| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,149,364 | C→A | 6.3% | L241M (CTG→ATG) | lpxK → | tetraacyldisaccharide 4'‑kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,149,364 | 0 | C | A | 6.3% | 800.8 / 30.4 | 237 | L241M (CTG→ATG) | lpxK | tetraacyldisaccharide 4'‑kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (118/104); new base A (3/12); total (121/116) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.56e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 239 total aligned reads displayed.
GCTTGCGTGAGGCTGACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGCCACTGCCGCTGGTCATG > NC_002947/2149218‑2149513 | gCTTGCGTGAGGCTGACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGc > 1:1112332/1‑150 (MQ=255)gCTTGCGTGAGGCTGACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGc < 1:4659143/150‑1 (MQ=255) gCGTGAGGCTGACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGc > 1:4807833/1‑150 (MQ=255) gTGAGGCTGACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCgg > 2:4183642/1‑150 (MQ=255) gAGGCTGACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACGGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCACCGGCCACCGCATGCAGGCGCTg < 2:3943244/150‑1 (MQ=255) ggCTGACGCGGTGCTGTTCATCGGCGCCAGAGAAGACCGCACCGTTGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCACCGTGCGCACGGGCGAGGGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCACCGCATGCAGGCGCTGGc < 2:150523/150‑1 (MQ=255) ggCTGACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCACCGGCCACCGCATGCAGGCGCTGGc < 2:244777/150‑1 (MQ=255) cTGACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCACCGCATGCAGGCGCTGGCCg < 2:4342892/150‑1 (MQ=255) tGACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCgg > 2:499048/1‑150 (MQ=255) gACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGt > 1:3781347/1‑150 (MQ=255) gACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGt > 1:5239753/1‑150 (MQ=255) gACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCACCGGCCACCGCATGCAGGCGCTGGCCggc < 1:3811195/150‑2 (MQ=255) cgcgGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGtgg < 2:979437/150‑3 (MQ=255) cgcgGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCACCGCATGCAGGCGCTGGCCggcgg < 1:3179646/150‑4 (MQ=255) gcgGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATc > 1:4129132/1‑150 (MQ=255) tGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCa < 1:1410947/150‑1 (MQ=255) gTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAAccc > 1:4390577/1‑150 (MQ=255) cttCGACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAAccc > 2:747697/2‑150 (MQ=255) aaCGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCTGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGAACATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCAGGTATCGGCAACCCGCaa > 2:5548799/1‑150 (MQ=255) aaCGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCaa > 2:2727561/1‑150 (MQ=255) aaCGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCaa < 2:5215226/150‑1 (MQ=255) aCGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAAc > 1:795963/1‑150 (MQ=255) ggCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGt < 1:1965190/150‑1 (MQ=255) 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cAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTttctt < 1:4197518/150‑1 (MQ=255) cAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTttctt < 2:2906634/150‑1 (MQ=255) cAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGGGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTttctt < 2:2915152/150‑1 (MQ=255) aGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTttcttc < 2:3285795/150‑1 (MQ=255) gCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCa > 2:4701469/1‑150 (MQ=255) cGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCaa < 2:68286/150‑1 (MQ=255) aaGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAaca > 1:3417013/1‑150 (MQ=255) cGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTggg > 1:4725672/1‑150 (MQ=255) tttcggtttcTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTaaa > 1:437057/1‑150 (MQ=255) ttcggtttcTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAAc < 1:3200093/150‑1 (MQ=255) ggtttcTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTgg < 2:3338526/150‑1 (MQ=255) gtttcTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGc < 2:2336532/150‑1 (MQ=255) tcTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGc > 2:2761514/1‑150 (MQ=255) tgcctgcAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATGTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCg < 1:1110029/150‑1 (MQ=255) ggcctgcAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCg < 1:2602177/149‑1 (MQ=255) cctgcAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCggg > 2:5280452/1‑149 (MQ=255) cctgcAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTGCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTGTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTCAACTGGCAGCCGGt > 2:5246470/1‑150 (MQ=255) tgcAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGc > 1:4467960/1‑150 (MQ=255) aGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGc < 1:4821532/150‑1 (MQ=255) aGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGc < 1:2770542/150‑1 (MQ=255) 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gcTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGc > 2:1081407/1‑150 (MQ=255) cTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGcc > 1:4858619/1‑150 (MQ=255) tCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCg > 1:4897286/1‑56 (MQ=255) tCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCg < 2:4897286/56‑1 (MQ=255) tCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCt < 2:1515867/150‑1 (MQ=255) tCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCt > 1:2221842/1‑150 (MQ=255) cGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCACCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCtt < 1:568157/150‑1 (MQ=255) gACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTc > 1:1614181/1‑150 (MQ=255) gACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTc < 2:1112171/150‑1 (MQ=255) gACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGACTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTc > 1:664860/1‑150 (MQ=255) aCCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCa < 1:4257245/150‑1 (MQ=255) cATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGc > 2:1840859/1‑150 (MQ=255) tCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGc < 2:213060/150‑1 (MQ=255) cccGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGCCa < 2:4073156/150‑1 (MQ=255) ccgccgGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCGACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGCCAc > 1:1796258/1‑150 (MQ=255) cgccgGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGCCACt > 2:3582319/1‑150 (MQ=255) gccgGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGCCACTg < 2:3737233/150‑1 (MQ=255) gccgGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGCCACTg < 2:795963/150‑1 (MQ=255) cgGCCACCGCATGCAGGCGCTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGCCACTGcc > 1:1342449/1‑150 (MQ=255) gCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGCCACTGCCGc > 1:5197779/1‑150 (MQ=255) cAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGCCACTGCCGCTg > 2:5079532/1‑150 (MQ=255) cAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGCCACTGCCGCTg > 1:4942298/1‑150 (MQ=255) aGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGTCCTTCAGCCCGCCACTGCCGCTgg > 2:3830415/1‑150 (MQ=255) gcgcCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGCCACTGCCGCTGGt < 1:1668988/150‑1 (MQ=255) gcCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGCCACTGCCGCTGGTCa > 2:1760414/1‑150 (MQ=255) gcCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGCCACTGCCGCTGGTCa > 1:2421407/1‑150 (MQ=255) ccTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGCCACTGCCGCTGGTCAt < 1:2198555/150‑1 (MQ=255) | GCTTGCGTGAGGCTGACGCGGTGCTGTTCAACGGCGCCAGCGAAGACCGCACCGATGGTTTCGGTTTCTGCCTGCAGCCGTCGGCCCTGGTCAACGTGCGCACTGGCGAGCGCCGTGCGCTCGACCATTTCCCCGCCGGCCAGCGCCTGCATGCGGTGGCCGGTATCGGCAACCCGCAACGTTTCTTCAACACCCTGCTGGGGCTAAACTGGCAGCCGGTGCCGCATCCCTTCGCCGACCATGCGCAGTTCAGTGCCCGGAGCCTGGCCTTCAGCCCGCCACTGCCGCTGGTCATG > NC_002947/2149218‑2149513 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |