTCGCCGATCACCGTGCAGGCGTGCGGCGCCAGGTTGGCAAAACGCTCGGCCAGGCGGGTCTGGCCGAGGAACACGTGCTTGGTTTCTTCGATGCCTTCGTTGACTGCGAAATAGACGTCGTCATAGTGCCGCGAATGGGGGCGGCCCTGGTCGTCCCAGTCGATCTGGGCGTGCTGGAGGAGGGTGGGCATGGTGGGCTCGGTTG > NC_002947/1958249‑1958546 | aCGCTGACGAAGTGCAGGCGCGCGTCGCTGTGTGCGTGCTGGTCGAACAGCTGCCAGGCGCAGAAAAAATTCATGCCGGTGCCAAAACCGGTTTCGCCGATCACCGTGCAGGCGTGCGGCGCCAGGTTGGCAAAACGCTCGGCCAGGCgg < 2:5150375/150‑1 (MQ=255) aCGAAGTGCAGGCGCGCGTCGCTGTGTGCGTGCTGGTCGAACAGCTGCCAGGCGCAGAAAAAATTCATGCCGGTGCCAAAACCGGTTTCGCCGATCACCGTGCAGGCGTGCGGCGCCAGGTTGGCAAAACGCTCGGCCAGGCGGGTCTgg < 1:1030185/150‑1 (MQ=255) aCGAAGTGCAGGCGCGCGTCGCTGTGTGCGTGCTGGTCGAACAGCTGCCAGGCGCAGAAAAAATTCATGCCGGTGCCAAAACCGGTTTCGCCGATCACCGTGCAGGCGTGCGGCGCCAGGTTGGCAAAACGCTCGGCCAGGCGGGTCTgg > 2:4211329/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |