Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_002947 | 1,958,400 | T→C | 5.0% | T45A (ACC→GCC) ‡ | mnmC ← | methyltransferase/FAD‑dependent oxidoreductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 1,958,400 | 0 | T | C | 5.0% | 850.4 / 19.6 | 258 | T45A (ACC→GCC) ‡ | mnmC | methyltransferase/FAD‑dependent oxidoreductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (108/137); new base C (7/6); total (115/143) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.72e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.34e-01 |
Only 100 of 258 total aligned reads displayed.
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TGACGAAGTGCAGGCGCGCGTCGCTGTGTGCGTGCTGGTCGAACAGCTGCCAGGCGCAGAAAAAATTCATGCCGGTGCCAAAACCGGTTTCGCCGATCACCGTGCAGGCGTGCGGCGCCAGGTTGGCAAAACGCTCGGCCAGGCGGGTCTGGCCGAGGAACACGTGCTTGGTTTCTTCGATGCCTTCGTTGACTGCGAAATAGACGTCGTCATAGTGCCGCGAATGGGGGCGGCCCTGGTCGTCCCAGTCGATCTGGGCGTGCTGGAGGAGGGTGGGCATGGTGGGCTCGGTTGCA > NC_002947/1958253‑1958548 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |