| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,384,391 | C→A | 100% | Q227K (CAA→AAA) | cmpX → | protein CmpX |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,384,391 | 0 | C | A | 100.0% | 779.3 / ‑6.8 | 218 | Q227K (CAA→AAA) | cmpX | protein CmpX |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); major base A (105/109); minor base T (0/2); total (106/112) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 221 total aligned reads displayed.
CAGCTTGAAGTGAAAACCGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGGTGTCACTGGCTAACCGCGAGCTGCTTGAACAGCGCGTCAATAGCCGCTAA > NC_002947/2384244‑2384537 | cagcTTGAAGTGAAAACCGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACaaa < 2:4155822/150‑1 (MQ=255) gcTTGAAGTGAAAACCGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGt > 2:234162/1‑150 (MQ=255) ttGAAGTGAAAACCGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCg > 2:4303175/1‑150 (MQ=255) gAAGTGAAAACCGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGc < 1:2134565/150‑1 (MQ=255) aGTGAAAACCGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCca < 2:3333378/150‑1 (MQ=255) aaaaCCGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCcagcag > 1:3690268/1‑150 (MQ=255) aaaaCCGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCcagcag < 1:3859449/150‑1 (MQ=255) aaaaCCGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCcagcag < 1:5107490/150‑1 (MQ=255) aaCCGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGt > 2:1277555/1‑150 (MQ=255) ccGTCCTGCTGTACCTCGTCATCGTTATCGGGCTGATTACGGTTGGTCTGGCCGTTGGCTTGGCCTTGGGCCTTGGCAGTCGCGATTTTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGc < 2:4639713/150‑1 (MQ=255) ccGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGc < 2:637516/150‑1 (MQ=255) cGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCg > 2:868223/1‑150 (MQ=255) aCCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCTAGCAGGTGCGGa > 1:4253937/1‑150 (MQ=255) tgctgAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTg < 1:1518388/150‑1 (MQ=255) gctgAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTgg > 1:1633989/1‑150 (MQ=255) gctgAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTgg < 2:1059582/150‑1 (MQ=255) ctgAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGga < 2:3824826/150‑1 (MQ=255) ctgAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGga < 1:4340455/150‑1 (MQ=255) aaCCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCAGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGagag < 2:1499590/150‑1 (MQ=255) ccACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGt > 2:605174/1‑150 (MQ=255) aCGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCg > 1:1399436/1‑150 (MQ=255) aacGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAggg < 2:1631907/148‑1 (MQ=255) aTCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAggg > 1:1595296/1‑150 (MQ=255) tCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGc > 2:1080957/1‑150 (MQ=255) tCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGACCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGc > 2:3770496/1‑150 (MQ=255) tCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCg > 1:197402/1‑150 (MQ=255) gggCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATTTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCgag < 1:2751428/150‑1 (MQ=255) gggCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCgag < 2:5523653/150‑1 (MQ=255) ggCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCgagg > 2:1964927/1‑150 (MQ=255) gCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCgagga < 2:1317255/150‑1 (MQ=255) gCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCgagga < 1:2366913/150‑1 (MQ=255) gCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCgagga < 2:3555389/150‑1 (MQ=255) gCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTACCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACTAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCgagga < 2:2153816/150‑1 (MQ=255) tGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGgaga > 2:81845/1‑150 (MQ=255) aTTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATc < 2:5102661/150‑1 (MQ=255) gTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTa > 1:2836283/1‑148 (MQ=255) gTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGa < 1:1807652/150‑1 (MQ=255) tCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGaa < 1:3617876/150‑1 (MQ=255) cTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAg > 2:1850957/1‑150 (MQ=255) tGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAga < 2:3949771/150‑1 (MQ=255) cGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAgacgac > 2:3071784/1‑150 (MQ=255) gTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGacgacg > 1:564077/1‑150 (MQ=255) ccTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACgctgc > 2:1969606/1‑150 (MQ=255) ttGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGctgctg > 1:4848560/1‑150 (MQ=255) ttGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGctgctg > 1:2553079/1‑150 (MQ=255) ggCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGGCGACGCTGCTGAc > 2:2416420/1‑150 (MQ=255) ggCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGAc < 1:352551/150‑1 (MQ=255) ggCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAAGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGAc < 1:645709/150‑1 (MQ=255) 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tGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGa > 2:2626921/1‑150 (MQ=255) ggCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGaa < 2:281979/150‑1 (MQ=255) gCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGacgacg < 1:4726310/128‑1 (MQ=255) gCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGacgacg > 2:4726310/1‑128 (MQ=255) gCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAAc > 1:4649611/1‑150 (MQ=255) ctgTCGCGAAATTGCCGGGCTGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGCCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGTCGCTGCTGACCGATGATGGCGAACt < 1:69644/148‑1 (MQ=255) aGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTg > 2:2019/1‑150 (MQ=255) aGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTg < 2:2198294/150‑1 (MQ=255) tCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGgt < 2:5293473/150‑1 (MQ=255) tCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGgt < 2:2242533/150‑1 (MQ=255) gcgAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGgtgt > 1:2448518/1‑150 (MQ=255) gcgAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGgtgt > 2:4206844/1‑150 (MQ=255) gcgAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGgtgt < 1:2520723/150‑1 (MQ=255) gcgAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGgtgt > 1:2043280/1‑150 (MQ=255) gcgAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGAGTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGgtgt > 2:3761121/1‑150 (MQ=255) gAAATTGCCGGGCAGATCCAGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGGTGTCa > 2:157719/1‑150 (MQ=255) ccGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGGTGTCACTGGCTa > 1:5355511/1‑150 (MQ=255) cGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGGTGTCACTGGCTaa > 1:996438/1‑150 (MQ=255) aGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGGTGTCACTGGCTAACcgcg > 1:3111524/1‑150 (MQ=255) gATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGGTGTCACTGGCTAACCGCGa < 2:4824352/150‑1 (MQ=255) gATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGGTGTCACTGGCTAACCGCGa < 2:2596306/150‑1 (MQ=255) tCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGGTGTCACTGGCTAACCGCGAgc < 1:3434584/150‑1 (MQ=255) tCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGGTGTCACTGGCTAACCGCGAgc > 2:235737/1‑150 (MQ=255) tGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGGTGTCACTGGCTAACCGCGAgctgc < 2:5015871/150‑1 (MQ=255) ggCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGGTGTCACTGGCTAACCGCGAgctgct < 2:3690268/150‑1 (MQ=255) gCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACgctgct > 1:4505845/1‑104 (MQ=255) gCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACgctgct < 2:4505845/104‑1 (MQ=255) gCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGGTGTCACTGGCTAACCGCGAGCTGCtt < 2:4351099/150‑1 (MQ=255) ccGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGGTGTCACTGGCTAACCGCGAGCTGCTTg < 2:1032147/150‑1 (MQ=255) ggCATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGGTGTCACTGGCTAACCGCGAGCTGCTTGaa > 2:3246486/1‑150 (MQ=255) cATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGaa < 2:5454461/87‑1 (MQ=255) cATCTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGGTGTCACTGGCTAACCGCGAGCTGCTTGAACa < 1:1121572/150‑1 (MQ=255) cTACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGGTGTCACTGGCTAACCGCGAGCTGCTTGAACAgcg > 1:4717047/1‑150 (MQ=255) tACGTGCGCGAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGGTGTCACTGGCTAACCGCGAGCTGCTTGAACAgcgc < 1:1037902/150‑1 (MQ=255) gcgAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGGTGTCACTGGCTAACCGCGAGCTGCTTGAACAGCGCGTCAATa > 2:5222697/1‑150 (MQ=255) gcgAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGGTGTCACTGGCTAACCGCGAGCTGCTTGAACAGCGCGTCAATa > 2:1034134/1‑150 (MQ=255) gAGCTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGGTGTCACTGGCTAACCGCGAGCTGCTTGAACAGCGCGTCAATAGc < 1:1042987/150‑1 (MQ=255) cTGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGGTGTCACTGGCTAACCGCGAGCTGCTTGAACAGCGCGTCAATAGCCGc < 2:2963143/150‑1 (MQ=255) tGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGGTGTCACTGGCTAACCGCGAGCTGCTTGAACAGCGCGTCaa < 2:1831240/142‑1 (MQ=255) tGTACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGGTGTCACTGGCTAACCGCGAGCTGCTTGAACAGCGCGTCaa > 1:1831240/1‑142 (MQ=255) tACAAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGGTGTCACTGGCTAACCGCGAGCTGCTTGAACAGCGCGTCAATAGCCGCTaa > 1:3323301/1‑150 (MQ=255) | CAGCTTGAAGTGAAAACCGACCTGCTGAACCACGTCATCGTTATCGGGCTGATTACCGTTGGTCTGGCCGTTGCCTTGGCCATGGGCCTTGGCAGTCGCGAAATTGCCGGGCAGATCCTGGCCGGCATCTACGTGCGCGAGCTGTACCAAGTCGGCCAGCAGGTGCGGATTGGAGAGGTCGAAGGGCATATCGAGGAGATCGGTACGGTGAAGACGACGCTGCTGACCGATGATGGCGAACTGGTGTCACTGGCTAACCGCGAGCTGCTTGAACAGCGCGTCAATAGCCGCTAA > NC_002947/2384244‑2384537 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |