| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,972,198 | T→A | 9.1% | intergenic (+76/+43) | PP_1762 → / ← yciK | hypothetical protein/putative oxidoreductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,972,198 | 0 | T | A | 9.1% | 463.2 / 22.9 | 160 | intergenic (+76/+43) | PP_1762/yciK | hypothetical protein/putative oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (110/25); new base A (13/2); total (124/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
TGTTCCTGGAGCGCTGCATGCAGCTGGAAGGGCGCCAGCAAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGTTCT > NC_002947/1972049‑1972347 | tgttcctgGAGCGCTGCATGCAGCTGGAAGGGCGCCAGCAAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCcct > 1:2312511/1‑150 (MQ=255) ttCCTGGAGCGCTGCATGCAGCTGGAAGGGCGCCAGCAAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGc > 1:1009624‑M2/1‑149 (MQ=255) ttCCTGGAGCGCTGCATGCAGCTGGAAGGGCGCCAGCAAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGc > 2:2012168‑M2/1‑149 (MQ=255) gtcCTGGAGCGCTGCATGCAGCTGGAAGGGCGCCAGCAAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGc > 1:5412433‑M2/2‑149 (MQ=255) tGGAGCGCTGCATGCAGCTGGAAGGGCGCCAGCAAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGcctgt > 2:37654‑M2/1‑145 (MQ=255) tGGAGCGCTGCATGCAGCTGGAAGGGCGCCAGCAAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGGACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGAGT‑GCGCCCTGcctgt > 2:2952457‑M2/1‑145 (MQ=255) ggAGCGCTGCATGCAGCTGGAAGGGCGCCAGCAAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGcctgtg > 2:849386‑M2/1‑144 (MQ=255) ggAGCGCTGCATGCAGCTGGAAGGGCGCCAGCAAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGcctgtg > 1:930940‑M2/1‑144 (MQ=255) ggAGCGCTGCATGCAGCTGGAAGGGCGCCAGCAAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGcctgtg > 1:1450670‑M2/1‑144 (MQ=255) ggAGCGCTGCATGCAGCCGGAAGGGCGCCAGCAAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGcctgtg > 1:62483‑M2/1‑144 (MQ=255) gAGCGCTGCATGCAGCTGGAAGGGCGCCAGCAAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGcctgtgg > 1:3145681‑M2/1‑143 (MQ=255) gcgcTGCATGCAGCTGGAAGGGCGCCAGCAAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGcctgtggga > 2:2312511‑M2/1‑141 (MQ=255) cgcTGCATGCAGCTGGAAGGGCGCCAGCAAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGcctgtgggag > 1:5024407‑M2/1‑140 (MQ=255) cgcTGCATGCAGCTGGAAGGGCGCCAGCAAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCCCGCCCCCCCGCTCACCCCAACCCGCAACGGGT‑GGGCCCGGCCgggggggg > 2:257433/1‑148 (MQ=255) gcTGCATGCAGCTGGAAGGGCGCCAGCAAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGcctgtgggagc > 2:3503872‑M2/1‑139 (MQ=255) tgcatgcaGCTGGAAGGGCGCCAGCAAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTT‑GCGGTGATcctgtgggagcgg > 1:1960152‑M2/1‑137 (MQ=255) tgcatgcaGCTGGAAGGGCGCCAGCAAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGcctgtgggatcgg > 2:4865137‑M2/1‑137 (MQ=255) tgcatgcaGCTGGAAGGGCGCCAGCAAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGcctgtgggagcgg > 1:1168251‑M2/1‑137 (MQ=255) tgcatgcaGCTGGAAGGGCGCCAGCAAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGcctgtgggagcgg > 2:1536302‑M2/1‑137 (MQ=255) tgcatgcaGCTGGAAGGGCGCCAGCAAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGcctgtgggagcgg > 1:2579496‑M2/1‑137 (MQ=255) tgcaGCTGGAAGGGCGCCAGCAAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGcctgtgggagcgggcaa > 2:139372‑M2/1‑133 (MQ=255) ggAAGGGCGCCAGCAAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGCCCCCAGGCTACCCGCAACCCACAAGGGTT‑TCGGCCGGccggtgggtgcgggcacgcccccg < 1:3612630‑M2/150‑25 (MQ=255) atgggCGCCTGCATGGCCGTAGGCGGCCGGCGTTGGCGGGGGGCGGATCGGTTGCCGGTCCCGGCCTCTGCGCGGGCTGGCCCGCTCCCACCGGATCACCGCAACCCGCACGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGTGCGGGCAA‑GCCCGCGaa < 2:4010038/148‑1 (MQ=255) aGGGCGCCAGCAAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGcctgtgggagcgggccagcccgcgaag < 2:4107631‑M2/150‑28 (MQ=255) aGGGCGCCAGCAAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCAACCCAAACCACAAGGATT‑TGGCCCTGccagtgggagcgggccaccccgcgaag < 2:3525086‑M2/150‑28 (MQ=255) ccAGCAAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATAACCGCCACCCGCAAGGGTT‑GCGCCCGGccggtgggggcgggcaaggccccggagaggccg < 1:3649306‑M2/150‑34 (MQ=255) ccggcGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCCCGCCCACCCCAACACCCCAACCCACAACGCTT‑GCGCCCAGCCCGGGGGGGCGGGCCA‑CCCCCCCCAAAGGCCCAGGCCCGGTTTTTGGGCgg > 2:1977400/1‑149 (MQ=255) ggCTGGGGGCTGATCGCTTTCGTGTCCGGGCCTCTGCGGGGGCTTGCCCGCCCCCACCGGACCCCCGCACCCCTAATGTTTT‑GCGCCGGGCCTGTGGGCGCGGGCAC‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGcc < 2:103707/150‑1 (MQ=255) tGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGCCGGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGc > 2:5573145/1‑150 (MQ=255) cccGGCCGCTGCGCGGGCTGGCCCGCTCCCACCGGATCACCGCAACCCTCACGGATG‑GCGCCCGGCCTGGGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCg < 2:5353813/149‑1 (MQ=38) gttCGGGGGCTGCCCCGCGCCCCCCGCATCACC‑CCACCCCCAAGGGTTGGCGCCC‑GCCGTTGGGGCGGGGCAACCCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATc < 1:3530535/149‑1 (MQ=255) cgGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGCCGGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGGTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATcaggta > 2:1288976/1‑150 (MQ=255) gCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATcaggtacag > 1:5126941/1‑150 (MQ=255) ttGCCCGCTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTT‑GCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATcaggtacaggt > 1:2993182/1‑150 (MQ=17) ttGCCCGCTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTT‑GCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCAAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATcaggtacaggt > 2:2360878/1‑150 (MQ=17) ttGCCCGCTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTT‑GCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCAAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATcaggtacaggt > 2:615414/1‑150 (MQ=17) ttGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATcaggtacaggt > 1:2019431/1‑150 (MQ=255) ttGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGGGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGGGTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATcaggtccaggt > 2:2720119/1‑150 (MQ=255) ttGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTCCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATcaggtacaggt > 1:3065872/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTT‑GCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAggtacaggtaca > 2:4891046/1‑150 (MQ=17) cccGCTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTT‑GCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAggtacaggtaca > 1:1757787/1‑150 (MQ=17) cccGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGATGTCCGGCCCCATCAgttacaggtaca > 1:1522020/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTT‑GCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTacac > 1:1543618/1‑150 (MQ=14) ccGCTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTT‑GCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTacac > 1:4995337/1‑150 (MQ=14) gCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGcctgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccggtacaggaaagcgatcagcccgcagccaacgccggccgcatacggccttgctggcgcccttccagctgcatgcagc < 1:328833‑M2/150‑110 (MQ=255) gCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGcctgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccggtacaggaaagcgatcagcccgcagccaacgccggccgcatacggccttgctggcgccctgccagctgcatgcagc < 1:328891‑M2/150‑110 (MQ=255) gCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCg > 2:1844953/1‑150 (MQ=255) gCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCg > 1:1585858/1‑150 (MQ=255) gCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTGATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCg > 2:3069830/1‑150 (MQ=255) cTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCgg > 1:4826396/1‑150 (MQ=255) cTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCgg > 1:4216728/1‑150 (MQ=255) cTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCgg > 1:1375260/1‑150 (MQ=255) tCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGc > 1:854385/1‑150 (MQ=255) tCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGc > 1:269283/1‑150 (MQ=255) cccACATGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCa > 1:5317292/1‑150 (MQ=255) cccACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGcctgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccggtacaggaaagcgatcagcccgcagccaacgccggccgcatacggccttgctggcgcccttccagctgcatgcagcgct < 1:1696842‑M2/150‑113 (MQ=255) ccACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGcctgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccggtacaggaaagcgatcagcccgcagccaacgccggccgcatacggccttgctggcgcccttccagctgcatgcagcgctc < 1:504871‑M2/150‑114 (MQ=255) ccACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGcctgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccggtacaggaaagcgatcagcccgcagccaacgccggccgcatacggccttgctggcgcccttccagctgcatgcagcgctc < 2:516990‑M2/150‑114 (MQ=255) cacaGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGcctgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccggtccaggaaagcgatcagcccgcagccaacgccggccgcatacggccttgctggcgcccttccagctgcatgcagcgctcc < 1:162382‑M2/150‑115 (MQ=255) cacaGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGcctgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccggtacaggaaagcgatcagcccgcagccaacgccggccgcatacggccttgctggcgcccttccagctgcatgcagcgctcc < 2:2628587‑M2/150‑115 (MQ=255) cacaGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGcctgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccggtacaggaaagcgatcagcccgcagccaacgccggccgcatacggccttgctggcgcccttccagctgcatgcagcgctcc < 1:3406799‑M2/150‑115 (MQ=255) cacaGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGcctgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccggtacaggaaagcgatcagcccgcagccaacgccggccgcatacggccttgctggcgcccttccagctgcatgcagcgctcc < 2:5549225‑M2/150‑115 (MQ=255) cacaGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGcctgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccgatacaggaaagcgatcagcccgcagccaacgccggccgcatacggccttgctggcgcccttccag > 2:637458‑M2/1‑36 (MQ=255) cacaGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGcctgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccgatacaggaaagcgatcagcccgcagccaacgccggccgcatacggccttgctggcgcccttccag < 1:637458‑M2/134‑99 (MQ=255) cacaGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATg > 1:1817162/1‑150 (MQ=255) cacaGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGGTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATg > 2:4480518/1‑150 (MQ=255) cacaGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGCCGGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATg > 1:1134846/1‑150 (MQ=255) acaGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGcctgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccggtacaggaaagcga > 2:4430876‑M2/1‑35 (MQ=255) acaGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATgt > 2:2993977/1‑149 (MQ=255) acaGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGa > 1:1476997/1‑150 (MQ=255) acaGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGa > 1:4942765/1‑150 (MQ=255) caGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGAt > 2:1087277/1‑150 (MQ=255) gATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGAtctc > 2:15633/1‑150 (MQ=255) aTCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATctct > 2:4885051/1‑150 (MQ=255) tCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCtt > 2:2069144/1‑150 (MQ=255) aCCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCg > 1:4333667/1‑150 (MQ=255) ccGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCgg > 1:2492205/1‑150 (MQ=255) cGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCggg > 2:1801430/1‑150 (MQ=255) gCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGcctgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccggtacaggaaagcgatcagcccgcagccaacgccggccgcatacggccttgctggcgcccttccagctgcatgcagcgctccaggaacaggaac > 1:2628587‑M2/1‑24 (MQ=255) ccccacggAGT‑GCGCCCGGCCTGGGGGCGCGGGCAC‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCgg < 1:3593635/144‑1 (MQ=255) tCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGgt > 2:5231701/1‑150 (MQ=255) tCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGgt > 1:3396774/1‑150 (MQ=255) tCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGgt > 1:2440686/1‑150 (MQ=255) tCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGgt > 1:1274059/1‑150 (MQ=255) tCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGgt > 1:3935234/1‑150 (MQ=255) tCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGgt > 1:3935239/1‑150 (MQ=255) tCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGgt > 1:5377016/1‑150 (MQ=255) tCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCCGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGgt > 2:4205966/1‑150 (MQ=255) aaGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGgttg > 1:1537696/1‑150 (MQ=255) ggATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGgttgtt > 1:3349490/1‑150 (MQ=255) ggATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGgttgtt > 2:3241143/1‑150 (MQ=255) ggATT‑GCGCCCGGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGgttgtt < 2:3590220/150‑1 (MQ=255) tt‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTg > 1:2651638/1‑150 (MQ=255) tt‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTg > 2:2275230/1‑150 (MQ=255) gcCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCggg > 2:3736308/1‑150 (MQ=255) gcCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCggg > 2:4810397/1‑150 (MQ=255) gcCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCggg > 1:4514765/1‑150 (MQ=255) cccTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCtgtg < 2:3122874/83‑1 (MQ=255) cctgcctgTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGtt > 1:4334807/1‑150 (MQ=255) tgcctgTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGTtct > 1:1305885/1‑150 (MQ=255) | TGTTCCTGGAGCGCTGCATGCAGCTGGAAGGGCGCCAGCAAGGCCGTATGCGGCCGGCGTTGGCTGCGGGCTGATCGCTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGATCACCGCAACCCTCAAGGATT‑GCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAA‑GCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGTTCT > NC_002947/1972049‑1972347 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |