| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,300,821 | T→G | 8.0% | intergenic (+75/+58) | PP_5496 → / ← PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,300,821 | 0 | T | G | 8.0% | 710.1 / 8.3 | 251 | intergenic (+75/+58) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (144/80); new base G (7/20); total (151/100) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.47e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 254 total aligned reads displayed.
CACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAAC > NC_002947/2300672‑2300966 | cacaGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGt < 1:1278917/150‑1 (MQ=255)cacaGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGt < 2:2561673/150‑1 (MQ=255) aGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGcc < 1:4489206/150‑1 (MQ=255) cacCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCtt < 2:1372770‑M2/150‑3 (MQ=255) cGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgc < 2:5279509‑M2/150‑6 (MQ=255) cGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgc < 1:4902423‑M2/150‑6 (MQ=255) gctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcctggtccgctgattaaacatcgggctgcacttgGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTcgcg > 1:1930146‑M1/78‑150 (MQ=255) gctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgGGTCCGTGTGGGCGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTcgcg > 1:1930173‑M1/78‑150 (MQ=255) gAGCAGGCCCCGCGCCAGCGCGCCCAGTGCCCGGCGGCCCGGAGGGGCACGCCCCCCCACTGATCGGGCGTGTGTGCGGTCCGGGTGGGAGCGGGCCTGCCCGCGAACACCGGCCGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCGTcgcg < 2:4558359/150‑1 (MQ=16) ctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacctgGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGACCACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCgg > 2:839886‑M1/77‑150 (MQ=255) ctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCgg > 1:3194493‑M1/77‑150 (MQ=255) ctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCgg > 1:3900007‑M1/77‑150 (MQ=255) aGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgg > 2:3568319‑M2/1‑143 (MQ=255) aGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgg < 1:5566491‑M2/150‑8 (MQ=255) gCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcggg > 2:3845321‑M2/1‑142 (MQ=255) aGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggca > 1:2354882‑M2/1‑140 (MQ=255) aGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTGCCTTGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggca > 1:1430142‑M2/1‑140 (MQ=255) gTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggcat < 2:3459051‑M2/150‑12 (MQ=255) gTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggcat > 2:3884430‑M2/1‑139 (MQ=255) gTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCgtcgcgggcat < 2:1019660‑M2/150‑12 (MQ=255) tACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggcctg < 2:1838199‑M2/150‑13 (MQ=255) tACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggcatg < 2:5439725‑M2/150‑13 (MQ=255) aCCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGGGCCCGCttcgcgggcatgc > 1:5013161‑M2/1‑137 (MQ=255) cTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggcatgccc < 2:4366228‑M2/150‑16 (MQ=255) aggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGccc > 1:4662508‑M1/69‑150 (MQ=255) aggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGccc > 1:2335013‑M1/69‑150 (MQ=255) ccAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCCCCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGGGCCCGCttcgcgggcatgcccgctcc > 1:2111914‑M2/1‑130 (MQ=255) agagCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggcatgcccgctccca > 2:3088681‑M2/1‑128 (MQ=255) agagCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggcatgcccgctccca < 2:2390617‑M2/150‑23 (MQ=255) gagCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggcatgcccgctcccac > 1:4138981‑M2/1‑127 (MQ=255) gagCGCCAATTTCCAGGCGGCCGTGAGTGGCAAGCACCACCACTGTTCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGGGCCCGCttcgcgggcatgcccgctcccac > 1:5198759‑M2/1‑127 (MQ=255) cAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCGAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGAc > 2:2593454/1‑150 (MQ=255) cAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCCTGCCCGCTCCCACACGGAc > 2:2097248/1‑150 (MQ=255) aTGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggcatgcccgctcccacacggacctcacaca > 2:514923‑M2/1‑113 (MQ=255) aTGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCGGCGCGGGCCGGCCCCCGCCCACACCGACCCaggggc > 1:4011958/1‑145 (MQ=37) cGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGc < 2:469217/150‑1 (MQ=255) caatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgGGTCCTTGTGGGAGCGGGCAGGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGAt > 2:5560726‑M1/39‑150 (MQ=255) cTGTGTGGCTTGCCCCACCACTGATGTGGCTTGTGTGTGGTCCTTGTGGTAGCGGGCATGCCCGCGAACCCCGGGCGAGCCGGGGCCATCCCCCGGGGGGCCCGCTTCGCGGGCAGGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGAt < 2:2336673/150‑1 (MQ=255) tgTGGCAAGCACCACCACTTATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGTGCGGGCAGGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGtt < 1:1253175/149‑1 (MQ=255) gCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTACAGCCCGATGTTTAAt < 2:2269639/150‑1 (MQ=255) aaGCACCACCACTGATGTGGCTTGTGTGCGGTCCTGGGGGGAGCGGGCAGGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCa < 1:2204877/150‑1 (MQ=37) gCACCACCCCTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGGGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGc < 2:1196028/150‑1 (MQ=255) ccaccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGa < 2:376163/150‑1 (MQ=255) cacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAAGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCAt > 2:548438/1‑150 (MQ=255) acTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCCTGCCCGCTCCCACACGGACCCAGGTGCAGCCCGAGGTTTAATCAGCGGACCATg > 2:5001412/1‑150 (MQ=255) gATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGGGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGAtt < 1:3285469/150‑1 (MQ=255) aTCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTg > 1:4185214/1‑150 (MQ=255) tGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATCCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCt < 1:3735206/150‑1 (MQ=255) ttgtgAGGTCCTTGTGGCCGCGGCCATCCCCGCCAACACCGGCAGACCCGGTCCAAACCACCGCGGTCCCCCCTTCGCGGCCATCCCCGCACCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACa < 1:100942/149‑1 (MQ=255) ttGGTCTTTGTGGGCGGGGGCTGGCCCGCCAACCCCGGCCGAGCCGGTGCCATCCCCCGGGGGGCCCGCTTCGCGGGCAGGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTc > 1:647054‑M1/3‑150 (MQ=255) gAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCGTCGCGGGCAGGCCCCCGCCCACACCGACCCAAGTGCAGCCCCATGTTTAATCAGCGGACCAAGATTGCCTTGAAAAGcac > 1:1132756/1‑148 (MQ=25) aGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTCCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTcc < 1:2264646/150‑1 (MQ=255) GTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCGTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAAGTGCCGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGa < 1:2748571‑M1/150‑1 (MQ=255) TCCTTGTGGGAGCGGGCAGGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGaa > 2:1961807‑M1/1‑150 (MQ=255) ggAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCCAGCCCCCGCCCAAACGGACCCAAGTGCAGCCCGATGTTTAAAAAGCCGACCAATATTTGCATTAACAGCTCCGAaaccacccc > 1:3823322/1‑149 (MQ=21) ggAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAgccagcca > 2:4618885/1‑150 (MQ=255) ggAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAgccagcca > 1:1824468/1‑150 (MQ=255) gAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCGTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCAc > 2:1923344/1‑150 (MQ=255) aGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCCGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGCTTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCAcc > 2:69705/1‑150 (MQ=255) cGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCCCACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTTCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCAcccc > 1:4420415/1‑150 (MQ=255) cGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGGGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCAcccc < 2:319836/150‑1 (MQ=255) gggCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCt < 1:1372770/150‑1 (MQ=255) ggCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTc > 1:4080135/1‑150 (MQ=255) cATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTcca < 1:5140947/150‑1 (MQ=255) aTGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcaggcatgcccgctcccacaaggacctcacacaagccagatcagtggtggtgcttgccactcagggccgcatggaaattggcgctctggcgcaggtac < 2:2756567‑M2/150‑103 (MQ=255) cccGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggcatgcccgctcccacaaggacctcacacaagcccgctcagtggtggggcttgccactcagggccgcatggaaattgtcgctctggcgcaggtactgc < 2:1486005‑M2/150‑106 (MQ=255) cccGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggcatgcccgctcccacaaggacctaacacaagccagctcattggtggtgcatgccacgaagggccgcatggaaattggcgcgctggcgcaggtactgc < 2:509159‑M2/150‑106 (MQ=255) ccGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggcctgcccgctcccacacggacctcacacaagccagatcagtggtggtgcttgccacgcagggccgcatggaaattggcgctctggcgcaggtactgct < 1:4997023‑M2/150‑107 (MQ=255) ccGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggcatgcccgctcccacacggacctcacacaagccagatcagtggtggtgcttgccactcagggccgcatggaaattggcgctctggcgcaggtactgct < 2:5595955‑M2/150‑107 (MQ=255) ccGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggcatgcccgctcccacaaggacctcacacaagccagatcagtggtggtgcttgccactcagggccgcctggaaattggcgctctggcgccggtactgct < 2:3808408‑M2/150‑107 (MQ=255) ccGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggcatgcccgctcccacaaggacctcacacaagccagatcagtggtggtgcttgccactcagggccgcatggaaattggcgctctggcgcaggtactgct < 1:4565755‑M2/150‑107 (MQ=255) ccGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCCTGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTccagccag > 2:1285363/1‑150 (MQ=255) ccGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTccagccag > 2:5150585/1‑150 (MQ=255) ccGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAAGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTccagccag > 2:2623463/1‑150 (MQ=255) ccGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCGTCGCGGGCCTGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTccagccag > 2:4280190/1‑150 (MQ=255) ggatggcacCGGCTCTGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCccgccagc > 1:2780553/7‑150 (MQ=39) cgcgAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCGTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCCATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCACCGAAGCCAGCCCCCCCACccgccagc > 1:1683510/1‑150 (MQ=38) gcgAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggcatgcccgctcccacaaggacctcacacaagccagataagtggtggtgcttgccactcagggccgcatggaaattggcgctctggcgcaggtactgctcg < 1:5041394‑M2/150‑109 (MQ=255) cgAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCCTGCCCGCGCCCACACGGCCCCATGTGCAGCCCGAGGTTTAATCAGCGGACCCTGGTTGGCGTGCACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTc > 1:2596098/1‑150 (MQ=37) tggcacCGGCTCTGCCGGTGTCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCGTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTcc > 2:3235837/4‑150 (MQ=39) gaccacCGGCAGAGCGGGTGCCAGCCACCGCGGGGCCCGCTTCGGGGGCAGGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTcc < 1:3369555/147‑1 (MQ=255) gAACACCGGCAGTGCGGGTGCCTTCCAGCGCGGTGCCCGCttcgcggtcatgacctctcccacactgacctcacacaagccagatcagtggtggtgcttgccaatcagggacgcatggaaattggcgctctggcgcaggtactgctcggt > 1:3057710‑M2/1‑40 (MQ=255) gcacCGGCTCTGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATTCCCGCTCCCACACCGACCCAAGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCCTGATTGCCGTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCACCTCCGc > 1:3888607/2‑150 (MQ=255) acCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCgtcgcgggcctgcccgctcccaccaggaccgcgcacaacccagataagtgggggtgcttgccacacagggccgcatggaaatttgcgctctggcgcaggtactgctcggtgtag < 1:4862358‑M2/150‑115 (MQ=255) acCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCCTGCCCCCGCCCACACGGCCCCATGTGCAGCCCGATGTTTATTCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCGCCCAAGCCCCCCACCCCACCAGCCAGCACCGcac > 1:1091806/1‑150 (MQ=38) acCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGGCCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATAATCGGACCATGATTGCCGTGAACCGCACCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCCGCTCCGcac > 1:1799305/1‑150 (MQ=38) acCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCACCAGCCAGCTCCGcac > 1:4632982/1‑150 (MQ=255) acCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCCCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCCGCCACCCCTCCAGCCCGCTCCGcac > 2:4056325/1‑150 (MQ=255) cGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCGGTgttcgcgggcatgcccgctcccacaaggacctcacacaagccagatcagtggtggtgcttgccactcagggccgcatggaaattggcgctctggcgcaggtactgctcggtgtagc < 2:2879147‑M2/150‑117 (MQ=255) cGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCacac > 2:4459044/1‑150 (MQ=255) gagCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggcatgcccgctcccacaaggacctcacacaagccagatcagtggtggtgcttgccactcagggccgcatggaaattggcgctctggcgcaggtactgctcggtgtagctgtggg < 2:2167140‑M2/150‑122 (MQ=255) ccGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCCTGCCCGCTCCCACACGGTCCCCTGTGCAGCCCCCTGGTTAATCCGCGGACCATGCTTGCCGTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCCCCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATaa > 2:669982/1‑150 (MQ=255) ccGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCCTGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGCGGTTTAATCAGCGGACCCGGCTTGCCGTGAACAGCTCCGCAGCCAGCCCCCCCGCCCGCCACCGCCGCCCCCGCggcgaa > 2:2120861/1‑146 (MQ=255) ggTGCCACCCCCCGCGGGGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAgc < 1:3485048/150‑1 (MQ=255) aTCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTc > 2:1033572/1‑150 (MQ=255) aTCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTc > 1:5617336/1‑150 (MQ=255) tCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCg < 1:2097248/150‑1 (MQ=255) ccACCGCGGGGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCTCCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCgg < 2:2707251/150‑1 (MQ=255) cACCGCGGTGCCCGCTGCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGc < 1:5439725/150‑1 (MQ=255) ggggTGCCCGGTTGGCGGGCTTGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGTTGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAAc < 2:1718122/148‑1 (MQ=255) | CACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAAC > NC_002947/2300672‑2300966 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |