Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,002,963 | G→T | 5.2% | H138N (CAT→AAT) | rfbD ← | dTDP‑4‑dehydrorhamnose reductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,002,963 | 0 | G | T | 5.2% | 847.5 / 24.7 | 248 | H138N (CAT→AAT) | rfbD | dTDP‑4‑dehydrorhamnose reductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (116/119); new base T (3/10); total (119/129) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.72e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
GGGTGCGCCAAATTGGTCTGCTACCACGCTCAACGTCTCACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGACTGCCGCTGCCGTCAAATACATAATCGGTGGAATAGTGAATCAACCAGGCGCCCAAAGCTGCTGTTTCACGTGCTAATA > NC_002947/2002814‑2003112 | gggTGCGCCAAATTGGTCTGCTACCACGCTCAACGTCTCACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATg < 2:844601/150‑1 (MQ=255) ggTGCGCCAAATTGGTCTGCTACCACGCTCAACGTCTCACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGc > 1:2362941/1‑150 (MQ=255) ggTGCGCCAAATTGGTCTGCTACCACGCTCAACGTCTCACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGc > 2:2254357/1‑150 (MQ=255) ccAAATTGGTCTGCTACCACGCTCAACGTCTCACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCt > 2:169366/1‑150 (MQ=255) cAAATTGGTCTGCTACCACGCTCAACGTCTCACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGCATGCCATTCTCGccag < 1:615164/150‑3 (MQ=255) cAAATTGGTCTGCTACCACGCTCAACGTCTCACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGCATGCCATTCTCGccag < 1:4398498/150‑3 (MQ=255) cAAATTGGTCTGCTACCACGCTCAACGTCTCACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCtt > 2:3059255/1‑150 (MQ=255) cAAATTGGTCTGCTACCACGCTCAACGTCTCACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCAGGCGAGCATGCCATTCTCGccag < 1:2760700/150‑3 (MQ=255) aaaTTGGTCTGCTACCACGCTCAACGTCTCACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTc > 2:452343/1‑150 (MQ=255) aaaTTGGTCTGCTACCACGCTCAACGTCTCACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCAGGCGAGCATGCCATTCTCGccagc < 1:5156223/150‑4 (MQ=255) aaTTGGTCTGCTACCACGCTCAACGTCTCACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTcc < 1:5043960/150‑1 (MQ=255) tGGTCTGCTACCACGCTCAACGTCTCACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGc > 1:2256958/1‑150 (MQ=255) gTCTGCTACCACGCTCAACGTCTCACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCtt < 2:3002310/150‑1 (MQ=255) tCTGCTACCACGCTCAACGTCTCACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTg < 2:4955190/150‑1 (MQ=255) tCTGCTACCACGCTCAACGTCTCACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTg < 1:2547000/150‑1 (MQ=255) tCTGCTACCACGCTCAACGTCTCACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTg < 2:2573520/150‑1 (MQ=255) cTGCTACCACGCTCAACGTCTCACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTgg > 1:2869964/1‑150 (MQ=255) tGCTACCACGCTCAACGTCTCACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGt > 1:2107273/1‑150 (MQ=255) gCTACCACGCTCAACGTCTCACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGAGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTc < 2:2845225/150‑1 (MQ=255) tACCACGCTCAACGTCTCACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCg > 2:323223/1‑150 (MQ=255) aCCACGCTCAACGTCTCACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCgg > 2:2020504/1‑150 (MQ=255) aCGCTCAACGTCTCACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCg < 2:551542/150‑1 (MQ=255) cAACGTCTCACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGAc < 2:3901937/150‑1 (MQ=255) cAACGTCTCACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGAc < 2:2481702/150‑1 (MQ=255) aaCGTCTCACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGAcc > 1:1601375/1‑150 (MQ=255) aaCGTCTCACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGAcc > 2:1556889/1‑150 (MQ=255) aaCGTCTCACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGAcc > 1:1926164/1‑150 (MQ=255) ctcACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAg > 1:3465495/1‑150 (MQ=255) ctcACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGATCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAg > 1:997963/1‑150 (MQ=255) tcACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAgg > 2:3831917/1‑150 (MQ=255) tcACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAgg < 2:3982819/150‑1 (MQ=255) tcACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAgg > 2:4322590/1‑150 (MQ=255) tcACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAgg > 2:2216540/1‑150 (MQ=255) tcACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAgg > 2:1333917/1‑150 (MQ=255) cACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAggg < 2:3650079/150‑1 (MQ=255) cACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAggg < 1:4503065/150‑1 (MQ=255) aCGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTg < 1:4250030/127‑1 (MQ=255) aCGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAgggg > 2:314644/1‑150 (MQ=255) aCGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAgggg > 1:4082641/1‑150 (MQ=255) aCGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAgggg < 1:4800900/150‑1 (MQ=255) aCGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAgggg > 1:5264253/1‑150 (MQ=255) aCGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCGGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGACTGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGACCgggg > 2:1128833/1‑150 (MQ=255) tCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCg > 2:518461/1‑150 (MQ=255) cgccgcCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGt < 1:3216012/150‑1 (MQ=255) ccgccAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAg > 1:4590820/1‑150 (MQ=255) aGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCa > 2:2069455/1‑150 (MQ=255) aGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGGGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCa < 1:1128833/150‑1 (MQ=255) gcagcaTGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGttt > 1:2033499/1‑150 (MQ=255) gcaTGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTtcct < 2:2344703/150‑1 (MQ=255) caTGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTtcctc > 1:5454116/1‑150 (MQ=255) caTGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTtcctc < 2:3228617/150‑1 (MQ=255) caTGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTtcctc > 2:331614/1‑150 (MQ=255) ttGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAgcgc > 1:5607127/1‑150 (MQ=255) ttGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGcc < 2:3453363/98‑1 (MQ=255) ttGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGActgccg > 2:4626376/1‑150 (MQ=255) cccGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGActgccgctgcc < 2:710567/150‑1 (MQ=255) ccGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGActgccgctgcac > 1:1777262/1‑148 (MQ=255) cgcgcgCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGActgccgctgccgg > 2:504437/1‑149 (MQ=255) cgcgcgCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGACTGCCGCTGCCGt > 1:414539/1‑150 (MQ=255) 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> 1:3032930/1‑150 (MQ=255) cAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGACTGCCGCTGCCGTCAAATACATAATCGGTg < 1:3969443/150‑1 (MQ=255) aGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGACTGCCGCTGCCGTCAAATACATAATCGGTgg > 2:4426864/1‑150 (MQ=255) aGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGACTGCCGCTGCCGTCAAATACATAATCGGTgg < 2:3545985/150‑1 (MQ=255) gTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGACTGCCGCTGCCGTCAAATACATAATCGGTGGAATAg < 1:1081569/150‑1 (MQ=255) gTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGACTGCCGCTGCCGTCAAATACATAATCGGTGGAATAg < 2:5030410/150‑1 (MQ=255) tGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGACTGCCGCTGCCGTCAAATACATAATCGGTGGAATAGt < 2:1438680/150‑1 (MQ=255) tGCGCAGGACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGACTGCCGCTGCCGTCAAATACATAATCGGTGGAATAGt < 2:2478131/150‑1 (MQ=255) cgcAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGACTGCCGCTGCCGTCAAATACATAATCGGTGGAATAGTGa < 1:2383356/150‑1 (MQ=255) aCCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCTTCCCAGCGCTGACTGCCGCTGCCGTCAAATACATAATCGGTGGAATAGTGAATCAAc < 2:418397/150‑1 (MQ=255) ccACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGACTGCCGCTGCCGTCAAATACATAATCGGTGGAATAGTGAATCAAcc > 1:2987562/1‑150 (MQ=255) cACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGACTGCCGCTGCCGTCAAATACATAATCGGTGGAATAGTGAATCAACCa < 1:169366/150‑1 (MQ=255) cACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGACTGCCGCTGCCGTCAAATACATAATCGGTGGAATAGTGAATCAACCa < 1:1398216/150‑1 (MQ=255) cACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGACTGCCGCTGCCGTCAAATACATAATCGGTGGAATAGTGAATCAACCa < 1:1192043/150‑1 (MQ=255) ccTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGACTGCCGCTGCCGTCAAATACATAATCGGTGGAATAGTGAATCAACCAGgcgc < 1:1316336/150‑1 (MQ=255) ttGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCGTGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGACTGCCGCTGCCGTCAAATACATAATCGGTGGAATAGTGAATCAACCAGGCGccc > 2:929004/1‑150 (MQ=255) ttGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGACTGCCGCTGCCGTCAAATACATAATCGGTGGAATAGTGAATCAACCAGGCGccc > 1:2231127/1‑150 (MQ=255) gcgcCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGACTGCCGCTGCCGTCAAATACATAATCGGTGGAATAGTGAATCAACCAGGCGCCCaaa < 1:377395/150‑1 (MQ=255) cgcTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGACTGCCGCTGCCGTCAAATACATAATCGGTGGAATAGTGAATCAACCAGGCGCCCAAAgctg > 2:5163753/1‑150 (MQ=255) cgcTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGACTGCCGCTGCCGTCAAATACATAATCGGTGGAATAGTGAATCAACCAGGCGCCCAAAgctg > 1:1361208/1‑150 (MQ=255) gcTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGACTGCCGCTGCCGTCAAATACATAATCGGTGGAATAGTGAATCAACCAGGCGCCCAAAgctgc < 1:3955166/150‑1 (MQ=255) aggCGAGCATGCCATTCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGACTGCCGCTGCCGTCAAATACATAATCGGTGGAATAGTGAATCAACCAGGCGCCCAAAGctgctg > 2:4821950/2‑150 (MQ=255) gCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGACTGCCGCTGCCGTCAAATACATAATCGGTGGAATAGTGAATCAACCAGGCGCCCAAAGCTGCTGtt > 1:3134837/1‑150 (MQ=255) gaATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGACTGCCGCTGCCGTCAAATACATAATCGGTGGAATAGTGAATCAACCAGGCGCCCAAAGCTGCTGTTTCAc < 1:3167782/150‑1 (MQ=255) gaATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGACTGCCGCTGCCGTCAAATACATAATCGGTGGAATAGTGAATCAACCAGGCGCCCAAAGCTGCTGTTTCAc < 1:3580683/150‑1 (MQ=255) aTGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGACTGCCGCTGCCGTCAAATACATAATCGGTGGAATAGTGAATCAACCAGGCGCCCAAAGCTGCTGTTTCACGt > 1:5215914/1‑150 (MQ=255) aTGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGACTGCCGCTGCCGTCAAATACATAATCGGTGGAATAGTGAATCAACCAGGCGCCCAAAGCTGCTGTTTCACGt < 2:2373185/150‑1 (MQ=255) tgccATTCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGACTGCCGCTGCCGTCAAATACATAATCGGTGGAATAGTGAATCAACCAGGCGCCCAAAGCTGCTGTTTCACGTg > 1:4722800/4‑150 (MQ=255) tGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGACTGCCGCTGCCGTCAAATACATAATCGGTGGAATAGTGAATCAACCAGGCGCCCAAAGCTGCTGTTTCACGTg < 1:4322590/150‑1 (MQ=255) aTGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGACTGCCGCTGCCGTCAAATACATAATCGGTGGAATAGTGAATCAACCAGGCGCCCAAAGCTGCTGTTTCACGTGCTaa > 2:550093/1‑150 (MQ=255) gCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGACTGCCGCTGCCGTCAAATACATAATCGGTGGAATAGTGAATCAACCAGGCGCCCAAAGCTGCTGTTTCACGTGCTAATa < 1:3385786/150‑1 (MQ=255) | GGGTGCGCCAAATTGGTCTGCTACCACGCTCAACGTCTCACGCTCCGCCGCCAGGCGCAGCATGGTCTTGGCAAAATTGTGCCCGCGCGCAGCATACACCCAGCTGGTGCGCAGTACCACGGCCTTGGCGCCGCTGGCGAGAATGGCATGCTCGCCTTCCAGCTTGGTCCGGCCGTAGACCGAAAGGGGGCCGGTAGGCGCAGTTTCCTCCCAGCGCTGACTGCCGCTGCCGTCAAATACATAATCGGTGGAATAGTGAATCAACCAGGCGCCCAAAGCTGCTGTTTCACGTGCTAATA > NC_002947/2002814‑2003112 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |