| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_002947 | 2,426,560 | G→A | 5.1% | G127R (GGG→AGG) | moaB‑I → | molybdenum cofactor biosynthesis protein B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 2,426,560 | 0 | G | A | 5.1% | 805.2 / 20.9 | 260 | G127R (GGG→AGG) | moaB‑I | molybdenum cofactor biosynthesis protein B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (121/123); new base A (5/8); total (129/131) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.72e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.55e-01 | |||||||||||
Only 100 of 265 total aligned reads displayed.
CCGGCGGTACCGGGTTTACTGGTCGCGACAGCACCCCCGAGGCGGTGGCCTGCCTGCTGGACAAGCAAGTAGACGGCTTTGGTGAGCTGTTCCGGCAGATTTCCGTGGCCGACATTGGCACCTCCACCGTGCAGTCGCGTGCC‑TTGGCCGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACCAACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTGGCGCACCTGAAGCAGGCAGCGGCCTGTGA > NC_002947/2426411‑2426708 | ccGGCGGTACCGGGTTTACTGGTCGCGACAGCACCCCCGAGGCGGTGGCCTGCCTGCTGGACAAGCAAGTAGACGGCTTTGGTGAGCTGTTCCGGCAGATTTCCGTGGCCGACATTGGCACCTCCACCGTGCAGTCGCGTGCC‑TTGGCCg > 2:4503890/1‑150 (MQ=255) cggcggTACCGGGTTTACTGGTCGCGACAGCACCCCCGAGGCGGTGGCCTGCCTGCTGGACAAGCAAGTAGACGGCTTTGGTGAGCTGTTCCGGCAGATTTCCGTGGCCGACATTGGCACCTCCACCGTGCAGTCGCGTGCC‑TTGGCCgg > 1:156669/1‑150 (MQ=255) cggcggTACCGGGTTTACTGGTCGCGACAGCACCCCCGAGGCGGTGGCCTGCCTGCTGGACAAGCAAGTAGACGGCTTTGGTGAGCTGTTCCGGCAGATTTCCGTGGCCGACATTGGCACCTCCACCGTGCAGTCGCGTGCC‑TTGGCCgg > 2:2160344/1‑150 (MQ=255) 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gTTTACTGGTCGCGACAGCTCCCCCGAGGCGGTGGCCTGCCTGCTGGACAAGCAAGTAGACGGCTTTGGTGAGCTGTTCCGGCTGATTTCCGTGGCCGACATTGGCACCTCCACCGTGCAGTCGCGTGCCGTTGGCCAGCCCGGCCaagg < 1:2772426/150‑3 (MQ=255) tttACTGGTCGCGACAGCACCCCCGAGGCGGTGGCCTGCCTGCTGGACAAGCAAGTAGACGGCTTTGGTGAGCTGTTCCGGCAGATTTCCGTGGCCGACATTGGCACCTCCACCGTGCAGTCGCGTGCG‑TTGGCCAGCCCGGCCaaggca < 1:591403/150‑5 (MQ=255) tttACTGGTCGCGACAGCACCCCCGAGGCGGTGGCCTGCCTGCTGGACAAGCAAGTAGACGGCTTTGGTGAGCTGTTCCGGCAGATTTCCGTGGCCGACATTGGCACCTCCACCGTGCAGTCGCGTGCG‑TTGGCCAGCCCGGCCaaggca > 2:4576048/1‑146 (MQ=255) tttACTGGTCGCGACAGCACCCCCGAGGCGGTGGCCTGCCTGCTGGACAAGCAAGTAGACGGCTTTGGTGAGCTGTTCCGGCAGATTTCCGTGGCCGACATTGGCACCTCCACCGTGCAGTCGCGTGCCGTTGGCCAGCCCGGCCaaggc < 1:830112/150‑4 (MQ=255) tttACTGGTCGCGACAGCACCCCCGAGGCGGTGGCCTGCCTGCTGGACAAGCAAGTAGACGGCTTTGGTGAGCTGTTCCGGCAGATTTCCGTGGCCGACATTGGCACCTCCACCGTGCAGTCGCGTGCC‑TTGGCCGGGCTGGCCAACGGc > 2:2481759/1‑150 (MQ=255) 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tCCACCGTGCAGTCGCGTGCC‑TTGGCCGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACCAACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTGgcg > 2:2315581/1‑150 (MQ=255) ccACCGTGCAGTCGCGTGCC‑TTGGCCGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACCAACGCTGTGCGGACCGGTTGGGGTGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTAGTGgcgc > 1:876350/1‑150 (MQ=255) ccACCGTGCAGTCGCGTGCC‑TTGGCCGGGCTGGCCAACGGCACGCAGGTGTGCTGCCAGCCAGGCTCCACCAACGCTGTGCGTACCGGGTGGGATGGGCTCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATAGCCCTTGCAACTTCGTGgcgc > 1:1947797/1‑150 (MQ=255) aCCGTGCAGTCGCGTGCC‑TTGGCCGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACCAACGCTGTGCGTACCGGGTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCGCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTGGCGCAc > 2:5129184/1‑150 (MQ=255) gTGCAGTCGCGTGCC‑TTGGCCGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACCAACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTGGCGCACCTg < 1:2401008/150‑1 (MQ=255) accagcgTGCCGTTGGCCAGCCCGGCCAA‑GGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACCAACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATgg > 2:2880546/5‑88 (MQ=21) aGTCGCGTGCC‑TTGGCCGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACCAACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTGGCGCACCTGAAgc < 2:3366786/150‑1 (MQ=255) cgcgTGCC‑TTGGCCGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACCAACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTGGCGCACCTGAAgcagg < 1:3268225/150‑1 (MQ=255) tgccgttGGCCAGCCCGGCCAA‑GGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACCAACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTGGCGCACCTGAAGCAGGCAGc > 2:4773943/6‑150 (MQ=255) gCC‑TTGGCCGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACCAACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTGGCGCACCTGAAGCAGGCAGCg < 1:579560/150‑1 (MQ=255) cc‑TTGGCCGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACCAACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTGGCGCACCTGAAGCAGGCAGCgg > 1:1502931/1‑150 (MQ=255) gCCGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACCAACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTGGCGCACCTGAAGCAGGCAGCGGCCtgt < 1:4748245/150‑1 (MQ=255) gCCGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACCAACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTGGCGCACCTGAAGCAGGCAGCGGCCtgt < 2:1859346/150‑1 (MQ=255) ccGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACCAACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTGGCGCACCTGAAGCAGGCAGCGGCCtgtg > 2:3925433/1‑150 (MQ=255) ccGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACCAACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTGGCGCACCTGAAGCAGGCAGCGGCCtgtg > 2:724995/1‑150 (MQ=255) cGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACCAACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGccc < 2:4003324/98‑1 (MQ=255) cGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACCAACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGccc > 1:4003324/1‑98 (MQ=255) | CCGGCGGTACCGGGTTTACTGGTCGCGACAGCACCCCCGAGGCGGTGGCCTGCCTGCTGGACAAGCAAGTAGACGGCTTTGGTGAGCTGTTCCGGCAGATTTCCGTGGCCGACATTGGCACCTCCACCGTGCAGTCGCGTGCC‑TTGGCCGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACCAACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTGGCGCACCTGAAGCAGGCAGCGGCCTGTGA > NC_002947/2426411‑2426708 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |